Missing coverage evidence...
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ACGGCTCATAGAACCAGTTTTGATCTGGCCTGCAGCAGTACCAACAGCCAGGTCAGCGATGG  >  minE/1876227‑1876288                                                              | aCGGCTCATAGAACCAGTTTTGATCTGGCCTGCAGCAGTACCAACAGCCAGGTCATCGATgg  <  1:733250/62‑1 (MQ=255) aCGGCTCATAGAACCAGTTTTGATCTGGCCTGCAGCAGTACCAACAGCCAGGTCAGCGATgg  <  1:41155/62‑1 (MQ=255) aCGGCTCATAGAACCAGTTTTGATCTGGCCTGCAGCAGTACCAACAGCCAGGTCAGCGATgg  <  1:985982/62‑1 (MQ=255) aCGGCTCATAGAACCAGTTTTGATCTGGCCTGCAGCAGTACCAACAGCCAGGTCAGCGATgg  <  1:979834/62‑1 (MQ=255) aCGGCTCATAGAACCAGTTTTGATCTGGCCTGCAGCAGTACCAACAGCCAGGTCAGCGATgg  <  1:764057/62‑1 (MQ=255) aCGGCTCATAGAACCAGTTTTGATCTGGCCTGCAGCAGTACCAACAGCCAGGTCAGCGATgg  <  1:680355/62‑1 (MQ=255) aCGGCTCATAGAACCAGTTTTGATCTGGCCTGCAGCAGTACCAACAGCCAGGTCAGCGATgg  <  1:647414/62‑1 (MQ=255) aCGGCTCATAGAACCAGTTTTGATCTGGCCTGCAGCAGTACCAACAGCCAGGTCAGCGATgg  <  1:627179/62‑1 (MQ=255) aCGGCTCATAGAACCAGTTTTGATCTGGCCTGCAGCAGTACCAACAGCCAGGTCAGCGATgg  <  1:60581/62‑1 (MQ=255) aCGGCTCATAGAACCAGTTTTGATCTGGCCTGCAGCAGTACCAACAGCCAGGTCAGCGATgg  <  1:517469/62‑1 (MQ=255) aCGGCTCATAGAACCAGTTTTGATCTGGCCTGCAGCAGTACCAACAGCCAGGTCAGCGATgg  <  1:51495/62‑1 (MQ=255) aCGGCTCATAGAACCAGTTTTGATCTGGCCTGCAGCAGTACCAACAGCCAGGTCAGCGATgg  <  1:49643/62‑1 (MQ=255) aCGGCTCATAGAACCAGTTTTGATCTGGCCTGCAGCAGTACCAACAGCCAGGTCAGCGATgg  <  1:1208412/62‑1 (MQ=255) aCGGCTCATAGAACCAGTTTTGATCTGGCCTGCAGCAGTACCAACAGCCAGGTCAGCGATgg  <  1:408844/62‑1 (MQ=255) aCGGCTCATAGAACCAGTTTTGATCTGGCCTGCAGCAGTACCAACAGCCAGGTCAGCGATgg  <  1:200176/62‑1 (MQ=255) aCGGCTCATAGAACCAGTTTTGATCTGGCCTGCAGCAGTACCAACAGCCAGGTCAGCGATgg  <  1:1837848/62‑1 (MQ=255) aCGGCTCATAGAACCAGTTTTGATCTGGCCTGCAGCAGTACCAACAGCCAGGTCAGCGATgg  <  1:1781993/62‑1 (MQ=255) aCGGCTCATAGAACCAGTTTTGATCTGGCCTGCAGCAGTACCAACAGCCAGGTCAGCGATgg  <  1:1559954/62‑1 (MQ=255) aCGGCTCATAGAACCAGTTTTGATCTGGCCTGCAGCAGTACCAACAGCCAGGTCAGCGATgg  <  1:1407030/62‑1 (MQ=255) aCGGCTCATAGAACCAGTTTTGATCTGGCCTGCAGCAGTACCAACAGCCAGGTCAGCGATgg  <  1:1404057/62‑1 (MQ=255) aCGGCTCATAGAACCAGTTTTGATCTGGCCTGCAGCAGTACCAACAGCCAGGTCAGCGATgg  <  1:1371309/62‑1 (MQ=255) aCGGCTCATAGAACCAGTTTTGATCTGGCCTGCAGCAGTACCAACAGCCAGGTCAGCGATgg  <  1:1357383/62‑1 (MQ=255) aCGGCTCATAGAACCAGTTTTGATCTGGCCTGCAGCAGTACCAACAGCCAGGTCAGCGATgg  <  1:1262627/62‑1 (MQ=255) aCGGCTCATAGAACCAGTTTTGATCTGGCCTGCAGCAGTACCAACAGCCAGGTCAGCGATgg  <  1:1213672/62‑1 (MQ=255)  cGGCTCATAGAACCAGTTTTGATCTGGCCTGCAGCAGTACCAACAGCCAGGTCAGCGATgg  <  1:426090/61‑1 (MQ=255)      tCATAGAACCAGTTTTGATCTGGCCTGCAGCAGTACCAACAGCCAGGTCAGCGATgg  <  1:1364248/57‑1 (MQ=255)                                                              | ACGGCTCATAGAACCAGTTTTGATCTGGCCTGCAGCAGTACCAACAGCCAGGTCAGCGATGG  >  minE/1876227‑1876288

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑