Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2535941	2536324	384	70 [0]	[0] 13	[rfaP]	[rfaP]

ACAATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTAA  >  minE/2535879‑2535940                                                              | acacTTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:1247087/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:363506/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:530522/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:510501/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:509461/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:489419/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:484536/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:46039/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:425992/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:577755/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:362797/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:299807/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:278740/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:274023/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:263128/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:233932/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:223156/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:1020092/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:215410/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:587808/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:611042/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:621253/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:639489/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:641301/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:652946/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:729537/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:748836/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:803070/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:913694/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:92705/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:932172/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:933782/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:985470/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:989762/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:1112455/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:1295453/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:1874727/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:1234094/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:1224274/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:1203076/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:1192989/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:1150066/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:1144116/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:1263245/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:1108964/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:1095612/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:1070941/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:1053066/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:1043696/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:1034510/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:1020854/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:1527422/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:1864806/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:1856751/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:1742604/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:1726694/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:1622805/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:1564538/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:1548485/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:133187/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:1504194/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:1502339/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:1466251/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:1437083/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:140414/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:1375310/62‑1 (MQ=255) acaATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:1336/62‑1 (MQ=255)  caATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:888414/61‑1 (MQ=255)  caATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:951172/61‑1 (MQ=255)            tGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTaa  <  1:702027/51‑1 (MQ=255)                                                              | ACAATTAGCCTTGAAGATTATTGTGCCGATTGGGCAGTCAACCCGCCTGATATACGTGTTAA  >  minE/2535879‑2535940

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑