Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2240268	2240321	54	19 [0]	[0] 7	zraS	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with ZraR

CCGCCATCTCTTCCAGAAGCGCCTGTTGCTGTACATGGTGCATTCGCATCCCCATCCCTACG  >  minE/2240206‑2240267                                                              | ccGCCATCTCTTCCAGAAGCGCCTGTTGCTGTACATGGTGCATTCGCATCCCCATCCCTAcg  <  1:1816470/62‑1 (MQ=255) ccGCCATCTCTTCCAGAAGCGCCTGTTGCTGTACATGGTGCATTCGCATCCCCATCCCTAcg  <  1:996194/62‑1 (MQ=255) ccGCCATCTCTTCCAGAAGCGCCTGTTGCTGTACATGGTGCATTCGCATCCCCATCCCTAcg  <  1:78146/62‑1 (MQ=255) ccGCCATCTCTTCCAGAAGCGCCTGTTGCTGTACATGGTGCATTCGCATCCCCATCCCTAcg  <  1:742564/62‑1 (MQ=255) ccGCCATCTCTTCCAGAAGCGCCTGTTGCTGTACATGGTGCATTCGCATCCCCATCCCTAcg  <  1:713222/62‑1 (MQ=255) ccGCCATCTCTTCCAGAAGCGCCTGTTGCTGTACATGGTGCATTCGCATCCCCATCCCTAcg  <  1:646436/62‑1 (MQ=255) ccGCCATCTCTTCCAGAAGCGCCTGTTGCTGTACATGGTGCATTCGCATCCCCATCCCTAcg  <  1:558438/62‑1 (MQ=255) ccGCCATCTCTTCCAGAAGCGCCTGTTGCTGTACATGGTGCATTCGCATCCCCATCCCTAcg  <  1:479190/62‑1 (MQ=255) ccGCCATCTCTTCCAGAAGCGCCTGTTGCTGTACATGGTGCATTCGCATCCCCATCCCTAcg  <  1:466985/62‑1 (MQ=255) ccGCCATCTCTTCCAGAAGCGCCTGTTGCTGTACATGGTGCATTCGCATCCCCATCCCTAcg  <  1:1004607/62‑1 (MQ=255) ccGCCATCTCTTCCAGAAGCGCCTGTTGCTGTACATGGTGCATTCGCATCCCCATCCCTAcg  <  1:17154/62‑1 (MQ=255) ccGCCATCTCTTCCAGAAGCGCCTGTTGCTGTACATGGTGCATTCGCATCCCCATCCCTAcg  <  1:1687682/62‑1 (MQ=255) ccGCCATCTCTTCCAGAAGCGCCTGTTGCTGTACATGGTGCATTCGCATCCCCATCCCTAcg  <  1:164271/62‑1 (MQ=255) ccGCCATCTCTTCCAGAAGCGCCTGTTGCTGTACATGGTGCATTCGCATCCCCATCCCTAcg  <  1:1560919/62‑1 (MQ=255) ccGCCATCTCTTCCAGAAGCGCCTGTTGCTGTACATGGTGCATTCGCATCCCCATCCCTAcg  <  1:1549964/62‑1 (MQ=255) ccGCCATCTCTTCCAGAAGCGCCTGTTGCTGTACATGGTGCATTCGCATCCCCATCCCTAcg  <  1:1396568/62‑1 (MQ=255) ccGCCATCTCTTCCAGAAGCGCCTGTTGCTGTACATGGTGCATTCGCATCCCCATCCCTAcg  <  1:1089470/62‑1 (MQ=255) ccGCCATCTCTTCCAGAAGCGCCTGTTGCTGTACATGGTGCATTCGCATCCCCATCCCTAcg  <  1:1059945/62‑1 (MQ=255) ccGCCATCTCTTCCAGAAGCGCCTGTTGCTGTACATGGTCCATTCGCATCCCCATCCCTAcg  <  1:702146/62‑1 (MQ=255)                                                              | CCGCCATCTCTTCCAGAAGCGCCTGTTGCTGTACATGGTGCATTCGCATCCCCATCCCTACG  >  minE/2240206‑2240267

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑