Missing coverage evidence...
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TCACAGGCTTAATAGTTTCTTAATACAAAGCCTGTAAAACGTCAGGATAACTTCAGAGGTC  >  minE/2551322‑2551382                                                             | tctcaGGCTTAATAGTTTCTTAATACAAAGCCTGTAAAACGTCAGGATAACTTCAGAGgtc  <  1:179164/58‑1 (MQ=255) tcACAGGCTTAATAGTTTCTTAATACAAAGCCTGTAAAACGTCAGGATAACTTCAGAGgtc  <  1:210794/61‑1 (MQ=255) tcACAGGCTTAATAGTTTCTTAATACAAAGCCTGTAAAACGTCAGGATAACTTCAGAGgtc  <  1:93132/61‑1 (MQ=255) tcACAGGCTTAATAGTTTCTTAATACAAAGCCTGTAAAACGTCAGGATAACTTCAGAGgtc  <  1:799704/61‑1 (MQ=255) tcACAGGCTTAATAGTTTCTTAATACAAAGCCTGTAAAACGTCAGGATAACTTCAGAGgtc  <  1:755538/61‑1 (MQ=255) tcACAGGCTTAATAGTTTCTTAATACAAAGCCTGTAAAACGTCAGGATAACTTCAGAGgtc  <  1:716406/61‑1 (MQ=255) tcACAGGCTTAATAGTTTCTTAATACAAAGCCTGTAAAACGTCAGGATAACTTCAGAGgtc  <  1:653525/61‑1 (MQ=255) tcACAGGCTTAATAGTTTCTTAATACAAAGCCTGTAAAACGTCAGGATAACTTCAGAGgtc  <  1:616766/61‑1 (MQ=255) tcACAGGCTTAATAGTTTCTTAATACAAAGCCTGTAAAACGTCAGGATAACTTCAGAGgtc  <  1:58176/61‑1 (MQ=255) tcACAGGCTTAATAGTTTCTTAATACAAAGCCTGTAAAACGTCAGGATAACTTCAGAGgtc  <  1:449037/61‑1 (MQ=255) tcACAGGCTTAATAGTTTCTTAATACAAAGCCTGTAAAACGTCAGGATAACTTCAGAGgtc  <  1:315419/61‑1 (MQ=255) tcACAGGCTTAATAGTTTCTTAATACAAAGCCTGTAAAACGTCAGGATAACTTCAGAGgtc  <  1:231874/61‑1 (MQ=255) tcACAGGCTTAATAGTTTCTTAATACAAAGCCTGTAAAACGTCAGGATAACTTCAGAGgtc  <  1:1074703/61‑1 (MQ=255) tcACAGGCTTAATAGTTTCTTAATACAAAGCCTGTAAAACGTCAGGATAACTTCAGAGgtc  <  1:188722/61‑1 (MQ=255) tcACAGGCTTAATAGTTTCTTAATACAAAGCCTGTAAAACGTCAGGATAACTTCAGAGgtc  <  1:1697138/61‑1 (MQ=255) tcACAGGCTTAATAGTTTCTTAATACAAAGCCTGTAAAACGTCAGGATAACTTCAGAGgtc  <  1:1578925/61‑1 (MQ=255) tcACAGGCTTAATAGTTTCTTAATACAAAGCCTGTAAAACGTCAGGATAACTTCAGAGgtc  <  1:1541250/61‑1 (MQ=255) tcACAGGCTTAATAGTTTCTTAATACAAAGCCTGTAAAACGTCAGGATAACTTCAGAGgtc  <  1:1504004/61‑1 (MQ=255) tcACAGGCTTAATAGTTTCTTAATACAAAGCCTGTAAAACGTCAGGATAACTTCAGAGgtc  <  1:1495205/61‑1 (MQ=255) tcACAGGCTTAATAGTTTCTTAATACAAAGCCTGTAAAACGTCAGGATAACTTCAGAGgtc  <  1:1490308/61‑1 (MQ=255) tcACAGGCTTAATAGTTTCTTAATACAAAGCCTGTAAAACGTCAGGATAACTTCAGAGgtc  <  1:1432157/61‑1 (MQ=255) tcACAGGCTTAATAGTTTCTTAATACAAAGCCTGTAAAACGTCAGGATAACTTCAGAGgtc  <  1:1430680/61‑1 (MQ=255)  cacaGGCTTAATAGTTTCTTAATACAAAGCCTGTAAAACGTCAGGATAACTTCAGAGgtc  <  1:1119306/60‑1 (MQ=255)       gCTTAATAGTTTCTTAATACAAAGCCTGTAAAACGTCAGGATAACTTCAGAGgtc  <  1:618301/55‑1 (MQ=255)                      aaTACAAAGCCTGTAAAACGTCAGGATAACTTCAGAGgtc  <  1:288744/40‑1 (MQ=255)                                                             | TCACAGGCTTAATAGTTTCTTAATACAAAGCCTGTAAAACGTCAGGATAACTTCAGAGGTC  >  minE/2551322‑2551382

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑