Missing coverage evidence...
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CAGTACACAAAGCATTATGGTTGGGCCGGACGGTGAGTTGTACGGCGCATCCGACCCGCGC  >  minE/2642018‑2642078                                                             | cAGTACACAAAGCATTATTGTTGGGCCGGACGGTGAGTTGTACGGCGCATCCGACCCgcgc  <  1:1689889/61‑1 (MQ=255) cAGTACACAAAGCATTATGGTTGGGCCGGACGGTGAGTTGTACGGCGCATCCGACCCgcgc  <  1:1859237/61‑1 (MQ=255) cAGTACACAAAGCATTATGGTTGGGCCGGACGGTGAGTTGTACGGCGCATCCGACCCgcgc  <  1:90965/61‑1 (MQ=255) cAGTACACAAAGCATTATGGTTGGGCCGGACGGTGAGTTGTACGGCGCATCCGACCCgcgc  <  1:825829/61‑1 (MQ=255) cAGTACACAAAGCATTATGGTTGGGCCGGACGGTGAGTTGTACGGCGCATCCGACCCgcgc  <  1:558940/61‑1 (MQ=255) cAGTACACAAAGCATTATGGTTGGGCCGGACGGTGAGTTGTACGGCGCATCCGACCCgcgc  <  1:524030/61‑1 (MQ=255) cAGTACACAAAGCATTATGGTTGGGCCGGACGGTGAGTTGTACGGCGCATCCGACCCgcgc  <  1:514469/61‑1 (MQ=255) cAGTACACAAAGCATTATGGTTGGGCCGGACGGTGAGTTGTACGGCGCATCCGACCCgcgc  <  1:457834/61‑1 (MQ=255) cAGTACACAAAGCATTATGGTTGGGCCGGACGGTGAGTTGTACGGCGCATCCGACCCgcgc  <  1:419519/61‑1 (MQ=255) cAGTACACAAAGCATTATGGTTGGGCCGGACGGTGAGTTGTACGGCGCATCCGACCCgcgc  <  1:381114/61‑1 (MQ=255) cAGTACACAAAGCATTATGGTTGGGCCGGACGGTGAGTTGTACGGCGCATCCGACCCgcgc  <  1:336199/61‑1 (MQ=255) cAGTACACAAAGCATTATGGTTGGGCCGGACGGTGAGTTGTACGGCGCATCCGACCCgcgc  <  1:21166/61‑1 (MQ=255) cAGTACACAAAGCATTATGGTTGGGCCGGACGGTGAGTTGTACGGCGCATCCGACCCgcgc  <  1:206302/61‑1 (MQ=255) cAGTACACAAAGCATTATGGTTGGGCCGGACGGTGAGTTGTACGGCGCATCCGACCCgcgc  <  1:1128390/61‑1 (MQ=255) cAGTACACAAAGCATTATGGTTGGGCCGGACGGTGAGTTGTACGGCGCATCCGACCCgcgc  <  1:1809212/61‑1 (MQ=255) cAGTACACAAAGCATTATGGTTGGGCCGGACGGTGAGTTGTACGGCGCATCCGACCCgcgc  <  1:1765301/61‑1 (MQ=255) cAGTACACAAAGCATTATGGTTGGGCCGGACGGTGAGTTGTACGGCGCATCCGACCCgcgc  <  1:1764236/61‑1 (MQ=255) cAGTACACAAAGCATTATGGTTGGGCCGGACGGTGAGTTGTACGGCGCATCCGACCCgcgc  <  1:1681677/61‑1 (MQ=255) cAGTACACAAAGCATTATGGTTGGGCCGGACGGTGAGTTGTACGGCGCATCCGACCCgcgc  <  1:1674427/61‑1 (MQ=255) cAGTACACAAAGCATTATGGTTGGGCCGGACGGTGAGTTGTACGGCGCATCCGACCCgcgc  <  1:1537664/61‑1 (MQ=255) cAGTACACAAAGCATTATGGTTGGGCCGGACGGTGAGTTGTACGGCGCATCCGACCCgcgc  <  1:1527294/61‑1 (MQ=255) cAGTACACAAAGCATTATGGTTGGGCCGGACGGTGAGTTGTACGGCGCATCCGACCCgcgc  <  1:151659/61‑1 (MQ=255) cAGTACACAAAGCATTATGGTTGGGCCGGACGGTGAGTTGTACGGCGCATCCGACCCgcgc  <  1:1500741/61‑1 (MQ=255) cAGTACACAAAGCATTATGGTTGGGCCGGACGGTGAGTTGTACGGCGCATCCGACCCgcgc  <  1:1497644/61‑1 (MQ=255) cAGTACACAAAGCATTATGGTTGGGCCGGACGGTGAGTTGTACGGCGCATCCGACCCgcgc  <  1:1484381/61‑1 (MQ=255) cAGTACACAAAGCATTATGGTTGGGCCGGACGGTGAGTTGTACGGCGCATACGACCCgcgc  <  1:311284/61‑1 (MQ=255)  aGTACACAAAGCATTATGGTTGGGCCGGACGGTGAGTTGTACGGCGCATCCGACCCgcgc  <  1:393154/60‑1 (MQ=255)  aGTACACAAAGCATTATGGTTGGGCCGGACGGTGAGTTGTACGGCGCATCCGACCCgcgc  <  1:1502850/60‑1 (MQ=255)                           cGGACGGTGAGTTGTACGGCGCATCCGACCCgcgc  <  1:82391/35‑1 (MQ=255)                                                             | CAGTACACAAAGCATTATGGTTGGGCCGGACGGTGAGTTGTACGGCGCATCCGACCCGCGC  >  minE/2642018‑2642078

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑