Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 248421 249157 737 135 [0] [0] 3 brnQ predicted branched chain amino acid transporter

Only 100 of 135 total aligned reads displayed.

GCGTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGC  >  minE/248359‑248420
                                                             |
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGTGTGATTCCGCGCTGc  <  1:726189/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:1773210/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:257489/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:199728/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:733158/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:1867607/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:184487/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:1810855/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:739338/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:1793268/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:1657585/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:757464/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:1764073/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:1735500/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:1733980/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:766220/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:1674421/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:1664682/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:766783/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:1661714/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:417453/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:569951/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:537257/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:534749/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:505845/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:495621/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:59817/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:474885/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:460159/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:718908/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:401752/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:637865/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:381242/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:356845/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:325810/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:319947/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:289453/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:710795/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:1196901/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:785528/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:1263405/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:1254742/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:1244836/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:1222495/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:1218304/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:1216894/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:1203281/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:1199498/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:1295634/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:1158829/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:115321/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:1146744/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:1141313/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:1137213/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:1125850/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:930869/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:943160/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:1413648/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:1573154/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:1564081/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:1524744/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:1492260/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:1585305/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:1466696/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:1428686/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:1416972/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:1398543/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:839180/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:87598/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:799564/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:1359510/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:886865/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:1612247/62‑1 (MQ=255)
gcgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:1311922/62‑1 (MQ=255)
 cgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:1794553/61‑1 (MQ=255)
 cgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:627286/61‑1 (MQ=255)
 cgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:645822/61‑1 (MQ=255)
 cgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:904836/61‑1 (MQ=255)
 cgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:728683/61‑1 (MQ=255)
 cgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:434184/61‑1 (MQ=255)
 cgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:1084146/61‑1 (MQ=255)
 cgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:1086442/61‑1 (MQ=255)
 cgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:1286258/61‑1 (MQ=255)
 cgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:1359066/61‑1 (MQ=255)
 cgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:1377450/61‑1 (MQ=255)
 cgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:1382423/61‑1 (MQ=255)
 cgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:1594103/61‑1 (MQ=255)
 cgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:1618175/61‑1 (MQ=255)
 cgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:1663407/61‑1 (MQ=255)
 cgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:1049174/61‑1 (MQ=255)
 cgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:1877666/61‑1 (MQ=255)
 cgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:209012/61‑1 (MQ=255)
 cgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:284898/61‑1 (MQ=255)
 cgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:293088/61‑1 (MQ=255)
 cgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:394906/61‑1 (MQ=255)
 cgTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGGGATTCCGCGCTGc  <  1:1705953/61‑1 (MQ=255)
 cgTACAACTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:488216/61‑1 (MQ=255)
  gTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:268530/60‑1 (MQ=255)
                       aaGTGGGGTTTGCGCCGCTGTCGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:1766648/39‑1 (MQ=38)
                       aaGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGc  <  1:279408/39‑1 (MQ=255)
                                                             |
GCGTACAGCTACCGTTTCCTTTGAAGTGGGGATTGCGCCGCTGACGGGTGATTCCGCGCTGC  >  minE/248359‑248420

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑