Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2063945	2064176	232	72 [0]	[0] 108	rpoD	RNA polymerase, sigma 70 (sigma D) factor

ATCATCCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGC  >  minE/2063889‑2063944                                                        | atcatcGAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:368879/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAGTGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:1098845/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATTGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:520078/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATTGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:477187/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:230788/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:255865/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:267091/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:31793/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:340029/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:1898318/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:419748/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:445333/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:450314/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:45776/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:464856/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:1890536/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:489621/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:578317/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:1043622/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:588705/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:620784/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:626673/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:628036/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:668556/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:68930/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:759917/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:790030/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:792422/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:794938/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:839496/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:881091/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:887169/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:89509/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:918746/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:1410492/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:1171420/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:1217061/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:1258938/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:1167588/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:1263242/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:1263962/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:1272902/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:1283137/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:1292512/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:1331806/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:1375620/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:1129543/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:1124188/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:1476565/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:1515645/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:1517155/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:1578603/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:1112624/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:1584552/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:1667374/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:1102371/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:1096817/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:1718435/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:1763206/56‑1 (MQ=255) atcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTAAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:281702/56‑1 (MQ=255)  tcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:980709/55‑1 (MQ=255)  tcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:1090091/55‑1 (MQ=255)  tcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:126101/55‑1 (MQ=255)  tcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:1399318/55‑1 (MQ=255)  tcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:300015/55‑1 (MQ=255)  tcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:1672037/55‑1 (MQ=255)  tcatcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:1827896/55‑1 (MQ=255)   catcCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:353131/54‑1 (MQ=255)      ccAAATCATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:1869076/51‑1 (MQ=255)              tCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:715238/43‑1 (MQ=255)                  cGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:467713/39‑1 (MQ=255)                     cATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGc  <  1:1011402/36‑1 (MQ=255)                                                        | ATCATCCAAATGATCAACGACATGGGCATTCAGGTGATGGAAGAAGCACCGGATGC  >  minE/2063889‑2063944

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑