Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2401561	2401848	288	68 [0]	[0] 47	xerC	site‑specific tyrosine recombinase

AGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAT  >  minE/2401499‑2401560                                                              | aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:240903/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:387285/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:383534/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:36921/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:352268/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:322645/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:310128/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:302721/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:263640/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:457005/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:237105/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:1873320/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:1872954/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:1858617/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:1841884/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:1821511/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:1044356/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:696030/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:997866/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:855413/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:845875/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:807865/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:799757/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:769075/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:759428/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:738817/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:1805868/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:688979/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:660214/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:623201/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:59526/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:5856/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:496041/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:476340/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:1223093/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:1746372/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:1352502/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:1348529/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:1341553/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:132917/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:1270505/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:1238694/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:1224856/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:138917/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:1197546/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:11876/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:1178288/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:115750/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:1108023/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:1074455/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:1047908/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:1599839/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:1739768/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:1682283/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:1668379/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:1646642/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:1634305/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:1629491/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:1603651/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:1601740/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:1393827/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:1577354/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:1562398/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:1527437/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:1486029/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:1422494/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:1406919/1‑62 (MQ=255) aGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACACAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAt  >  1:532219/1‑62 (MQ=255)                                                              | AGTATAGATTTGCGTGGTGGAGAGGTTGGCATGACCCAGCAGCTCCTGCACACCACGAAGAT  >  minE/2401499‑2401560

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑