Missing coverage evidence...
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TTTCTCGCGCGGGCAATCTTGCCCGCGCTTCTGCTCTCCCGGCGTAACCCGGATTTGCCGCT  >  minE/2716650‑2716711                                                              | tttCTCGCGCGGGGAATCTTGCCCGCGCTTCTGCTCTCCCGGCGTAACCCGGATTTGCGGCt  >  1:1274930/1‑62 (MQ=255) tttCTCGCGCGGGCAATCTTGCCCGCGCTTCTGCTCTCCCGGCGTAACCCGGATTTGCCGCt  >  1:1696654/1‑62 (MQ=255) tttCTCGCGCGGGCAATCTTGCCCGCGCTTCTGCTCTCCCGGCGTAACCCGGATTTGCCGCt  >  1:1665993/1‑62 (MQ=255) tttCTCGCGCGGGCAATCTTGCCCGCGCTTCTGCTCTCCCGGCGTAACCCGGATTTGCCGCt  >  1:173068/1‑62 (MQ=255) tttCTCGCGCGGGCAATCTTGCCCGCGCTTCTGCTCTCCCGGCGTAACCCGGATTTGCCGCt  >  1:1818170/1‑62 (MQ=255) tttCTCGCGCGGGCAATCTTGCCCGCGCTTCTGCTCTCCCGGCGTAACCCGGATTTGCCGCt  >  1:183122/1‑62 (MQ=255) tttCTCGCGCGGGCAATCTTGCCCGCGCTTCTGCTCTCCCGGCGTAACCCGGATTTGCCGCt  >  1:1878774/1‑62 (MQ=255) tttCTCGCGCGGGCAATCTTGCCCGCGCTTCTGCTCTCCCGGCGTAACCCGGATTTGCCGCt  >  1:202767/1‑62 (MQ=255) tttCTCGCGCGGGCAATCTTGCCCGCGCTTCTGCTCTCCCGGCGTAACCCGGATTTGCCGCt  >  1:322252/1‑62 (MQ=255) tttCTCGCGCGGGCAATCTTGCCCGCGCTTCTGCTCTCCCGGCGTAACCCGGATTTGCCGCt  >  1:34479/1‑62 (MQ=255) tttCTCGCGCGGGCAATCTTGCCCGCGCTTCTGCTCTCCCGGCGTAACCCGGATTTGCCGCt  >  1:368594/1‑62 (MQ=255) tttCTCGCGCGGGCAATCTTGCCCGCGCTTCTGCTCTCCCGGCGTAACCCGGATTTGCCGCt  >  1:447783/1‑62 (MQ=255) tttCTCGCGCGGGCAATCTTGCCCGCGCTTCTGCTCTCCCGGCGTAACCCGGATTTGCCGCt  >  1:48056/1‑62 (MQ=255) tttCTCGCGCGGGCAATCTTGCCCGCGCTTCTGCTCTCCCGGCGTAACCCGGATTTGCCGCt  >  1:547447/1‑62 (MQ=255) tttCTCGCGCGGGCAATCTTGCCCGCGCTTCTGCTCTCCCGGCGTAACCCGGATTTGCCGCt  >  1:582253/1‑62 (MQ=255) tttCTCGCGCGGGCAATCTTGCCCGCGCTTCTGCTCTCCCGGCGTAACCCGGATTTGCCGCt  >  1:640409/1‑62 (MQ=255) tttCTCGCGCGGGCAATCTTGCCCGCGCTTCTGCTCTCCCGGCGTAACCCGGATTTGCCGCt  >  1:656423/1‑62 (MQ=255) tttCTCGCGCGGGCAATCTTGCCCGCGCTTCTGCTCTCCCGGCGTAACCCGGATTTGCCGCt  >  1:661605/1‑62 (MQ=255) tttCTCGCGCGGGCAATCTTGCCCGCGCTTCTGCTCTCCCGGCGTAACCCGGATTTGCCGCt  >  1:679005/1‑62 (MQ=255) tttCTCGCGCGGGCAATCTTGCCCGCGCTTCTGCTCTCCCGGCGTAACCCGGATTTGCCGCt  >  1:6792/1‑62 (MQ=255) tttCTCGCGCGGGCAATCTTGCCCGCGCTTCTGCTCTCCCGGCGTAACCCGGATTTGCCGCt  >  1:689570/1‑62 (MQ=255) tttCTCGCGCGGGCAATCTTGCCCGCGCTTCTGCTCTCCCGGCGTAACCCGGATTTGCCGCt  >  1:750596/1‑62 (MQ=255) tttCTCGCGCGGGCAATCTTGCCCGCGCTTCTGCTCTCCCGGCGTAACCCGGATTTGCCGCt  >  1:837908/1‑62 (MQ=255) tttCTCGCGCGGGCAATCTTGCCCGCGCTTCTGCTCTCCCGGCGTAACCCGGATTTGCCGCt  >  1:1276174/1‑62 (MQ=255) tttCTCGCGCGGGCAATCTTGCCCGCGCTTCTGCTCTCCCGGCGTAACCCGGATTTGCCGCt  >  1:1077095/1‑62 (MQ=255) tttCTCGCGCGGGCAATCTTGCCCGCGCTTCTGCTCTCCCGGCGTAACCCGGATTTGCCGCt  >  1:1095733/1‑62 (MQ=255) tttCTCGCGCGGGCAATCTTGCCCGCGCTTCTGCTCTCCCGGCGTAACCCGGATTTGCCGCt  >  1:1103522/1‑62 (MQ=255) tttCTCGCGCGGGCAATCTTGCCCGCGCTTCTGCTCTCCCGGCGTAACCCGGATTTGCCGCt  >  1:1104122/1‑62 (MQ=255) tttCTCGCGCGGGCAATCTTGCCCGCGCTTCTGCTCTCCCGGCGTAACCCGGATTTGCCGCt  >  1:1170106/1‑62 (MQ=255) tttCTCGCGCGGGCAATCTTGCCCGCGCTTCTGCTCTCCCGGCGTAACCCGGATTTGCCGCt  >  1:1185261/1‑62 (MQ=255) tttCTCGCGCGGGCAATCTTGCCCGCGCTTCTGCTCTCCCGGCGTAACCCGGATTTGCCGCt  >  1:1191708/1‑62 (MQ=255) tttCTCGCGCGGGCAATCTTGCCCGCGCTTCTGCTCTCCCGGCGTAACCCGGATTTGCCGCt  >  1:1224298/1‑62 (MQ=255) tttCTCGCGCGGGCAATCTTGCCCGCGCTTCTGCTCTCCCGGCGTAACCCGGATTTGCCGCt  >  1:1250181/1‑62 (MQ=255) tttCTCGCGCGGGCAATCTTGCCCGCGCTTCTGCTCTCCCGGCGTAACCCGGATTTGCCGCt  >  1:1254131/1‑62 (MQ=255) tttCTCGCGCGGGCAATCTTGCCCGCGCTTCTGCTCTCCCGGCGTAACCCGGATTTGCCGCt  >  1:1677142/1‑62 (MQ=255) tttCTCGCGCGGGCAATCTTGCCCGCGCTTCTGCTCTCCCGGCGTAACCCGGATTTGCCGCt  >  1:1296331/1‑62 (MQ=255) tttCTCGCGCGGGCAATCTTGCCCGCGCTTCTGCTCTCCCGGCGTAACCCGGATTTGCCGCt  >  1:131139/1‑62 (MQ=255) tttCTCGCGCGGGCAATCTTGCCCGCGCTTCTGCTCTCCCGGCGTAACCCGGATTTGCCGCt  >  1:1313748/1‑62 (MQ=255) tttCTCGCGCGGGCAATCTTGCCCGCGCTTCTGCTCTCCCGGCGTAACCCGGATTTGCCGCt  >  1:1325550/1‑62 (MQ=255) tttCTCGCGCGGGCAATCTTGCCCGCGCTTCTGCTCTCCCGGCGTAACCCGGATTTGCCGCt  >  1:1342250/1‑62 (MQ=255) tttCTCGCGCGGGCAATCTTGCCCGCGCTTCTGCTCTCCCGGCGTAACCCGGATTTGCCGCt  >  1:1345514/1‑62 (MQ=255) tttCTCGCGCGGGCAATCTTGCCCGCGCTTCTGCTCTCCCGGCGTAACCCGGATTTGCCGCt  >  1:1381450/1‑62 (MQ=255) tttCTCGCGCGGGCAATCTTGCCCGCGCTTCTGCTCTCCCGGCGTAACCCGGATTTGCCGCt  >  1:1399964/1‑62 (MQ=255) tttCTCGCGCGGGCAATCTTGCCCGCGCTTCTGCTCTCCCGGCGTAACCCGGATTTGCCGCt  >  1:1487500/1‑62 (MQ=255) tttCTCGCGCGGGCAATCTTGCCCGCGCTTCTGCTCTCCCGGCGTAACCCGGATTTGCCGCt  >  1:1016515/1‑62 (MQ=255)                                                              | TTTCTCGCGCGGGCAATCTTGCCCGCGCTTCTGCTCTCCCGGCGTAACCCGGATTTGCCGCT  >  minE/2716650‑2716711

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑