Missing coverage evidence...
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AGATGCGAAAAGCAGCCATGGACAGAAACTACCTGGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTT  >  minE/218135‑218196                                                              | aGATGCGAAAAGCAGCCATGGACAGAAACTACCTGGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCtt  <  1:609603/62‑1 (MQ=255) aGATGCGAAAAGCAGCCATGGACAGAAACTACCTGGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCtt  <  1:1646239/62‑1 (MQ=255) aGATGCGAAAAGCAGCCATGGACAGAAACTACCTGGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCtt  <  1:1896951/62‑1 (MQ=255) aGATGCGAAAAGCAGCCATGGACAGAAACTACCTGGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCtt  <  1:251458/62‑1 (MQ=255) aGATGCGAAAAGCAGCCATGGACAGAAACTACCTGGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCtt  <  1:332692/62‑1 (MQ=255) aGATGCGAAAAGCAGCCATGGACAGAAACTACCTGGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCtt  <  1:345648/62‑1 (MQ=255) aGATGCGAAAAGCAGCCATGGACAGAAACTACCTGGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCtt  <  1:367223/62‑1 (MQ=255) aGATGCGAAAAGCAGCCATGGACAGAAACTACCTGGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCtt  <  1:394116/62‑1 (MQ=255) aGATGCGAAAAGCAGCCATGGACAGAAACTACCTGGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCtt  <  1:44700/62‑1 (MQ=255) aGATGCGAAAAGCAGCCATGGACAGAAACTACCTGGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCtt  <  1:46866/62‑1 (MQ=255) aGATGCGAAAAGCAGCCATGGACAGAAACTACCTGGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCtt  <  1:515362/62‑1 (MQ=255) aGATGCGAAAAGCAGCCATGGACAGAAACTACCTGGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCtt  <  1:1052235/62‑1 (MQ=255) aGATGCGAAAAGCAGCCATGGACAGAAACTACCTGGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCtt  <  1:657493/62‑1 (MQ=255) aGATGCGAAAAGCAGCCATGGACAGAAACTACCTGGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCtt  <  1:721039/62‑1 (MQ=255) aGATGCGAAAAGCAGCCATGGACAGAAACTACCTGGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCtt  <  1:821936/62‑1 (MQ=255) aGATGCGAAAAGCAGCCATGGACAGAAACTACCTGGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCtt  <  1:837208/62‑1 (MQ=255) aGATGCGAAAAGCAGCCATGGACAGAAACTACCTGGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCtt  <  1:865037/62‑1 (MQ=255) aGATGCGAAAAGCAGCCATGGACAGAAACTACCTGGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCtt  <  1:868648/62‑1 (MQ=255) aGATGCGAAAAGCAGCCATGGACAGAAACTACCTGGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCtt  <  1:958750/62‑1 (MQ=255) aGATGCGAAAAGCAGCCATGGACAGAAACTACCTGGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCtt  <  1:96989/62‑1 (MQ=255) aGATGCGAAAAGCAGCCATGGACAGAAACTACCTGGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCtt  <  1:990770/62‑1 (MQ=255) aGATGCGAAAAGCAGCCATGGACAGAAACTACCTGGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCtt  <  1:1385672/62‑1 (MQ=255) aGATGCGAAAAGCAGCCATGGACAGAAACTACCTGGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCtt  <  1:1114081/62‑1 (MQ=255) aGATGCGAAAAGCAGCCATGGACAGAAACTACCTGGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCtt  <  1:1123320/62‑1 (MQ=255) aGATGCGAAAAGCAGCCATGGACAGAAACTACCTGGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCtt  <  1:113884/62‑1 (MQ=255) aGATGCGAAAAGCAGCCATGGACAGAAACTACCTGGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCtt  <  1:1187669/62‑1 (MQ=255) aGATGCGAAAAGCAGCCATGGACAGAAACTACCTGGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCtt  <  1:1111723/62‑1 (MQ=255) aGATGCGAAAAGCAGCCATGGACAGAAACTACCTGGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCtt  <  1:1190572/62‑1 (MQ=255) aGATGCGAAAAGCAGCCATGGACAGAAACTACCTGGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCtt  <  1:1074363/62‑1 (MQ=255) aGATGCGAAAAGCAGCCATGGACAGAAACTACCTGGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCtt  <  1:1604412/62‑1 (MQ=255) aGATGCGAAAAGCAGCCATGGACAGAAACTACCTGGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCtt  <  1:1349008/62‑1 (MQ=255) aGATGCGAAAAGCAGCCATGGACAGAAACTACCTGGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCtt  <  1:1399572/62‑1 (MQ=255) aGATGCGAAAAGCAGCCATGGACAGAAACTACCTGGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCtt  <  1:1490024/62‑1 (MQ=255) aGATGCGAAAAGCAGCCATGGACAGAAACTACCTGGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCtt  <  1:1064629/62‑1 (MQ=255) aGATGCGAAAAGCAGCCATGGACAGAAACTACCTGGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCtt  <  1:1503241/62‑1 (MQ=255) aGATGCGAAAAGCAGCCATGGACAGAAACTACCTGGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCtt  <  1:1546536/62‑1 (MQ=255) aGATGCGAAAAGCAGCCATGGACAGAAACTACCTGGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCtt  <  1:1573376/62‑1 (MQ=255) aGATGCGAAAAGCAGCCATGGACAGAAACTACCTGGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCtt  <  1:1035887/62‑1 (MQ=255) aGATGCGAAAAGCAGCCATGGACAGAAACTACCTGGCGTCAGGCCTTGCGGGGAGCGGGCtt  <  1:1543092/62‑1 (MQ=255)  gATGCGAAAAGCAGCCATGGACAGAAACTACCTGGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCtt  <  1:1260142/61‑1 (MQ=255)  gATGCGAAAAGCAGCCATGGACAGAAACTACCTGGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCtt  <  1:706387/61‑1 (MQ=255)  gATGCGAAAAGCAGCCATGGACAGAAACTACCTGGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCtt  <  1:362814/61‑1 (MQ=255)  gATGCGAAAAGCAGCCATGGACAGAAACTACCTGGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCtt  <  1:1778409/61‑1 (MQ=255)                          aaaCTACCTGGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCtt  <  1:1235728/37‑1 (MQ=255)                                                              | AGATGCGAAAAGCAGCCATGGACAGAAACTACCTGGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTT  >  minE/218135‑218196

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑