Missing coverage evidence...
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ATGGTCGCCAGCGATGCGGCGCTACTGGCGTCGGGTACGGCAGCCCTGGAGTGTATGCTGGC  >  minE/182965‑183026                                                              | aTGGTCGCCAGCGATGCGGCGCTACTGGCGTCGGGTACGGCAGCCCTGGAGTGTATGCTGGc  <  1:588566/62‑1 (MQ=255) aTGGTCGCCAGCGATGCGGCGCTACTGGCGTCGGGTACGGCAGCCCTGGAGTGTATGCTGGc  <  1:1046639/62‑1 (MQ=255) aTGGTCGCCAGCGATGCGGCGCTACTGGCGTCGGGTACGGCAGCCCTGGAGTGTATGCTGGc  <  1:366960/62‑1 (MQ=255) aTGGTCGCCAGCGATGCGGCGCTACTGGCGTCGGGTACGGCAGCCCTGGAGTGTATGCTGGc  <  1:395447/62‑1 (MQ=255) aTGGTCGCCAGCGATGCGGCGCTACTGGCGTCGGGTACGGCAGCCCTGGAGTGTATGCTGGc  <  1:417152/62‑1 (MQ=255) aTGGTCGCCAGCGATGCGGCGCTACTGGCGTCGGGTACGGCAGCCCTGGAGTGTATGCTGGc  <  1:445176/62‑1 (MQ=255) aTGGTCGCCAGCGATGCGGCGCTACTGGCGTCGGGTACGGCAGCCCTGGAGTGTATGCTGGc  <  1:499059/62‑1 (MQ=255) aTGGTCGCCAGCGATGCGGCGCTACTGGCGTCGGGTACGGCAGCCCTGGAGTGTATGCTGGc  <  1:552929/62‑1 (MQ=255) aTGGTCGCCAGCGATGCGGCGCTACTGGCGTCGGGTACGGCAGCCCTGGAGTGTATGCTGGc  <  1:553490/62‑1 (MQ=255) aTGGTCGCCAGCGATGCGGCGCTACTGGCGTCGGGTACGGCAGCCCTGGAGTGTATGCTGGc  <  1:575080/62‑1 (MQ=255) aTGGTCGCCAGCGATGCGGCGCTACTGGCGTCGGGTACGGCAGCCCTGGAGTGTATGCTGGc  <  1:321080/62‑1 (MQ=255) aTGGTCGCCAGCGATGCGGCGCTACTGGCGTCGGGTACGGCAGCCCTGGAGTGTATGCTGGc  <  1:60891/62‑1 (MQ=255) aTGGTCGCCAGCGATGCGGCGCTACTGGCGTCGGGTACGGCAGCCCTGGAGTGTATGCTGGc  <  1:616350/62‑1 (MQ=255) aTGGTCGCCAGCGATGCGGCGCTACTGGCGTCGGGTACGGCAGCCCTGGAGTGTATGCTGGc  <  1:642954/62‑1 (MQ=255) aTGGTCGCCAGCGATGCGGCGCTACTGGCGTCGGGTACGGCAGCCCTGGAGTGTATGCTGGc  <  1:667340/62‑1 (MQ=255) aTGGTCGCCAGCGATGCGGCGCTACTGGCGTCGGGTACGGCAGCCCTGGAGTGTATGCTGGc  <  1:774892/62‑1 (MQ=255) aTGGTCGCCAGCGATGCGGCGCTACTGGCGTCGGGTACGGCAGCCCTGGAGTGTATGCTGGc  <  1:868619/62‑1 (MQ=255) aTGGTCGCCAGCGATGCGGCGCTACTGGCGTCGGGTACGGCAGCCCTGGAGTGTATGCTGGc  <  1:889471/62‑1 (MQ=255) aTGGTCGCCAGCGATGCGGCGCTACTGGCGTCGGGTACGGCAGCCCTGGAGTGTATGCTGGc  <  1:97828/62‑1 (MQ=255) aTGGTCGCCAGCGATGCGGCGCTACTGGCGTCGGGTACGGCAGCCCTGGAGTGTATGCTGGc  <  1:991303/62‑1 (MQ=255) aTGGTCGCCAGCGATGCGGCGCTACTGGCGTCGGGTACGGCAGCCCTGGAGTGTATGCTGGc  <  1:1558230/62‑1 (MQ=255) aTGGTCGCCAGCGATGCGGCGCTACTGGCGTCGGGTACGGCAGCCCTGGAGTGTATGCTGGc  <  1:1091431/62‑1 (MQ=255) aTGGTCGCCAGCGATGCGGCGCTACTGGCGTCGGGTACGGCAGCCCTGGAGTGTATGCTGGc  <  1:1120129/62‑1 (MQ=255) aTGGTCGCCAGCGATGCGGCGCTACTGGCGTCGGGTACGGCAGCCCTGGAGTGTATGCTGGc  <  1:1141264/62‑1 (MQ=255) aTGGTCGCCAGCGATGCGGCGCTACTGGCGTCGGGTACGGCAGCCCTGGAGTGTATGCTGGc  <  1:1228116/62‑1 (MQ=255) aTGGTCGCCAGCGATGCGGCGCTACTGGCGTCGGGTACGGCAGCCCTGGAGTGTATGCTGGc  <  1:1500528/62‑1 (MQ=255) aTGGTCGCCAGCGATGCGGCGCTACTGGCGTCGGGTACGGCAGCCCTGGAGTGTATGCTGGc  <  1:152166/62‑1 (MQ=255) aTGGTCGCCAGCGATGCGGCGCTACTGGCGTCGGGTACGGCAGCCCTGGAGTGTATGCTGGc  <  1:152585/62‑1 (MQ=255) aTGGTCGCCAGCGATGCGGCGCTACTGGCGTCGGGTACGGCAGCCCTGGAGTGTATGCTGGc  <  1:1743644/62‑1 (MQ=255) aTGGTCGCCAGCGATGCGGCGCTACTGGCGTCGGGTACGGCAGCCCTGGAGTGTATGCTGGc  <  1:1756987/62‑1 (MQ=255) aTGGTCGCCAGCGATGCGGCGCTACTGGCGTCGGGTACGGCAGCCCTGGAGTGTATGCTGGc  <  1:1791334/62‑1 (MQ=255) aTGGTCGCCAGCGATGCGGCGCTACTGGCGTCGGGTACGGCAGCCCTGGAGTGTATGCTGGc  <  1:1808850/62‑1 (MQ=255) aTGGTCGCCAGCGATGCGGCGCTACTGGCGTCGGGTACGGCAGCCCTGGAGTGTATGCTGGc  <  1:187826/62‑1 (MQ=255) aTGGTCGCCAGCGATGCGGCGCTACTGGCGTCGGGTACGGCAGCCCTGGAGTGTATGCTGGc  <  1:1890743/62‑1 (MQ=255) aTGGTCGCCAGCGATGCGGCGCTACTGGCGTCGGGTACGGCAGCCCTGGAGTGTATGCTGGc  <  1:206538/62‑1 (MQ=255) aTGGTCGCCAGCGATGCGGCGCTACTGGCGTCGGGTACGGCAGCCCTGGAGTGTATGCTGGc  <  1:240865/62‑1 (MQ=255) aTGGTCGCCAGCGATGCGGCGCTACTCGCGTCGGGTACGGCAGCCCTGGAGTGTATGCTGGc  <  1:283283/62‑1 (MQ=255) aTGGTCGCCAGCGATGCGGAGCTACTGGCGTCGGGTACGGCAGCCCTGGAGTGTATGCTGGc  <  1:1836056/62‑1 (MQ=255)  tGGTCGCCAGCGATGCGGCGCTACTGGCGTCGGGTACGGCAGCCCTGGAGTGTATGCTGGc  <  1:1291093/61‑1 (MQ=255)    gTCGCCAGCGATGCGGCGCTACTGGCGTCGGGTACGGCAGCCCTGGAGTGTATGCTGGc  <  1:374240/59‑1 (MQ=255)       gCCAGCGATGCGGCGCTACTGGCGTCGGGTACGGCAGCCCTGGAGTGTATGCTGGc  <  1:660755/56‑1 (MQ=255)       gCCAGCGATGCGGCGCTACTGGCGTCGGGTACGGCAGCCCTGGAGTGTATGCTGGc  <  1:1210310/56‑1 (MQ=255)                                                              | ATGGTCGCCAGCGATGCGGCGCTACTGGCGTCGGGTACGGCAGCCCTGGAGTGTATGCTGGC  >  minE/182965‑183026

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑