Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2554139	2554805	667	91 [0]	[0] 153	[envC]–[gpmI]	[envC],[gpmI]

TGCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCT  >  minE/2554078‑2554138                                                             | tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCGAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:1334062/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:294511/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:42213/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:421359/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:42025/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:407202/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:36437/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:354274/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:345903/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:335036/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:304027/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:302728/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:447373/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:21077/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:20545/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:199565/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:199015/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:1867399/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:1867207/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:1862261/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:1849933/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:1836148/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:1820875/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:1820708/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:803066/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:999583/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:986477/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:97483/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:952523/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:948791/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:881052/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:877704/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:864365/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:838075/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:829329/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:1808991/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:752190/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:65634/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:649751/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:648022/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:583182/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:56268/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:554231/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:514424/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:491547/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:453474/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:1275484/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:1454633/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:1445077/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:1442122/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:144190/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:1435279/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:1381195/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:1329273/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:1327979/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:1303675/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:1287184/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:1518522/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:1189466/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:1168895/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:116128/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:1157999/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:1152519/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:1101474/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:1088420/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:1043855/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:1042016/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:102077/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:1692256/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:1808904/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:1800048/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:1796806/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:1794264/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:1784881/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:1763998/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:1752965/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:1750036/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:1745727/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:1728172/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:1724748/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:101882/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:168627/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:1679545/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:1632027/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:1597647/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:1577205/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:1545322/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:1537847/61‑1 (MQ=255) tgCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:1519217/61‑1 (MQ=255)  gctcgctcTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:544912/60‑1 (MQ=255)        tctGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCt  <  1:1594475/54‑1 (MQ=255)                                                             | TGCTCGCTCTGTTTCTCTTCCAGTTCAGCACGCTGCATGGCGACTTCTTCACGCGTTTGCT  >  minE/2554078‑2554138

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑