Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 2143656 2143776 121 68 [0] [0] 35 [argG] [argG]

CTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCA  >  minE/2143610‑2143655
                                             |
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAGATGAAAACTCa  <  1:1552392/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:324448/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:688745/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:687833/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:428129/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:408419/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:406137/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:39184/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:347783/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:715294/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:223668/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:210896/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:19356/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:189753/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:1885200/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:1837897/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:1827130/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:177872/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:804278/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:999360/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:965550/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:91233/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:894039/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:8743/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:844161/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:84170/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:814608/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:1765312/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:795747/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:77161/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:756915/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:745084/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:741013/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:733603/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:71908/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:1754464/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:1080483/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:1092151/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:1106590/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:1126925/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:112711/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:1139453/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:1139817/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:1140729/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:117464/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:1304240/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:1307238/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:1308495/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:1338818/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:1389840/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:1393283/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:1418210/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:1032016/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:1752365/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:1748122/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:17255/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:1651707/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:1647010/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:1637557/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:1558079/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:1544009/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:1529626/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:148687/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:1479047/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:1429616/46‑1 (MQ=255)
cTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:1413861/46‑1 (MQ=255)
  aaaCTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:10625/44‑1 (MQ=255)
       ctTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCa  <  1:1429128/39‑1 (MQ=255)
                                             |
CTAAACTCTTCCTGTCTCCGATAAAAGATGATTAAATGAAAACTCA  >  minE/2143610‑2143655

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: