Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2444409	2444658	250	36 [0]	[0] 87	ilvD	dihydroxyacid dehydratase

CGCCTTACTGGCGATATTACGCGGCAGTGCACTTTCGTCGTTTTGCTCGTAATAACGTTTGG  >  minE/2444347‑2444408                                                              | cgccTTACTGGCGATATTACGCGGCAGTGTACTTTCGTCGTTTTGCTCGTAATAACGTTTgg  <  1:24111/62‑1 (MQ=255) cgccTTACTGGCGATATTACGCGGCAGTGCACTTTCGTCGTTTTGCTCGTAATACCGTTTgg  <  1:217981/62‑1 (MQ=255) cgccTTACTGGCGATATTACGCGGCAGTGCACTTTCGTCGTTTTGCTCGTAATAACGTTTgg  <  1:624166/62‑1 (MQ=255) cgccTTACTGGCGATATTACGCGGCAGTGCACTTTCGTCGTTTTGCTCGTAATAACGTTTgg  <  1:453486/62‑1 (MQ=255) cgccTTACTGGCGATATTACGCGGCAGTGCACTTTCGTCGTTTTGCTCGTAATAACGTTTgg  <  1:471073/62‑1 (MQ=255) cgccTTACTGGCGATATTACGCGGCAGTGCACTTTCGTCGTTTTGCTCGTAATAACGTTTgg  <  1:519789/62‑1 (MQ=255) cgccTTACTGGCGATATTACGCGGCAGTGCACTTTCGTCGTTTTGCTCGTAATAACGTTTgg  <  1:547025/62‑1 (MQ=255) cgccTTACTGGCGATATTACGCGGCAGTGCACTTTCGTCGTTTTGCTCGTAATAACGTTTgg  <  1:579505/62‑1 (MQ=255) cgccTTACTGGCGATATTACGCGGCAGTGCACTTTCGTCGTTTTGCTCGTAATAACGTTTgg  <  1:599905/62‑1 (MQ=255) cgccTTACTGGCGATATTACGCGGCAGTGCACTTTCGTCGTTTTGCTCGTAATAACGTTTgg  <  1:949847/62‑1 (MQ=255) cgccTTACTGGCGATATTACGCGGCAGTGCACTTTCGTCGTTTTGCTCGTAATAACGTTTgg  <  1:637016/62‑1 (MQ=255) cgccTTACTGGCGATATTACGCGGCAGTGCACTTTCGTCGTTTTGCTCGTAATAACGTTTgg  <  1:640889/62‑1 (MQ=255) cgccTTACTGGCGATATTACGCGGCAGTGCACTTTCGTCGTTTTGCTCGTAATAACGTTTgg  <  1:663651/62‑1 (MQ=255) cgccTTACTGGCGATATTACGCGGCAGTGCACTTTCGTCGTTTTGCTCGTAATAACGTTTgg  <  1:703764/62‑1 (MQ=255) cgccTTACTGGCGATATTACGCGGCAGTGCACTTTCGTCGTTTTGCTCGTAATAACGTTTgg  <  1:745655/62‑1 (MQ=255) cgccTTACTGGCGATATTACGCGGCAGTGCACTTTCGTCGTTTTGCTCGTAATAACGTTTgg  <  1:898208/62‑1 (MQ=255) cgccTTACTGGCGATATTACGCGGCAGTGCACTTTCGTCGTTTTGCTCGTAATAACGTTTgg  <  1:900491/62‑1 (MQ=255) cgccTTACTGGCGATATTACGCGGCAGTGCACTTTCGTCGTTTTGCTCGTAATAACGTTTgg  <  1:920540/62‑1 (MQ=255) cgccTTACTGGCGATATTACGCGGCAGTGCACTTTCGTCGTTTTGCTCGTAATAACGTTTgg  <  1:107583/62‑1 (MQ=255) cgccTTACTGGCGATATTACGCGGCAGTGCACTTTCGTCGTTTTGCTCGTAATAACGTTTgg  <  1:342576/62‑1 (MQ=255) cgccTTACTGGCGATATTACGCGGCAGTGCACTTTCGTCGTTTTGCTCGTAATAACGTTTgg  <  1:20893/62‑1 (MQ=255) cgccTTACTGGCGATATTACGCGGCAGTGCACTTTCGTCGTTTTGCTCGTAATAACGTTTgg  <  1:1853504/62‑1 (MQ=255) cgccTTACTGGCGATATTACGCGGCAGTGCACTTTCGTCGTTTTGCTCGTAATAACGTTTgg  <  1:1696801/62‑1 (MQ=255) cgccTTACTGGCGATATTACGCGGCAGTGCACTTTCGTCGTTTTGCTCGTAATAACGTTTgg  <  1:1653746/62‑1 (MQ=255) cgccTTACTGGCGATATTACGCGGCAGTGCACTTTCGTCGTTTTGCTCGTAATAACGTTTgg  <  1:162610/62‑1 (MQ=255) cgccTTACTGGCGATATTACGCGGCAGTGCACTTTCGTCGTTTTGCTCGTAATAACGTTTgg  <  1:1605887/62‑1 (MQ=255) cgccTTACTGGCGATATTACGCGGCAGTGCACTTTCGTCGTTTTGCTCGTAATAACGTTTgg  <  1:1403453/62‑1 (MQ=255) cgccTTACTGGCGATATTACGCGGCAGTGCACTTTCGTCGTTTTGCTCGTAATAACGTTTgg  <  1:1402316/62‑1 (MQ=255) cgccTTACTGGCGATATTACGCGGCAGTGCACTTTCGTCGTTTTGCTCGTAATAACGTTTgg  <  1:1392723/62‑1 (MQ=255) cgccTTACTGGCGATATTACGCGGCAGTGCACTTTCGTCGTTTTGCTCGTAATAACGTTTgg  <  1:1287674/62‑1 (MQ=255) cgccTTACTGGCGATATTACGCGGCAGTGCACTTTCGTCGTTTTGCTCGTAATAACGTTTgg  <  1:1283963/62‑1 (MQ=255) cgccTTACTGGCGATATTACGCGGCAGTGCACTTTCGGCGTTTTGCTCGTAATAACGTTTgg  <  1:871697/62‑1 (MQ=255) cgccTTACTGGCGATATTACGAGGCAGTGCACTTTCGTCGTTTTGCTCGTAATAACGTTTgg  <  1:411637/62‑1 (MQ=255) cgccTTACTGGCGATATTACGAGGCAGTGCACTTTCGTCGTTTTGCTCGTAATAACGTTTgg  <  1:1208163/62‑1 (MQ=255)  gccTTACTGGCGATATTACGCGGCAGTGCACTTTCGTCGTTTTGCTCGTAATAACGTTTgg  <  1:428604/61‑1 (MQ=255)                 ttACGCGGCAGTGCTCTTTCGTCGTTTTGCTCGTAATAACGTTTgg  <  1:1197345/46‑1 (MQ=255)                                                              | CGCCTTACTGGCGATATTACGCGGCAGTGCACTTTCGTCGTTTTGCTCGTAATAACGTTTGG  >  minE/2444347‑2444408

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑