Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2495950	2496120	171	59 [0]	[1] 60	emrD	multidrug efflux system protein

ACGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCA  >  minE/2495888‑2495949                                                              | aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACATGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:83770/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGTCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:237381/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:424711/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:237725/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:240128/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:245606/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:249973/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:258382/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:264634/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:306119/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:363460/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:368477/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:379835/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:382024/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:403093/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:421217/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:1826255/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:461691/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:467995/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:483548/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:537333/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:56366/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:676730/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:688153/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:714909/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:773147/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:840537/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:850238/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:867575/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:1590240/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:1055061/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:1063445/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:1137670/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:1148364/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:1169339/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:1171477/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:129314/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:1352257/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:1355078/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:1358086/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:1422553/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:1460788/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:1481560/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:15867/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:1018611/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:1652572/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:165750/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:169193/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:1696809/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:1716845/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:172000/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:173224/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:1753256/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:1799130/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:181011/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:1820831/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:1825912/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGATCa  >  1:272272/1‑62 (MQ=255) aCGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTATTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCa  >  1:1763076/1‑62 (MQ=255)                                                              | ACGGACTGACGAGAATCCCCATGTTTAACAGGCTGTTAGCATGGCGCAACTGTGTCCGTTCA  >  minE/2495888‑2495949

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑