Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2121244	2121258	15	52 [0]	[0] 18	yraO	DnaA initiator‑associating factor for replication initiation

TGAAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCATT  >  minE/2121183‑2121243                                                             | tgaAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTTGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCAtt  >  1:461330/1‑61 (MQ=255) tgaAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCAtt  >  1:475498/1‑61 (MQ=255) tgaAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCAtt  >  1:1008377/1‑61 (MQ=255) tgaAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCAtt  >  1:190467/1‑61 (MQ=255) tgaAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCAtt  >  1:200933/1‑61 (MQ=255) tgaAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCAtt  >  1:209171/1‑61 (MQ=255) tgaAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCAtt  >  1:250006/1‑61 (MQ=255) tgaAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCAtt  >  1:253135/1‑61 (MQ=255) tgaAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCAtt  >  1:26814/1‑61 (MQ=255) tgaAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCAtt  >  1:308311/1‑61 (MQ=255) tgaAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCAtt  >  1:332757/1‑61 (MQ=255) tgaAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCAtt  >  1:345571/1‑61 (MQ=255) tgaAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCAtt  >  1:398046/1‑61 (MQ=255) tgaAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCAtt  >  1:1879998/1‑61 (MQ=255) tgaAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCAtt  >  1:499219/1‑61 (MQ=255) tgaAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCAtt  >  1:531007/1‑61 (MQ=255) tgaAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCAtt  >  1:585617/1‑61 (MQ=255) tgaAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCAtt  >  1:619719/1‑61 (MQ=255) tgaAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCAtt  >  1:623228/1‑61 (MQ=255) tgaAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCAtt  >  1:652170/1‑61 (MQ=255) tgaAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCAtt  >  1:76023/1‑61 (MQ=255) tgaAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCAtt  >  1:819038/1‑61 (MQ=255) tgaAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCAtt  >  1:915491/1‑61 (MQ=255) tgaAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCAtt  >  1:950301/1‑61 (MQ=255) tgaAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCAtt  >  1:986722/1‑61 (MQ=255) tgaAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCAtt  >  1:1559055/1‑61 (MQ=255) tgaAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCAtt  >  1:1014113/1‑61 (MQ=255) tgaAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCAtt  >  1:1017667/1‑61 (MQ=255) tgaAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCAtt  >  1:1027315/1‑61 (MQ=255) tgaAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCAtt  >  1:1045409/1‑61 (MQ=255) tgaAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCAtt  >  1:1102831/1‑61 (MQ=255) tgaAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCAtt  >  1:1126830/1‑61 (MQ=255) tgaAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCAtt  >  1:1141751/1‑61 (MQ=255) tgaAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCAtt  >  1:1154462/1‑61 (MQ=255) tgaAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCAtt  >  1:1180497/1‑61 (MQ=255) tgaAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCAtt  >  1:1217076/1‑61 (MQ=255) tgaAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCAtt  >  1:1297656/1‑61 (MQ=255) tgaAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCAtt  >  1:1310700/1‑61 (MQ=255) tgaAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCAtt  >  1:1429838/1‑61 (MQ=255) tgaAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCAtt  >  1:1840068/1‑61 (MQ=255) tgaAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCAtt  >  1:1562240/1‑61 (MQ=255) tgaAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCAtt  >  1:1643722/1‑61 (MQ=255) tgaAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCAtt  >  1:1655734/1‑61 (MQ=255) tgaAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCAtt  >  1:1667114/1‑61 (MQ=255) tgaAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCAtt  >  1:1668308/1‑61 (MQ=255) tgaAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCAtt  >  1:1711609/1‑61 (MQ=255) tgaAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCAtt  >  1:171623/1‑61 (MQ=255) tgaAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCAtt  >  1:1814946/1‑61 (MQ=255) tgaAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCAtt  >  1:1838514/1‑61 (MQ=255) tgaAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATCTATAGTTAGCCAtt  >  1:1603699/1‑61 (MQ=255) tgaAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGCGAGATGTATTGTTAGCCAtt  >  1:310837/1‑61 (MQ=255) tgaAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGAGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCAtt  >  1:389609/1‑61 (MQ=255)                                                             | TGAAGTGTATGCAAAACAGGTGCGGGCGCTGGGTCATGCGGGAGATGTATTGTTAGCCATT  >  minE/2121183‑2121243

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑