Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2666212	2666251	40	52 [0]	[0] 79	malT	DNA‑binding transcriptional activator, maltotriose‑ATP‑binding

GGGCCAGCGAGCATTGAATCAACATTGCCAGGCACTGAAGCTGTTGCTGTGGCTGATAAGACGA  >  minE/2666148‑2666211                                                                | gggCCAGCGAGCATTGAATCAACATTGCCAGGCACTGAAGCTGTTG‑‑GTGGCTGATAAgacga  <  1:1117548/62‑1 (MQ=255)   gCCAGCGATCATTGAATCAACATTGCCAGGCACTGAAGCTGTTGCTGTGGCTGATAAgacga  <  1:614237/62‑1 (MQ=255)   gCCAGCGAGCATTGAATCAACATTGCCTGGCACTGAAGCTGTTGCTGTGGCTGATAAgacga  <  1:411567/62‑1 (MQ=255)   gCCAGCGAGCATTGAATCAACATTGCCAGGCACTTAAGCTGTTGCTGTGGCTGATAAgacga  <  1:1313239/62‑1 (MQ=255)   gCCAGCGAGCATTGAATCAACATTGCCAGGCACTGAAGCTGTTGCTGTGGCTGATAAgacga  <  1:687943/62‑1 (MQ=255)   gCCAGCGAGCATTGAATCAACATTGCCAGGCACTGAAGCTGTTGCTGTGGCTGATAAgacga  <  1:365669/62‑1 (MQ=255)   gCCAGCGAGCATTGAATCAACATTGCCAGGCACTGAAGCTGTTGCTGTGGCTGATAAgacga  <  1:392130/62‑1 (MQ=255)   gCCAGCGAGCATTGAATCAACATTGCCAGGCACTGAAGCTGTTGCTGTGGCTGATAAgacga  <  1:459799/62‑1 (MQ=255)   gCCAGCGAGCATTGAATCAACATTGCCAGGCACTGAAGCTGTTGCTGTGGCTGATAAgacga  <  1:485915/62‑1 (MQ=255)   gCCAGCGAGCATTGAATCAACATTGCCAGGCACTGAAGCTGTTGCTGTGGCTGATAAgacga  <  1:493696/62‑1 (MQ=255)   gCCAGCGAGCATTGAATCAACATTGCCAGGCACTGAAGCTGTTGCTGTGGCTGATAAgacga  <  1:50466/62‑1 (MQ=255)   gCCAGCGAGCATTGAATCAACATTGCCAGGCACTGAAGCTGTTGCTGTGGCTGATAAgacga  <  1:552854/62‑1 (MQ=255)   gCCAGCGAGCATTGAATCAACATTGCCAGGCACTGAAGCTGTTGCTGTGGCTGATAAgacga  <  1:612301/62‑1 (MQ=255)   gCCAGCGAGCATTGAATCAACATTGCCAGGCACTGAAGCTGTTGCTGTGGCTGATAAgacga  <  1:634385/62‑1 (MQ=255)   gCCAGCGAGCATTGAATCAACATTGCCAGGCACTGAAGCTGTTGCTGTGGCTGATAAgacga  <  1:636333/62‑1 (MQ=255)   gCCAGCGAGCATTGAATCAACATTGCCAGGCACTGAAGCTGTTGCTGTGGCTGATAAgacga  <  1:1059842/62‑1 (MQ=255)   gCCAGCGAGCATTGAATCAACATTGCCAGGCACTGAAGCTGTTGCTGTGGCTGATAAgacga  <  1:689919/62‑1 (MQ=255)   gCCAGCGAGCATTGAATCAACATTGCCAGGCACTGAAGCTGTTGCTGTGGCTGATAAgacga  <  1:7026/62‑1 (MQ=255)   gCCAGCGAGCATTGAATCAACATTGCCAGGCACTGAAGCTGTTGCTGTGGCTGATAAgacga  <  1:706477/62‑1 (MQ=255)   gCCAGCGAGCATTGAATCAACATTGCCAGGCACTGAAGCTGTTGCTGTGGCTGATAAgacga  <  1:749184/62‑1 (MQ=255)   gCCAGCGAGCATTGAATCAACATTGCCAGGCACTGAAGCTGTTGCTGTGGCTGATAAgacga  <  1:758525/62‑1 (MQ=255)   gCCAGCGAGCATTGAATCAACATTGCCAGGCACTGAAGCTGTTGCTGTGGCTGATAAgacga  <  1:761585/62‑1 (MQ=255)   gCCAGCGAGCATTGAATCAACATTGCCAGGCACTGAAGCTGTTGCTGTGGCTGATAAgacga  <  1:833191/62‑1 (MQ=255)   gCCAGCGAGCATTGAATCAACATTGCCAGGCACTGAAGCTGTTGCTGTGGCTGATAAgacga  <  1:854333/62‑1 (MQ=255)   gCCAGCGAGCATTGAATCAACATTGCCAGGCACTGAAGCTGTTGCTGTGGCTGATAAgacga  <  1:861088/62‑1 (MQ=255)   gCCAGCGAGCATTGAATCAACATTGCCAGGCACTGAAGCTGTTGCTGTGGCTGATAAgacga  <  1:923757/62‑1 (MQ=255)   gCCAGCGAGCATTGAATCAACATTGCCAGGCACTGAAGCTGTTGCTGTGGCTGATAAgacga  <  1:144656/62‑1 (MQ=255)   gCCAGCGAGCATTGAATCAACATTGCCAGGCACTGAAGCTGTTGCTGTGGCTGATAAgacga  <  1:11029/62‑1 (MQ=255)   gCCAGCGAGCATTGAATCAACATTGCCAGGCACTGAAGCTGTTGCTGTGGCTGATAAgacga  <  1:1162880/62‑1 (MQ=255)   gCCAGCGAGCATTGAATCAACATTGCCAGGCACTGAAGCTGTTGCTGTGGCTGATAAgacga  <  1:1173994/62‑1 (MQ=255)   gCCAGCGAGCATTGAATCAACATTGCCAGGCACTGAAGCTGTTGCTGTGGCTGATAAgacga  <  1:1180658/62‑1 (MQ=255)   gCCAGCGAGCATTGAATCAACATTGCCAGGCACTGAAGCTGTTGCTGTGGCTGATAAgacga  <  1:124165/62‑1 (MQ=255)   gCCAGCGAGCATTGAATCAACATTGCCAGGCACTGAAGCTGTTGCTGTGGCTGATAAgacga  <  1:1268336/62‑1 (MQ=255)   gCCAGCGAGCATTGAATCAACATTGCCAGGCACTGAAGCTGTTGCTGTGGCTGATAAgacga  <  1:1376810/62‑1 (MQ=255)   gCCAGCGAGCATTGAATCAACATTGCCAGGCACTGAAGCTGTTGCTGTGGCTGATAAgacga  <  1:1381971/62‑1 (MQ=255)   gCCAGCGAGCATTGAATCAACATTGCCAGGCACTGAAGCTGTTGCTGTGGCTGATAAgacga  <  1:1401855/62‑1 (MQ=255)   gCCAGCGAGCATTGAATCAACATTGCCAGGCACTGAAGCTGTTGCTGTGGCTGATAAgacga  <  1:1409219/62‑1 (MQ=255)   gCCAGCGAGCATTGAATCAACATTGCCAGGCACTGAAGCTGTTGCTGTGGCTGATAAgacga  <  1:1446202/62‑1 (MQ=255)   gCCAGCGAGCATTGAATCAACATTGCCAGGCACTGAAGCTGTTGCTGTGGCTGATAAgacga  <  1:1498213/62‑1 (MQ=255)   gCCAGCGAGCATTGAATCAACATTGCCAGGCACTGAAGCTGTTGCTGTGGCTGATAAgacga  <  1:1524294/62‑1 (MQ=255)   gCCAGCGAGCATTGAATCAACATTGCCAGGCACTGAAGCTGTTGCTGTGGCTGATAAgacga  <  1:1619181/62‑1 (MQ=255)   gCCAGCGAGCATTGAATCAACATTGCCAGGCACTGAAGCTGTTGCTGTGGCTGATAAgacga  <  1:1663497/62‑1 (MQ=255)   gCCAGCGAGCATTGAATCAACATTGCCAGGCACTGAAGCTGTTGCTGTGGCTGATAAgacga  <  1:1708370/62‑1 (MQ=255)   gCCAGCGAGCATTGAATCAACATTGCCAGGCACTGAAGCTGTTGCTGTGGCTGATAAgacga  <  1:1789158/62‑1 (MQ=255)   gCCAGCGAGCATTGAATCAACATTGCCAGGCACTGAAGCTGTTGCTGTGGCTGATAAgacga  <  1:107003/62‑1 (MQ=255)   gCCAGCGAGCATTGAATCAACATTGCCAGGCACTGAAGCTGTTGCTGTGGCTGATAAgacga  <  1:1864656/62‑1 (MQ=255)   gCCAGCGAGCATTGAATCAACATTGCCAGGCACTGAAGCTGTTGCTGTGGCTGATAAgacga  <  1:105165/62‑1 (MQ=255)   gCCAGCGAGCATTGAATCAACATTGCCAGGCACTGAAGCTGTTGCTGTGGCTGATAAgacga  <  1:310562/62‑1 (MQ=255)    ccAGCGAGCATTGAATCAACATTGCCAGGCACTGAAGCTGTTGCTGTGGCTGATAAgacga  <  1:971960/61‑1 (MQ=255)      aGCGAGCATTGAATCAACATTGCCAGGCACTGAAGCTGTTGCTGTGGCTGATAAgacga  <  1:437925/59‑1 (MQ=255)      aGCGAGCATTGAATCAACATTGCCAGGCACTGAAGCTGTTGCTGTGGCTGATAAgacga  <  1:209787/59‑1 (MQ=255)                             cAGGCACTGAAGCTGTTGCTGTGGCTGATAAgacga  <  1:392002/36‑1 (MQ=255)                                                                | GGGCCAGCGAGCATTGAATCAACATTGCCAGGCACTGAAGCTGTTGCTGTGGCTGATAAGACGA  >  minE/2666148‑2666211

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑