Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 2041539 2041580 42 136 [0] [0] 3 yqiI conserved hypothetical protein

Only 100 of 136 total aligned reads displayed.

CCCAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGTTTT  >  minE/2041477‑2041538
                                                             |
cccAGCGATTGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:1056101/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATTGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:1268695/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:589636/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:1880412/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:568176/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:527538/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:526377/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:525715/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:483020/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:456861/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:43406/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:427350/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:417230/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:373510/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:345400/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:343083/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:336077/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:32036/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:292865/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:262111/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:261718/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:235621/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:212623/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:1891591/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:1108312/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:774398/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:957831/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:954307/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:90705/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:905408/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:887554/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:866584/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:861691/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:851814/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:801161/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:78265/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:782450/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:60109/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:75693/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:752258/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:735653/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:726377/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:714391/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:687003/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:669793/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:659166/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:635148/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:60329/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:1395566/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:1574431/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:1574270/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:1475718/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:1465556/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:1126956/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:1447826/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:1432906/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:143197/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:1421304/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:1403353/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:1603319/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:13919/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:1337642/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:1317249/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:130673/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:1137415/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:1236537/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:1200234/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:1188442/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:1156030/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:1741998/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:1108752/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:1843610/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:1125272/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:1837068/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:1827917/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:1822864/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:1816453/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:1770428/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:1766416/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:17592/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:1611394/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:1739407/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:1716413/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:1696666/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:1693126/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:1653538/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:1650467/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:1634821/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:1621990/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:1611817/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGAAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:770055/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATGATAAAACAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:1417518/62‑1 (MQ=255)
cccAGCGATCGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:1883541/62‑1 (MQ=255)
 ccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:1450168/61‑1 (MQ=255)
 ccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:965793/61‑1 (MQ=255)
 ccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:986963/61‑1 (MQ=255)
 ccAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:992671/61‑1 (MQ=255)
   aGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:804389/59‑1 (MQ=255)
               aaaGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:185420/47‑1 (MQ=255)
                      aTAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGtttt  <  1:204622/40‑1 (MQ=255)
                                                             |
CCCAGCGATGGTAAAAAAGGTGATAAAATCTGGCAAAGCAGTGAATATTTTATGAATGTTTT  >  minE/2041477‑2041538

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑