Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2496524	2496579	56	43 [0]	[0] 56	emrD/ivbL	multidrug efflux system protein/ilvB operon leader peptide

AACAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAGATGCGTCAGCAT  >  minE/2496463‑2496523                                                             | aaCAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAGATGCGTCAgcat  <  1:490011/61‑1 (MQ=255) aaCAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAGATGCGTCAgcat  <  1:1829602/61‑1 (MQ=255) aaCAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAGATGCGTCAgcat  <  1:1003347/61‑1 (MQ=255) aaCAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAGATGCGTCAgcat  <  1:18823/61‑1 (MQ=255) aaCAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAGATGCGTCAgcat  <  1:209701/61‑1 (MQ=255) aaCAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAGATGCGTCAgcat  <  1:393743/61‑1 (MQ=255) aaCAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAGATGCGTCAgcat  <  1:410617/61‑1 (MQ=255) aaCAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAGATGCGTCAgcat  <  1:414226/61‑1 (MQ=255) aaCAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAGATGCGTCAgcat  <  1:426647/61‑1 (MQ=255) aaCAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAGATGCGTCAgcat  <  1:484597/61‑1 (MQ=255) aaCAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAGATGCGTCAgcat  <  1:1877189/61‑1 (MQ=255) aaCAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAGATGCGTCAgcat  <  1:509072/61‑1 (MQ=255) aaCAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAGATGCGTCAgcat  <  1:602458/61‑1 (MQ=255) aaCAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAGATGCGTCAgcat  <  1:67256/61‑1 (MQ=255) aaCAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAGATGCGTCAgcat  <  1:72599/61‑1 (MQ=255) aaCAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAGATGCGTCAgcat  <  1:85839/61‑1 (MQ=255) aaCAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAGATGCGTCAgcat  <  1:931208/61‑1 (MQ=255) aaCAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAGATGCGTCAgcat  <  1:952751/61‑1 (MQ=255) aaCAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAGATGCGTCAgcat  <  1:984802/61‑1 (MQ=255) aaCAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAGATGCGTCAgcat  <  1:130010/61‑1 (MQ=255) aaCAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAGATGCGTCAgcat  <  1:1113664/61‑1 (MQ=255) aaCAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAGATGCGTCAgcat  <  1:1117779/61‑1 (MQ=255) aaCAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAGATGCGTCAgcat  <  1:1161792/61‑1 (MQ=255) aaCAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAGATGCGTCAgcat  <  1:1288539/61‑1 (MQ=255) aaCAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAGATGCGTCAgcat  <  1:1608982/61‑1 (MQ=255) aaCAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAGATGCGTCAgcat  <  1:1373420/61‑1 (MQ=255) aaCAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAGATGCGTCAgcat  <  1:1423992/61‑1 (MQ=255) aaCAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAGATGCGTCAgcat  <  1:1507094/61‑1 (MQ=255) aaCAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAGATGCGTCAgcat  <  1:1538522/61‑1 (MQ=255) aaCAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAGATGCGTCAgcat  <  1:1549819/61‑1 (MQ=255) aaCAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAGATGCGTCAgcat  <  1:1587605/61‑1 (MQ=255) aaCAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAGATGCGTCAgcat  <  1:160450/61‑1 (MQ=255)  aCAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAGATGCGTCAgcat  <  1:1503963/60‑1 (MQ=255)  aCAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAGATGCGTCAgcat  <  1:1506225/60‑1 (MQ=255)  aCAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAGATGCGTCAgcat  <  1:1307724/60‑1 (MQ=255)  aCAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAGATGCGTCAgcat  <  1:274400/60‑1 (MQ=255)  aCAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAGATGCGTCAgcat  <  1:59035/60‑1 (MQ=255)  aCAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAGATGCGTCAgcat  <  1:126054/60‑1 (MQ=255)  aCAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAGATGCGTCAgcat  <  1:680704/60‑1 (MQ=255)  aCAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAGATGCGTCAgcat  <  1:1164151/60‑1 (MQ=255)  aCAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAGATGCGTCAgcat  <  1:861655/60‑1 (MQ=255)  aCAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAGATGCGTCAgcat  <  1:1122665/60‑1 (MQ=255)                          gggAGAGATGGTAGGGCGGATAAGATGCGTCAgcat  <  1:684785/36‑1 (MQ=255)                                                             | AACAAAAGCGGCAATAAATGTTGCCGGGAGAGATGGTAGGGCGGATAAGATGCGTCAGCAT  >  minE/2496463‑2496523

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑