Missing coverage evidence...
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ACGATGCCGCCAGTACGCCGACCAGCGCGGTTAGTGCGATCAGCATCACCACCACTACAAT  >  minE/2615066‑2615126                                                             | aCGATGCCGCCAGTACGCCGACCAGCGCGGTTAGTGCGATCAGCATCACCACCACTACAAt  <  1:644400/61‑1 (MQ=255) aCGATGCCGCCAGTACGCCGACCAGCGCGGTTAGTGCGATCAGCATCACCACCACTACAAt  <  1:1059158/61‑1 (MQ=255) aCGATGCCGCCAGTACGCCGACCAGCGCGGTTAGTGCGATCAGCATCACCACCACTACAAt  <  1:265440/61‑1 (MQ=255) aCGATGCCGCCAGTACGCCGACCAGCGCGGTTAGTGCGATCAGCATCACCACCACTACAAt  <  1:309736/61‑1 (MQ=255) aCGATGCCGCCAGTACGCCGACCAGCGCGGTTAGTGCGATCAGCATCACCACCACTACAAt  <  1:318819/61‑1 (MQ=255) aCGATGCCGCCAGTACGCCGACCAGCGCGGTTAGTGCGATCAGCATCACCACCACTACAAt  <  1:430552/61‑1 (MQ=255) aCGATGCCGCCAGTACGCCGACCAGCGCGGTTAGTGCGATCAGCATCACCACCACTACAAt  <  1:478193/61‑1 (MQ=255) aCGATGCCGCCAGTACGCCGACCAGCGCGGTTAGTGCGATCAGCATCACCACCACTACAAt  <  1:494593/61‑1 (MQ=255) aCGATGCCGCCAGTACGCCGACCAGCGCGGTTAGTGCGATCAGCATCACCACCACTACAAt  <  1:509143/61‑1 (MQ=255) aCGATGCCGCCAGTACGCCGACCAGCGCGGTTAGTGCGATCAGCATCACCACCACTACAAt  <  1:57490/61‑1 (MQ=255) aCGATGCCGCCAGTACGCCGACCAGCGCGGTTAGTGCGATCAGCATCACCACCACTACAAt  <  1:625199/61‑1 (MQ=255) aCGATGCCGCCAGTACGCCGACCAGCGCGGTTAGTGCGATCAGCATCACCACCACTACAAt  <  1:21746/61‑1 (MQ=255) aCGATGCCGCCAGTACGCCGACCAGCGCGGTTAGTGCGATCAGCATCACCACCACTACAAt  <  1:669088/61‑1 (MQ=255) aCGATGCCGCCAGTACGCCGACCAGCGCGGTTAGTGCGATCAGCATCACCACCACTACAAt  <  1:669529/61‑1 (MQ=255) aCGATGCCGCCAGTACGCCGACCAGCGCGGTTAGTGCGATCAGCATCACCACCACTACAAt  <  1:72547/61‑1 (MQ=255) aCGATGCCGCCAGTACGCCGACCAGCGCGGTTAGTGCGATCAGCATCACCACCACTACAAt  <  1:739773/61‑1 (MQ=255) aCGATGCCGCCAGTACGCCGACCAGCGCGGTTAGTGCGATCAGCATCACCACCACTACAAt  <  1:809481/61‑1 (MQ=255) aCGATGCCGCCAGTACGCCGACCAGCGCGGTTAGTGCGATCAGCATCACCACCACTACAAt  <  1:8549/61‑1 (MQ=255) aCGATGCCGCCAGTACGCCGACCAGCGCGGTTAGTGCGATCAGCATCACCACCACTACAAt  <  1:868424/61‑1 (MQ=255) aCGATGCCGCCAGTACGCCGACCAGCGCGGTTAGTGCGATCAGCATCACCACCACTACAAt  <  1:940166/61‑1 (MQ=255) aCGATGCCGCCAGTACGCCGACCAGCGCGGTTAGTGCGATCAGCATCACCACCACTACAAt  <  1:943484/61‑1 (MQ=255) aCGATGCCGCCAGTACGCCGACCAGCGCGGTTAGTGCGATCAGCATCACCACCACTACAAt  <  1:1519675/61‑1 (MQ=255) aCGATGCCGCCAGTACGCCGACCAGCGCGGTTAGTGCGATCAGCATCACCACCACTACAAt  <  1:111349/61‑1 (MQ=255) aCGATGCCGCCAGTACGCCGACCAGCGCGGTTAGTGCGATCAGCATCACCACCACTACAAt  <  1:1134353/61‑1 (MQ=255) aCGATGCCGCCAGTACGCCGACCAGCGCGGTTAGTGCGATCAGCATCACCACCACTACAAt  <  1:1144227/61‑1 (MQ=255) aCGATGCCGCCAGTACGCCGACCAGCGCGGTTAGTGCGATCAGCATCACCACCACTACAAt  <  1:1154774/61‑1 (MQ=255) aCGATGCCGCCAGTACGCCGACCAGCGCGGTTAGTGCGATCAGCATCACCACCACTACAAt  <  1:1280019/61‑1 (MQ=255) aCGATGCCGCCAGTACGCCGACCAGCGCGGTTAGTGCGATCAGCATCACCACCACTACAAt  <  1:1400639/61‑1 (MQ=255) aCGATGCCGCCAGTACGCCGACCAGCGCGGTTAGTGCGATCAGCATCACCACCACTACAAt  <  1:1493371/61‑1 (MQ=255) aCGATGCCGCCAGTACGCCGACCAGCGCGGTTAGTGCGATCAGCATCACCACCACTACAAt  <  1:1500081/61‑1 (MQ=255) aCGATGCCGCCAGTACGCCGACCAGCGCGGTTAGTGCGATCAGCATCACCACCACTACAAt  <  1:1501618/61‑1 (MQ=255) aCGATGCCGCCAGTACGCCGACCAGCGCGGTTAGTGCGATCAGCATCACCACCACTACAAt  <  1:1807225/61‑1 (MQ=255) aCGATGCCGCCAGTACGCCGACCAGCGCGGTTAGTGCGATCAGCATCACCACCACTACAAt  <  1:1526300/61‑1 (MQ=255) aCGATGCCGCCAGTACGCCGACCAGCGCGGTTAGTGCGATCAGCATCACCACCACTACAAt  <  1:1552646/61‑1 (MQ=255) aCGATGCCGCCAGTACGCCGACCAGCGCGGTTAGTGCGATCAGCATCACCACCACTACAAt  <  1:1590853/61‑1 (MQ=255) aCGATGCCGCCAGTACGCCGACCAGCGCGGTTAGTGCGATCAGCATCACCACCACTACAAt  <  1:1600715/61‑1 (MQ=255) aCGATGCCGCCAGTACGCCGACCAGCGCGGTTAGTGCGATCAGCATCACCACCACTACAAt  <  1:1637015/61‑1 (MQ=255) aCGATGCCGCCAGTACGCCGACCAGCGCGGTTAGTGCGATCAGCATCACCACCACTACAAt  <  1:1679297/61‑1 (MQ=255) aCGATGCCGCCAGTACGCCGACCAGCGCGGTTAGTGCGATCAGCATCACCACCACTACAAt  <  1:1779734/61‑1 (MQ=255)  cGATGCCGCCAGTACGCCGACCAGCGCGGTTAGTGCGATCAGCATCACCACCACTACAAt  <  1:1444732/60‑1 (MQ=255)  cGATGCCGCCAGTACGCCGACCAGCGCGGTTAGTGCGATCAGCATCACCACCACTACAAt  <  1:233587/60‑1 (MQ=255)                cGCCGACCAGCGCGGTTAGTGCGATCAGCATCACCACCACTACAAt  <  1:1757424/46‑1 (MQ=255)                                                             | ACGATGCCGCCAGTACGCCGACCAGCGCGGTTAGTGCGATCAGCATCACCACCACTACAAT  >  minE/2615066‑2615126

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑