Missing coverage evidence...
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AACGGAAACATTCAGCGACTGCACCATGCCGATCATCGGAATGATGATGTCCTGATCCGCCA  >  minE/2516504‑2516565                                                              | aagggAAACATACAGCGACTGCACCATGCCGATCATCGGAATGATGATGTCCTGATCCGCCa  <  1:1499149/59‑1 (MQ=255) aaCGGAAACATTCAGCGACTGCACCATGCCGATCATCGGAATGATGATGTCCTGATCCGCCa  <  1:1690704/62‑1 (MQ=255) aaCGGAAACATTCAGCGACTGCACCATGCCGATCATCGGAATGATGATGTCCTGATCCGCCa  <  1:99497/62‑1 (MQ=255) aaCGGAAACATTCAGCGACTGCACCATGCCGATCATCGGAATGATGATGTCCTGATCCGCCa  <  1:850693/62‑1 (MQ=255) aaCGGAAACATTCAGCGACTGCACCATGCCGATCATCGGAATGATGATGTCCTGATCCGCCa  <  1:802860/62‑1 (MQ=255) aaCGGAAACATTCAGCGACTGCACCATGCCGATCATCGGAATGATGATGTCCTGATCCGCCa  <  1:758028/62‑1 (MQ=255) aaCGGAAACATTCAGCGACTGCACCATGCCGATCATCGGAATGATGATGTCCTGATCCGCCa  <  1:696872/62‑1 (MQ=255) aaCGGAAACATTCAGCGACTGCACCATGCCGATCATCGGAATGATGATGTCCTGATCCGCCa  <  1:677121/62‑1 (MQ=255) aaCGGAAACATTCAGCGACTGCACCATGCCGATCATCGGAATGATGATGTCCTGATCCGCCa  <  1:301018/62‑1 (MQ=255) aaCGGAAACATTCAGCGACTGCACCATGCCGATCATCGGAATGATGATGTCCTGATCCGCCa  <  1:294451/62‑1 (MQ=255) aaCGGAAACATTCAGCGACTGCACCATGCCGATCATCGGAATGATGATGTCCTGATCCGCCa  <  1:246910/62‑1 (MQ=255) aaCGGAAACATTCAGCGACTGCACCATGCCGATCATCGGAATGATGATGTCCTGATCCGCCa  <  1:1807814/62‑1 (MQ=255) aaCGGAAACATTCAGCGACTGCACCATGCCGATCATCGGAATGATGATGTCCTGATCCGCCa  <  1:1698217/62‑1 (MQ=255) aaCGGAAACATTCAGCGACTGCACCATGCCGATCATCGGAATGATGATGTCCTGATCCGCCa  <  1:103312/62‑1 (MQ=255) aaCGGAAACATTCAGCGACTGCACCATGCCGATCATCGGAATGATGATGTCCTGATCCGCCa  <  1:1554527/62‑1 (MQ=255) aaCGGAAACATTCAGCGACTGCACCATGCCGATCATCGGAATGATGATGTCCTGATCCGCCa  <  1:1530005/62‑1 (MQ=255) aaCGGAAACATTCAGCGACTGCACCATGCCGATCATCGGAATGATGATGTCCTGATCCGCCa  <  1:1522040/62‑1 (MQ=255) aaCGGAAACATTCAGCGACTGCACCATGCCGATCATCGGAATGATGATGTCCTGATCCGCCa  <  1:1498089/62‑1 (MQ=255) aaCGGAAACATTCAGCGACTGCACCATGCCGATCATCGGAATGATGATGTCCTGATCCGCCa  <  1:1462264/62‑1 (MQ=255) aaCGGAAACATTCAGCGACTGCACCATGCCGATCATCGGAATGATGATGTCCTGATCCGCCa  <  1:1402866/62‑1 (MQ=255) aaCGGAAACATTCAGCGACTGCACCATGCCGATCATCGGAATGATGATGTCCTGATCCGCCa  <  1:1236497/62‑1 (MQ=255) aaCGGAAACATTCAGCGACTGCACCATGCCGATCATCGGAATGATGATGTCCTGATCCGCCa  <  1:1200800/62‑1 (MQ=255) aaCGGAAACATTCAGCGACTGCACCATGCCGATCATCGGAATGATGATGTCCTGATCCGCCa  <  1:1188142/62‑1 (MQ=255) aaCGGAAACATTCAGCGACTGCACCATGCCGATCATCGGAATGATGATGTCCTGATCCGCCa  <  1:1146665/62‑1 (MQ=255) aaCGGAAACATTCAGCGACTGCACCATGCCGATCATCGGAATGATGATGTCCTGATCCGCCa  <  1:1120424/62‑1 (MQ=255) aaCGGAAACATTCAGCGACTGCACCATGCCGATCATAGGAATGATGATGTCCTGATCCGCCa  <  1:695576/62‑1 (MQ=255) aaCGGAAACATGCAGCGACTGCACCATGCCGATCATCGGAATGATGATGTCCTGATCCGCCa  <  1:700993/62‑1 (MQ=255)  aCGGAAACATTCAGCGACTGCACCATGCCGATCATCGGAATGATGATGTCCTGATCCGCCa  <  1:1298841/61‑1 (MQ=255)  aCGGAAACATTCAGCGACAGCACCATGCCGATCATCGGAATGATGATGTCCTGATCCGCCa  <  1:1735194/61‑1 (MQ=255)                                                              | AACGGAAACATTCAGCGACTGCACCATGCCGATCATCGGAATGATGATGTCCTGATCCGCCA  >  minE/2516504‑2516565

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑