Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2588196	2588304	109	66 [0]	[0] 33	mdtE	multidrug resistance efflux transporter

CAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGC  >  minE/2588135‑2588195                                                             | cAGCGAGCCTTTGGCTGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:913181/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:336170/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:546508/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:545235/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:518522/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:473658/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:452228/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:420264/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:381518/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:364037/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:554478/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:305146/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:288822/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:284953/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:241955/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:1042595/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:220422/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:232043/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:567419/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:644063/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:667582/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:728434/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:776451/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:790225/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:799553/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:853711/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:884557/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:902659/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:985986/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:991379/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:99365/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:994413/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:1368324/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:1059503/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:1065279/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:1103329/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:1107463/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:1122778/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:1156778/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:1165234/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:1165448/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:1237404/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:1239610/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:1241137/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:1252896/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:1264171/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:1292597/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:203218/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:1462505/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:198247/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:1870468/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:1870180/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:1840299/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:181768/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:1710617/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:1591270/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:156941/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:1548004/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:1533286/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:152599/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:1517877/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:1496992/61‑1 (MQ=255) cAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:1404017/61‑1 (MQ=255)  aGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:826302/60‑1 (MQ=255)  aGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:404745/60‑1 (MQ=255)                      tAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGc  <  1:574820/40‑1 (MQ=255)                                                             | CAGCGAGCCTTTGGCGGAGTTTAGCTCGGCCTGTAAAGGTGCAGGATCAATCTGATACAGC  >  minE/2588135‑2588195

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑