Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 1837172 1837174 3 185 [0] [0] 63 rpoS/nlpD RNA polymerase, sigma S (sigma 38) factor/predicted outer membrane lipoprotein

Only 100 of 185 total aligned reads displayed.

TGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTC  >  minE/1837111‑1837171
                                                            |
ttggTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:291561/59‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTTCTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:494931/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCTTCAAATTc  <  1:1166329/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:355923/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:526850/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:510738/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:486560/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:473738/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:454527/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:424628/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:414517/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:403302/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:394002/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:373874/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:560180/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:337315/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:331044/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:299222/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:269347/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:215412/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:198577/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:198402/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:1856310/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:1000729/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:181248/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:779059/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:985197/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:94819/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:900809/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:898567/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:887049/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:863557/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:859230/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:854401/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:831977/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:819220/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:799925/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:1829069/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:755817/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:720033/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:692275/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:658689/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:634432/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:632028/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:622150/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:607006/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:584052/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:567289/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:1118120/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:1767894/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:1294734/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:1280781/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:1267991/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:1245907/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:1235695/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:1228434/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:1223491/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:1208539/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:1148229/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:1144335/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:1143243/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:132569/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:1106653/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:1102730/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:1102088/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:1093545/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:1076412/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:1076317/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:1066482/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:1037989/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:1037187/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:1012570/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:1001801/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:1500795/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:1755784/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:1732111/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:1714741/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:1691595/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:1682802/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:1665692/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:165076/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:16321/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:1612721/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:1587191/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:1549452/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:1506491/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:1494807/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:1487998/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:144000/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:1432776/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:141734/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:1390739/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:1359340/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:1355070/61‑1 (MQ=255)
tGGGTTACAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:516330/61‑1 (MQ=255)
 gggTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:659927/60‑1 (MQ=255)
 gggTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:425952/60‑1 (MQ=255)
    ttCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:1880737/57‑1 (MQ=255)
                     ccTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTc  <  1:708108/40‑1 (MQ=255)
                        tttCTTCAAAAACCTCAACTGCGTTCTCATCAAATTc  <  1:1336785/37‑1 (MQ=38)
                                                            |
TGGGTTCCAATTCTACTAAGGCCTTTTCGTCAAAAACCTCAACTCCGTTCTCATCAAATTC  >  minE/1837111‑1837171

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑