Missing coverage evidence...
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CGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTGCGC  >  minE/2133775‑2133836                                                              | cgcTAATGCCCTCAGTCCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTgcgc  <  1:1499388/62‑1 (MQ=255) cgcTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTgcgc  <  1:1392423/62‑1 (MQ=255) cgcTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTgcgc  <  1:493077/62‑1 (MQ=255) cgcTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTgcgc  <  1:426912/62‑1 (MQ=255) cgcTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTgcgc  <  1:56238/62‑1 (MQ=255) cgcTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTgcgc  <  1:698037/62‑1 (MQ=255) cgcTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTgcgc  <  1:1877569/62‑1 (MQ=255) cgcTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTgcgc  <  1:890415/62‑1 (MQ=255) cgcTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTgcgc  <  1:1011625/62‑1 (MQ=255) cgcTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTgcgc  <  1:1716327/62‑1 (MQ=255) cgcTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTgcgc  <  1:1698204/62‑1 (MQ=255) cgcTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTgcgc  <  1:1563587/62‑1 (MQ=255) cgcTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTgcgc  <  1:1547835/62‑1 (MQ=255) cgcTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTgcgc  <  1:919554/62‑1 (MQ=255) cgcTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTgcgc  <  1:1339030/62‑1 (MQ=255) cgcTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTgcgc  <  1:926433/62‑1 (MQ=255) cgcTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTgcgc  <  1:949340/62‑1 (MQ=255) cgcTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTgcgc  <  1:126219/62‑1 (MQ=255) cgcTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTgcgc  <  1:1211300/62‑1 (MQ=255) cgcTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTgcgc  <  1:115999/62‑1 (MQ=255) cgcTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTgcgc  <  1:1158978/62‑1 (MQ=255) cgcTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTgcgc  <  1:95017/62‑1 (MQ=255) cgcTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTgcgc  <  1:1039095/62‑1 (MQ=255) cgcTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTgcgc  <  1:1023986/62‑1 (MQ=255) cgcTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTgcgc  <  1:998616/62‑1 (MQ=255) cgatAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTgcgc  <  1:949987/59‑1 (MQ=255) cgatAATCCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAACAGCTGTgcgc  <  1:1748343/59‑1 (MQ=255)  gcTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTgcgc  <  1:508127/61‑1 (MQ=255)   cTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTgcgc  <  1:1254795/60‑1 (MQ=255)     aaTGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTgcgc  <  1:1778241/58‑1 (MQ=255)        gCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTgcgc  <  1:651694/55‑1 (MQ=255)        gCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTgcgc  <  1:945529/55‑1 (MQ=255)        gCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTgcgc  <  1:1012415/55‑1 (MQ=255)                   gagaCTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTgcgc  <  1:1482103/44‑1 (MQ=255)                   gagaCTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTgcgc  <  1:1332786/44‑1 (MQ=255)                       cTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTgcgc  <  1:554234/40‑1 (MQ=255)                       cTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTgcgc  <  1:385592/40‑1 (MQ=255)                         aTCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTgcgc  <  1:356802/38‑1 (MQ=255)                         aTCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTgcgc  <  1:1066151/38‑1 (MQ=255)                          tCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGGgcgc  <  1:1270426/37‑1 (MQ=255)                            aTACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTgcgc  <  1:537527/35‑1 (MQ=255)                                                              | CGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAAAGCTGTGCGC  >  minE/2133775‑2133836

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑