Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2170800	2170842	43	21 [0]	[0] 51	rpoN	RNA polymerase, sigma 54 (sigma N) factor

CGCAACGATGGTGACAGCCAGTTTATCCGCAGCAATCTGCAGGATGCCAAATGGTTGATC  >  minE/2170740‑2170799                                                            | cgcAACGATGGTGACAGCCAGTTTATCCGCAGCAATCTGCAGGATGCCAAATGGTTGATc  >  1:348725/1‑60 (MQ=255) cgcAACGATGGTGACAGCCAGTTTATCCGCAGCAATCTGCAGGATGCCAAATGGTTGATc  >  1:941062/1‑60 (MQ=255) cgcAACGATGGTGACAGCCAGTTTATCCGCAGCAATCTGCAGGATGCCAAATGGTTGATc  >  1:918892/1‑60 (MQ=255) cgcAACGATGGTGACAGCCAGTTTATCCGCAGCAATCTGCAGGATGCCAAATGGTTGATc  >  1:848467/1‑60 (MQ=255) cgcAACGATGGTGACAGCCAGTTTATCCGCAGCAATCTGCAGGATGCCAAATGGTTGATc  >  1:804876/1‑60 (MQ=255) cgcAACGATGGTGACAGCCAGTTTATCCGCAGCAATCTGCAGGATGCCAAATGGTTGATc  >  1:655114/1‑60 (MQ=255) cgcAACGATGGTGACAGCCAGTTTATCCGCAGCAATCTGCAGGATGCCAAATGGTTGATc  >  1:522241/1‑60 (MQ=255) cgcAACGATGGTGACAGCCAGTTTATCCGCAGCAATCTGCAGGATGCCAAATGGTTGATc  >  1:452263/1‑60 (MQ=255) cgcAACGATGGTGACAGCCAGTTTATCCGCAGCAATCTGCAGGATGCCAAATGGTTGATc  >  1:382301/1‑60 (MQ=255) cgcAACGATGGTGACAGCCAGTTTATCCGCAGCAATCTGCAGGATGCCAAATGGTTGATc  >  1:367668/1‑60 (MQ=255) cgcAACGATGGTGACAGCCAGTTTATCCGCAGCAATCTGCAGGATGCCAAATGGTTGATc  >  1:1016275/1‑60 (MQ=255) cgcAACGATGGTGACAGCCAGTTTATCCGCAGCAATCTGCAGGATGCCAAATGGTTGATc  >  1:323974/1‑60 (MQ=255) cgcAACGATGGTGACAGCCAGTTTATCCGCAGCAATCTGCAGGATGCCAAATGGTTGATc  >  1:1825126/1‑60 (MQ=255) cgcAACGATGGTGACAGCCAGTTTATCCGCAGCAATCTGCAGGATGCCAAATGGTTGATc  >  1:1683870/1‑60 (MQ=255) cgcAACGATGGTGACAGCCAGTTTATCCGCAGCAATCTGCAGGATGCCAAATGGTTGATc  >  1:1549439/1‑60 (MQ=255) cgcAACGATGGTGACAGCCAGTTTATCCGCAGCAATCTGCAGGATGCCAAATGGTTGATc  >  1:1488588/1‑60 (MQ=255) cgcAACGATGGTGACAGCCAGTTTATCCGCAGCAATCTGCAGGATGCCAAATGGTTGATc  >  1:1445789/1‑60 (MQ=255) cgcAACGATGGTGACAGCCAGTTTATCCGCAGCAATCTGCAGGATGCCAAATGGTTGATc  >  1:1267118/1‑60 (MQ=255) cgcAACGATGGTGACAGCCAGTTTATCCGCAGCAATCTGCAGGATGCCAAATGGTTGATc  >  1:1218898/1‑60 (MQ=255) cgcAACGATGGTGACAGCCAGTTTATCCGCAGCAATCTGCAGGATGCCAAATGGTTGATc  >  1:1158850/1‑60 (MQ=255) cgcAACGATGGTGACAGCCAGTTTATCCGCAGCAATCTGCAGGATGCCAAATCGTTGATc  >  1:869070/1‑60 (MQ=255)                                                            | CGCAACGATGGTGACAGCCAGTTTATCCGCAGCAATCTGCAGGATGCCAAATGGTTGATC  >  minE/2170740‑2170799

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑