Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1805400	1805550	151	88 [0]	[0] 54	emrA	multidrug efflux system

CACCAATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTC  >  minE/1805338‑1805399                                                              | caccaATATGTGGGTGTATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:1284494/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTATAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:1777483/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGTGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:1669916/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:386031/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:497554/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:485024/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:461458/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:449139/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:43979/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:433199/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:425190/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:415738/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:412044/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:556611/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:365354/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:361552/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:309149/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:284382/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:259185/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:228712/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:21997/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:1029970/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:76804/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:982835/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:939890/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:925838/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:911620/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:876216/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:823388/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:798493/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:796982/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:784440/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:782441/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:522304/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:744011/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:742102/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:708029/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:705930/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:703817/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:641743/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:637491/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:629355/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:219347/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:1320295/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:153126/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:1527460/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:192782/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:1471506/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:1451463/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:1432120/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:1428393/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:1425263/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:1374243/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:1490929/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:1311957/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:1304444/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:1265452/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:1255894/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:1249376/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:1228498/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:11393/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:1034520/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:1033460/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:1751610/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:1897619/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:1857183/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:1826222/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:1802451/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:1790599/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:1783405/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:1781875/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:1773029/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:1546852/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:171743/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:1709353/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:1707158/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:1642888/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:1560/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:1551347/62‑1 (MQ=255) caccaATATGTGGGTGGACGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:73703/62‑1 (MQ=255)  accaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:1383301/61‑1 (MQ=255)  accaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:766564/61‑1 (MQ=255)  accaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:1793552/61‑1 (MQ=255)  accaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:831854/61‑1 (MQ=255)   ccaATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:879793/60‑1 (MQ=255)           tgggtggATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:1644020/52‑1 (MQ=255)                    gCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:271179/43‑1 (MQ=255)                      cAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTc  <  1:1392553/41‑1 (MQ=255)                                                              | CACCAATATGTGGGTGGATGCCAACTTTAAAGAGACGCAGATTGCCAATATGCGTATCGGTC  >  minE/1805338‑1805399

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑