Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 2653675 2653798 124 123 [0] [0] 17 glgA glycogen synthase

Only 100 of 123 total aligned reads displayed.

TAATATTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATG  >  minE/2653613‑2653674
                                                             |
tAATATTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:1286904/62‑1 (MQ=255)
 aaTATTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:466754/61‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTTAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:924711/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTTTACTATg  <  1:1894173/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:259175/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:518081/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:414902/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:386037/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:353701/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:325199/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:320652/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:306507/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:275321/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:272583/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:261154/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:547487/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:246530/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:224863/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:212301/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:209345/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:190025/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:1867088/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:1857562/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:1796436/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:1692618/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:709873/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:962548/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:955413/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:946998/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:94512/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:88658/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:842189/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:826634/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:799674/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:79756/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:769589/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:541561/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:701388/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:689262/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:670922/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:659963/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:620262/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:618068/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:614112/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:580976/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:577736/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:1030358/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:1236152/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:1414084/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:1079444/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:135954/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:1679918/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:1316906/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:1309785/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:1298204/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:125872/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:124922/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:1054737/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:1082438/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:1217325/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:1190470/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:1153224/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:1151267/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:1094824/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:1120464/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:1118888/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:1098855/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:1514437/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:1019355/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:1032004/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:1034114/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:1647706/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:1034491/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:1627940/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:1618920/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:1605125/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:1577996/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:1543365/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:1422718/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:1494606/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:1486540/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:1479425/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:1471359/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:1461249/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:1455927/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:1440249/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:1436637/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGGCTGTACTATg  <  1:45439/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCACTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:471578/60‑1 (MQ=255)
  atatTCATGGGCTGGAATTAAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:810871/60‑1 (MQ=255)
  atatTCAAGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:1656317/60‑1 (MQ=255)
   tatTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:460094/59‑1 (MQ=255)
    atTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:1229716/58‑1 (MQ=255)
    atTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:1049424/58‑1 (MQ=255)
    atTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:1834526/58‑1 (MQ=255)
     ttCATGGGCTGGAATTCTACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:1142601/57‑1 (MQ=255)
     ttCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:1633306/57‑1 (MQ=255)
                gAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:401993/46‑1 (MQ=255)
                       aCGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:1780005/39‑1 (MQ=255)
                           aCAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATg  <  1:771881/35‑1 (MQ=255)
                                                             |
TAATATTCATGGGCTGGAATTCAACGGACAAATCTCTTTCCTGAAGGCCGGTCTGTACTATG  >  minE/2653613‑2653674

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: