Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2439216	2439263	48	95 [0]	[0] 32	ilvC	ketol‑acid reductoisomerase, NAD(P)‑binding

GCATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAG  >  minE/2439154‑2439215                                                              | gCATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:1347481/62‑1 (MQ=255) gCATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:125317/62‑1 (MQ=255)  cctCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:1684239/59‑1 (MQ=255)  cctCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:1453916/59‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCGACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:964127/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCTGCGCAg  <  1:1545590/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:294995/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:497610/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:459633/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:44035/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:436517/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:434508/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:410843/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:32022/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:311635/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:501433/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:269400/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:22382/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:191710/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:1886954/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:1879899/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:1831304/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:1828253/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:1818313/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:1022503/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:747444/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:996725/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:939017/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:907263/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:900862/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:890036/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:8760/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:826493/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:818531/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:772895/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:749116/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:500845/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:728454/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:660360/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:64852/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:610487/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:564862/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:562354/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:546575/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:529259/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:1777073/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:1125771/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:1493620/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:1447175/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:1268542/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:1224505/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:11965/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:1190091/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:11614/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:1148527/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:1375858/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:1119967/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:1084584/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:1078044/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:1075605/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:1065023/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:103121/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:102483/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:1550412/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:1760438/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:1699574/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:168570/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:1675862/61‑1 (MQ=255)  cATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:1494007/61‑1 (MQ=255)   aTCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:495851/60‑1 (MQ=255)   aTCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:80362/60‑1 (MQ=255)    tCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:1532628/59‑1 (MQ=255)    tCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:1682516/59‑1 (MQ=255)     cAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:1490312/58‑1 (MQ=255)     cAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:1365339/58‑1 (MQ=255)     cAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:1205932/58‑1 (MQ=255)     cAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:420463/58‑1 (MQ=255)     cAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:1179226/58‑1 (MQ=255)     cAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:1640633/58‑1 (MQ=255)     cAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:1600714/58‑1 (MQ=255)      aGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:1767922/57‑1 (MQ=255)      aGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:1369938/57‑1 (MQ=255)      aGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:916893/57‑1 (MQ=255)      aGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATAAAGCCGCGCAg  <  1:1411543/57‑1 (MQ=255)       gcgcgcACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:264275/56‑1 (MQ=255)       gcgcgcACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:156523/56‑1 (MQ=255)       gcgcgcACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:1670104/56‑1 (MQ=255)       gcgcgcACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:707460/56‑1 (MQ=255)       gcgcgcACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:1533266/56‑1 (MQ=255)       gcgcgcACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:1445982/56‑1 (MQ=255)       gcgcgcACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:343345/56‑1 (MQ=255)       gcgcgcACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:983320/56‑1 (MQ=255)       gcgcgcACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:1422944/56‑1 (MQ=255)                tAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:1258941/47‑1 (MQ=255)                            gCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAg  <  1:1040967/35‑1 (MQ=255)                                                              | GCATCAGCGCGCACTTAACCCGCAACAGCAATACGTTTCATATCTGTCATATAGCCGCGCAG  >  minE/2439154‑2439215

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑