Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1880491	1880836	346	91 [0]	[0] 15	[chpA]–chpR	[chpA],chpR

CACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGA  >  minE/1880429‑1880490                                                              | cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:379679/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:594078/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:58898/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:579679/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:55669/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:526876/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:469181/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:469113/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:466807/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:45817/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:435517/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:435126/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:604212/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:374566/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:356959/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:356554/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:336262/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:282488/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:271662/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:242685/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:23525/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:22647/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:207937/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:747762/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:981230/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:969374/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:95732/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:921983/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:917963/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:902913/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:883747/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:8433/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:809324/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:750491/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:193856/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:729975/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:726284/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:668054/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:655644/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:65388/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:647292/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:629897/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:615394/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:614622/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:607412/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:1306996/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:1020895/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:1403892/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:1401839/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:1397786/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:1384714/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:1370727/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:1368337/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:1348108/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:1319644/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:1308754/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:1461351/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:1303063/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:1289428/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:1224097/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:1220262/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:1198885/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:117597/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:1174370/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:1166110/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:1067781/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:1029788/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:1726300/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:1892680/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:1864886/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:1850449/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:1848919/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:1844913/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:1746348/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:1732323/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:1730236/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:1479449/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:1693978/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:1681358/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:1677454/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:1666777/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:1657385/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:1656498/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:1522647/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:1517870/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:1490944/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:1487753/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGCACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:127929/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACCGGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:1262552/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACATGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:558227/1‑62 (MQ=255) cacacaGACACATACATGATTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGa  >  1:1833554/1‑62 (MQ=255)                                                              | CACACAGACACATACCTGTTTTGTTGTTGTACATGAAAGGACTCAGGACAACAGCTGGACGA  >  minE/1880429‑1880490

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑