Missing coverage evidence...
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ACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATAC  >  minE/154503‑154563                                                             | aCGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATAc  <  1:420213/61‑1 (MQ=255) aCGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATAc  <  1:1071730/61‑1 (MQ=255) aCGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATAc  <  1:1674408/61‑1 (MQ=255) aCGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATAc  <  1:1695436/61‑1 (MQ=255) aCGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATAc  <  1:1714739/61‑1 (MQ=255) aCGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATAc  <  1:1816063/61‑1 (MQ=255) aCGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATAc  <  1:1836837/61‑1 (MQ=255) aCGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATAc  <  1:1839263/61‑1 (MQ=255) aCGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATAc  <  1:242014/61‑1 (MQ=255) aCGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATAc  <  1:417363/61‑1 (MQ=255) aCGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATAc  <  1:1668587/61‑1 (MQ=255) aCGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATAc  <  1:512161/61‑1 (MQ=255) aCGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATAc  <  1:521283/61‑1 (MQ=255) aCGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATAc  <  1:586130/61‑1 (MQ=255) aCGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATAc  <  1:673332/61‑1 (MQ=255) aCGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATAc  <  1:673793/61‑1 (MQ=255) aCGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATAc  <  1:688238/61‑1 (MQ=255) aCGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATAc  <  1:797722/61‑1 (MQ=255) aCGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATAc  <  1:823300/61‑1 (MQ=255) aCGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATAc  <  1:883998/61‑1 (MQ=255) aCGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATAc  <  1:1408001/61‑1 (MQ=255) aCGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATAc  <  1:1079082/61‑1 (MQ=255) aCGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATAc  <  1:1129747/61‑1 (MQ=255) aCGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATAc  <  1:1149405/61‑1 (MQ=255) aCGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATAc  <  1:118850/61‑1 (MQ=255) aCGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATAc  <  1:1270284/61‑1 (MQ=255) aCGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATAc  <  1:1278684/61‑1 (MQ=255) aCGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATAc  <  1:1320525/61‑1 (MQ=255) aCGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATAc  <  1:1356199/61‑1 (MQ=255) aCGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATAc  <  1:1361126/61‑1 (MQ=255) aCGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATAc  <  1:1405922/61‑1 (MQ=255) aCGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATAc  <  1:1639912/61‑1 (MQ=255) aCGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATAc  <  1:1430243/61‑1 (MQ=255) aCGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATAc  <  1:1432953/61‑1 (MQ=255) aCGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATAc  <  1:144896/61‑1 (MQ=255) aCGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATAc  <  1:1529229/61‑1 (MQ=255) aCGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATAc  <  1:1582351/61‑1 (MQ=255) aCGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATAc  <  1:1596257/61‑1 (MQ=255) aCGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATAc  <  1:1623283/61‑1 (MQ=255)  cgcgCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATAc  <  1:1831587/60‑1 (MQ=255)                          tattatCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATAc  <  1:221943/36‑1 (MQ=255)                                                             | ACGCGCCGCTGGCGGGTATTTTGTTTATTATCGAAGAGATGCGTCCGCAGTTTCGCTATAC  >  minE/154503‑154563

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑