Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2226913	2226964	52	62 [0]	[0] 22	[yhdY]	[yhdY]

TCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTAT  >  minE/2226851‑2226912                                                              | tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:688349/62‑1 (MQ=255) tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:385001/62‑1 (MQ=255) tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:1091218/62‑1 (MQ=255) tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:452185/62‑1 (MQ=255) tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:458222/62‑1 (MQ=255) tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:518860/62‑1 (MQ=255) tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:561610/62‑1 (MQ=255) tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:563896/62‑1 (MQ=255) tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:584923/62‑1 (MQ=255) tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:600573/62‑1 (MQ=255) tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:601823/62‑1 (MQ=255) tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:65167/62‑1 (MQ=255) tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:660862/62‑1 (MQ=255) tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:676823/62‑1 (MQ=255) tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:680226/62‑1 (MQ=255) tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:397971/62‑1 (MQ=255) tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:704825/62‑1 (MQ=255) tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:705652/62‑1 (MQ=255) tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:728705/62‑1 (MQ=255) tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:76672/62‑1 (MQ=255) tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:786558/62‑1 (MQ=255) tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:791349/62‑1 (MQ=255) tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:836847/62‑1 (MQ=255) tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:852722/62‑1 (MQ=255) tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:873666/62‑1 (MQ=255) tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:875529/62‑1 (MQ=255) tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:888567/62‑1 (MQ=255) tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:943048/62‑1 (MQ=255) tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:998867/62‑1 (MQ=255) tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:1661735/62‑1 (MQ=255) tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:1104691/62‑1 (MQ=255) tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:1187596/62‑1 (MQ=255) tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:1197652/62‑1 (MQ=255) tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:1265038/62‑1 (MQ=255) tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:1311220/62‑1 (MQ=255) tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:1364078/62‑1 (MQ=255) tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:1461579/62‑1 (MQ=255) tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:1464439/62‑1 (MQ=255) tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:1480020/62‑1 (MQ=255) tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:1567225/62‑1 (MQ=255) tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:1569998/62‑1 (MQ=255) tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:1610382/62‑1 (MQ=255) tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:1631781/62‑1 (MQ=255) tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:164600/62‑1 (MQ=255) tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:347247/62‑1 (MQ=255) tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:1696504/62‑1 (MQ=255) tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:1699550/62‑1 (MQ=255) tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:1712646/62‑1 (MQ=255) tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:1713620/62‑1 (MQ=255) tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:329748/62‑1 (MQ=255) tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:174980/62‑1 (MQ=255) tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:1756572/62‑1 (MQ=255) tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:1817631/62‑1 (MQ=255) tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:1819170/62‑1 (MQ=255) tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:1872335/62‑1 (MQ=255) tCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:261833/62‑1 (MQ=255)  cAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:629173/61‑1 (MQ=255)      ttAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:658736/57‑1 (MQ=255)       tAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:1193572/56‑1 (MQ=255)        aGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:336087/55‑1 (MQ=255)         gCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:757510/54‑1 (MQ=255)             aaTGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTtat  <  1:403778/50‑1 (MQ=255)                                                              | TCAGGTTAGCTAAATGCTTGATTAAAAAGGCGCTACTCGGCATGGGGAAGCGCCTTTTTTAT  >  minE/2226851‑2226912

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑