Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	240939	240994	56	62 [0]	[0] 4	[araJ]	[araJ]

CCCAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAT  >  minE/240904‑240938                                   | cccAAACCAAACGTTCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:321151/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGGCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:106374/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:336082/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:513179/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:498668/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:498466/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:475586/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:466448/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:46461/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:452880/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:379798/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:514064/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:262590/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:212709/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:1879845/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:1867255/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:1857809/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:1853678/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:518008/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:520701/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:537788/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:58246/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:620724/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:635472/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:635823/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:650214/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:651672/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:685514/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:747138/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:79748/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:949548/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:973967/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:1348054/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:1028303/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:1039858/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:1088276/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:1123275/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:1123619/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:1160674/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:1249844/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:1250643/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:1279079/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:130889/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:1321587/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:1326809/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:1347684/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:1022192/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:135717/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:138209/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:1382995/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:1458836/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:1485320/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:1579973/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:1647597/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:169576/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:172924/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:1767496/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:1774150/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:1791718/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:1818374/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:1828812/35‑1 (MQ=255) cccAAACCAAACGTCCCCAGAGCCAAAGATAAAAt  <  1:1278185/35‑1 (MQ=255)                                   | CCCAAACCAAACGTGCCCAGAGCCAAAGATAAAAT  >  minE/240904‑240938

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑