Missing coverage evidence...
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CGATTCGCTTAACCGTCGGTTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATG  >  minE/234942‑235002                                                             | cGATTCGCTTAACCGTCGGTTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATg  <  1:344459/61‑1 (MQ=255) cGATTCGCTTAACCGTCGGTTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATg  <  1:989695/61‑1 (MQ=255) cGATTCGCTTAACCGTCGGTTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATg  <  1:987423/61‑1 (MQ=255) cGATTCGCTTAACCGTCGGTTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATg  <  1:855406/61‑1 (MQ=255) cGATTCGCTTAACCGTCGGTTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATg  <  1:804211/61‑1 (MQ=255) cGATTCGCTTAACCGTCGGTTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATg  <  1:80169/61‑1 (MQ=255) cGATTCGCTTAACCGTCGGTTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATg  <  1:784430/61‑1 (MQ=255) cGATTCGCTTAACCGTCGGTTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATg  <  1:761160/61‑1 (MQ=255) cGATTCGCTTAACCGTCGGTTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATg  <  1:738499/61‑1 (MQ=255) cGATTCGCTTAACCGTCGGTTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATg  <  1:721170/61‑1 (MQ=255) cGATTCGCTTAACCGTCGGTTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATg  <  1:58113/61‑1 (MQ=255) cGATTCGCTTAACCGTCGGTTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATg  <  1:521211/61‑1 (MQ=255) cGATTCGCTTAACCGTCGGTTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATg  <  1:405759/61‑1 (MQ=255) cGATTCGCTTAACCGTCGGTTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATg  <  1:374797/61‑1 (MQ=255) cGATTCGCTTAACCGTCGGTTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATg  <  1:367921/61‑1 (MQ=255) cGATTCGCTTAACCGTCGGTTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATg  <  1:1154755/61‑1 (MQ=255) cGATTCGCTTAACCGTCGGTTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATg  <  1:1873509/61‑1 (MQ=255) cGATTCGCTTAACCGTCGGTTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATg  <  1:1191059/61‑1 (MQ=255) cGATTCGCTTAACCGTCGGTTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATg  <  1:1233355/61‑1 (MQ=255) cGATTCGCTTAACCGTCGGTTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATg  <  1:1283312/61‑1 (MQ=255) cGATTCGCTTAACCGTCGGTTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATg  <  1:1293855/61‑1 (MQ=255) cGATTCGCTTAACCGTCGGTTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATg  <  1:1299535/61‑1 (MQ=255) cGATTCGCTTAACCGTCGGTTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATg  <  1:1450586/61‑1 (MQ=255) cGATTCGCTTAACCGTCGGTTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATg  <  1:1562282/61‑1 (MQ=255) cGATTCGCTTAACCGTCGGTTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATg  <  1:1591132/61‑1 (MQ=255) cGATTCGCTTAACCGTCGGTTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATg  <  1:1629004/61‑1 (MQ=255) cGATTCGCTTAACCGTCGGTTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATg  <  1:1671782/61‑1 (MQ=255) cGATTCGCTTAACCGTCGGTTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATg  <  1:1763103/61‑1 (MQ=255) cGATTCGCTTAACCGTCGGTTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATg  <  1:1770470/61‑1 (MQ=255) cGATTCGCTTAACCGTCGGTTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATg  <  1:1776142/61‑1 (MQ=255) cGATTCGCTTAACCGTCGGTTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATg  <  1:294797/61‑1 (MQ=255)                tCGGTTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATg  <  1:583862/46‑1 (MQ=255)                    tttGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATg  <  1:839658/42‑1 (MQ=255)                       gTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATg  <  1:1585974/39‑1 (MQ=255)                                                             | CGATTCGCTTAACCGTCGGTTTGTCGATACCGATCAGTGGTTGCAATCACAGCTCAATATG  >  minE/234942‑235002

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑