Missing coverage evidence...
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CGGATGGCAGTGGAACTCCGCAGGTTGCGTTGCGCCAGCTTCCGGAGCCGGTACTAACTG  >  minE/2606967‑2607026                                                            | cGGATGGCAGTGGAACTCCGCAGGTTGCGTTGCGCCAGCTTCCGGAGCCGGTACTAACTg  >  1:19698/1‑60 (MQ=255) cGGATGGCAGTGGAACTCCGCAGGTTGCGTTGCGCCAGCTTCCGGAGCCGGTACTAACTg  >  1:965905/1‑60 (MQ=255) cGGATGGCAGTGGAACTCCGCAGGTTGCGTTGCGCCAGCTTCCGGAGCCGGTACTAACTg  >  1:869865/1‑60 (MQ=255) cGGATGGCAGTGGAACTCCGCAGGTTGCGTTGCGCCAGCTTCCGGAGCCGGTACTAACTg  >  1:777801/1‑60 (MQ=255) cGGATGGCAGTGGAACTCCGCAGGTTGCGTTGCGCCAGCTTCCGGAGCCGGTACTAACTg  >  1:750335/1‑60 (MQ=255) cGGATGGCAGTGGAACTCCGCAGGTTGCGTTGCGCCAGCTTCCGGAGCCGGTACTAACTg  >  1:715947/1‑60 (MQ=255) cGGATGGCAGTGGAACTCCGCAGGTTGCGTTGCGCCAGCTTCCGGAGCCGGTACTAACTg  >  1:713146/1‑60 (MQ=255) cGGATGGCAGTGGAACTCCGCAGGTTGCGTTGCGCCAGCTTCCGGAGCCGGTACTAACTg  >  1:709273/1‑60 (MQ=255) cGGATGGCAGTGGAACTCCGCAGGTTGCGTTGCGCCAGCTTCCGGAGCCGGTACTAACTg  >  1:467647/1‑60 (MQ=255) cGGATGGCAGTGGAACTCCGCAGGTTGCGTTGCGCCAGCTTCCGGAGCCGGTACTAACTg  >  1:463321/1‑60 (MQ=255) cGGATGGCAGTGGAACTCCGCAGGTTGCGTTGCGCCAGCTTCCGGAGCCGGTACTAACTg  >  1:440270/1‑60 (MQ=255) cGGATGGCAGTGGAACTCCGCAGGTTGCGTTGCGCCAGCTTCCGGAGCCGGTACTAACTg  >  1:265011/1‑60 (MQ=255) cGGATGGCAGTGGAACTCCGCAGGTTGCGTTGCGCCAGCTTCCGGAGCCGGTACTAACTg  >  1:249553/1‑60 (MQ=255) cGGATGGCAGTGGAACTCCGCAGGTTGCGTTGCGCCAGCTTCCGGAGCCGGTACTAACTg  >  1:23192/1‑60 (MQ=255) cGGATGGCAGTGGAACTCCGCAGGTTGCGTTGCGCCAGCTTCCGGAGCCGGTACTAACTg  >  1:100582/1‑60 (MQ=255) cGGATGGCAGTGGAACTCCGCAGGTTGCGTTGCGCCAGCTTCCGGAGCCGGTACTAACTg  >  1:1899081/1‑60 (MQ=255) cGGATGGCAGTGGAACTCCGCAGGTTGCGTTGCGCCAGCTTCCGGAGCCGGTACTAACTg  >  1:183579/1‑60 (MQ=255) cGGATGGCAGTGGAACTCCGCAGGTTGCGTTGCGCCAGCTTCCGGAGCCGGTACTAACTg  >  1:1802277/1‑60 (MQ=255) cGGATGGCAGTGGAACTCCGCAGGTTGCGTTGCGCCAGCTTCCGGAGCCGGTACTAACTg  >  1:1797262/1‑60 (MQ=255) cGGATGGCAGTGGAACTCCGCAGGTTGCGTTGCGCCAGCTTCCGGAGCCGGTACTAACTg  >  1:166269/1‑60 (MQ=255) cGGATGGCAGTGGAACTCCGCAGGTTGCGTTGCGCCAGCTTCCGGAGCCGGTACTAACTg  >  1:1657403/1‑60 (MQ=255) cGGATGGCAGTGGAACTCCGCAGGTTGCGTTGCGCCAGCTTCCGGAGCCGGTACTAACTg  >  1:1616394/1‑60 (MQ=255) cGGATGGCAGTGGAACTCCGCAGGTTGCGTTGCGCCAGCTTCCGGAGCCGGTACTAACTg  >  1:151264/1‑60 (MQ=255) cGGATGGCAGTGGAACTCCGCAGGTTGCGTTGCGCCAGCTTCCGGAGCCGGTACTAACTg  >  1:1498567/1‑60 (MQ=255) cGGATGGCAGTGGAACTCCGCAGGTTGCGTTGCGCCAGCTTCCGGAGCCGGTACTAACTg  >  1:1475038/1‑60 (MQ=255) cGGATGGCAGTGGAACTCCGCAGGTTGCGTTGCGCCAGCTTCCGGAGCCGGTACTAACTg  >  1:1312362/1‑60 (MQ=255) cGGATGGCAGTGGAACTCCGCAGGTTGCGTTGCGCCAGCTTCCGGAGCCGGTACTAACTg  >  1:1227339/1‑60 (MQ=255) cGGATGGCAGTGGAACTCCGCAGGTTGCGTTGCGCCAGCTTCCGGAGCCGGTACTAACTg  >  1:1104919/1‑60 (MQ=255) cGGATGGCAGTGGAACTCCGCAGGTTGCGTTGCGCCAGCTTCCGGAGCCGGTACTAACTg  >  1:110262/1‑60 (MQ=255) cGGATGGCAGTGGAACTCCGCAGCTTGCGTTGCGCCAGCTTCCGGAGCCGGTACTAACTg  >  1:895797/1‑60 (MQ=255)                                                            | CGGATGGCAGTGGAACTCCGCAGGTTGCGTTGCGCCAGCTTCCGGAGCCGGTACTAACTG  >  minE/2606967‑2607026

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑