Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 1895301 1895374 74 182 [0] [0] 13 amiC N‑acetylmuramoyl‑L‑alanine amidase

Only 100 of 182 total aligned reads displayed.

GGTAAAGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAC  >  minE/1895238‑1895300
                                                              |
ggTAAAGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:567234/62‑1 (MQ=255)
   aaaGTCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:163679/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGTCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:779605/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGGTAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:557742/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:313110/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:528531/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:474814/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:47018/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:467681/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:410704/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:35804/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:355187/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:346382/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:31665/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:580463/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:281253/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:274680/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:264985/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:248820/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:237482/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:1002814/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:193517/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:1860628/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:1821499/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:748062/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:979998/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:926848/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:896235/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:87960/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:869913/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:854265/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:825509/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:817515/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:79562/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:761274/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:198570/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:725290/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:720024/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:714979/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:707942/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:701606/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:665087/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:64268/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:624406/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:587150/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:581053/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:1254013/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:1456537/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:142154/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:1399424/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:1367481/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:1344357/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:1337193/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:1328971/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:1316625/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:130600/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:1279941/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:1266932/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:1736938/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:1233762/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:1211513/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:1199246/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:1198436/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:119392/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:1189018/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:1169239/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:1139210/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:1107341/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:1079299/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:1012379/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:1594850/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:1788873/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:173424/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:1727028/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:1715304/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:1711126/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:1698434/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:1681790/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:1680732/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:1651384/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:1609443/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:1466583/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:1577856/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:1490557/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:1474123/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:1475955/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:1540577/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:1555066/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:1558579/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:1565796/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCGGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:500742/60‑1 (MQ=255)
   aaaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCACCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:674371/60‑1 (MQ=255)
    aaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:353285/59‑1 (MQ=255)
    aaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:599389/59‑1 (MQ=255)
    aaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:201049/59‑1 (MQ=255)
    aaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:938275/59‑1 (MQ=255)
    aaGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGCTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:301586/59‑1 (MQ=255)
               aTGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:1413973/48‑1 (MQ=255)
               aTGGATAGAGACAAACAGGACAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:64288/48‑1 (MQ=255)
                 ggATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAc  <  1:958433/46‑1 (MQ=255)
                                                              |
GGTAAAGGCGTCGGCATGGATAGAGACAAACAGGTCAGCACGCTGTTTCTGGGCTTTTGCTAC  >  minE/1895238‑1895300

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: