Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 2536592 2536801 210 139 [0] [0] 7 rfaS lipopolysaccharide core biosynthesis protein

Only 100 of 139 total aligned reads displayed.

AAGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAA  >  minE/2536530‑2536591
                                                             |
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:272374/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:473944/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:47133/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:470847/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:429751/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:406626/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:390597/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:334891/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:325647/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:323944/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:310863/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:305237/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:297093/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:504852/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:267959/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:227057/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:217220/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:213115/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:1890547/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:1884741/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:1879052/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:1838145/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:1837541/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:1835399/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:1005756/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:724704/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:969308/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:915233/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:908614/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:88921/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:860856/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:846998/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:836763/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:823841/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:810242/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:773284/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:770119/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:1804634/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:714614/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:704721/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:647808/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:642823/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:588582/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:572202/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:57134/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:562675/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:557475/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:5488/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:521423/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:1198072/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:1766138/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:1446235/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:1436777/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:1426489/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:1376042/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:1339422/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:133420/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:1294592/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:1287707/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:1242694/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:1237944/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:1465323/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:1180590/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:1163266/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:1158508/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:1145108/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:1131024/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:1102943/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:107916/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:1070597/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:1067680/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:1036240/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:1008772/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:1623323/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:1742690/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:1722941/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:1719900/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:1716652/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:1712438/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:170440/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:1678242/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:1672181/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:1648056/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:1638257/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:1631184/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:149754/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:1586020/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:1575120/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:1570390/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:1547681/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:154292/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:1522975/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:1519494/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:1515082/62‑1 (MQ=255)
aaGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:1504622/62‑1 (MQ=255)
 aGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:389237/61‑1 (MQ=255)
            aaTGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:1742479/50‑1 (MQ=255)
                    tAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:962952/42‑1 (MQ=255)
                     aaaaaaGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:1323701/41‑1 (MQ=255)
                           gATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTtaa  <  1:124717/35‑1 (MQ=255)
                                                             |
AAGCATTACCTCAATGATATTAAAAAAGATGACATAATTATCATTAATGACAGTGTTGTTAA  >  minE/2536530‑2536591

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑