Missing coverage evidence...
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GGTGGCATGGTGCTACCGGCGATCACAAACGGTTAATTATGACACAAATTGACCTGAATGAA  >  minE/2812778‑2812839 |                                                              ggTGGCATTGTGCTACCGGCGATCACAAACGGTTAATTATGACACAAATTGACCtgaatgaa  <  1:1879001/62‑1 (MQ=255) ggTGGCATGGTGCTACCGGCGATCACAAACGGTTAATTATGACACAAATTGACCtgaatgaa  <  1:56264/62‑1 (MQ=255) ggTGGCATGGTGCTACCGGCGATCACAAACGGTTAATTATGACACAAATTGACCtgaatgaa  <  1:1821490/62‑1 (MQ=255) ggTGGCATGGTGCTACCGGCGATCACAAACGGTTAATTATGACACAAATTGACCtgaatgaa  <  1:1890651/62‑1 (MQ=255) ggTGGCATGGTGCTACCGGCGATCACAAACGGTTAATTATGACACAAATTGACCtgaatgaa  <  1:204996/62‑1 (MQ=255) ggTGGCATGGTGCTACCGGCGATCACAAACGGTTAATTATGACACAAATTGACCtgaatgaa  <  1:277/62‑1 (MQ=255) ggTGGCATGGTGCTACCGGCGATCACAAACGGTTAATTATGACACAAATTGACCtgaatgaa  <  1:308506/62‑1 (MQ=255) ggTGGCATGGTGCTACCGGCGATCACAAACGGTTAATTATGACACAAATTGACCtgaatgaa  <  1:451113/62‑1 (MQ=255) ggTGGCATGGTGCTACCGGCGATCACAAACGGTTAATTATGACACAAATTGACCtgaatgaa  <  1:481064/62‑1 (MQ=255) ggTGGCATGGTGCTACCGGCGATCACAAACGGTTAATTATGACACAAATTGACCtgaatgaa  <  1:562476/62‑1 (MQ=255) ggTGGCATGGTGCTACCGGCGATCACAAACGGTTAATTATGACACAAATTGACCtgaatgaa  <  1:1723381/62‑1 (MQ=255) ggTGGCATGGTGCTACCGGCGATCACAAACGGTTAATTATGACACAAATTGACCtgaatgaa  <  1:615791/62‑1 (MQ=255) ggTGGCATGGTGCTACCGGCGATCACAAACGGTTAATTATGACACAAATTGACCtgaatgaa  <  1:639074/62‑1 (MQ=255) ggTGGCATGGTGCTACCGGCGATCACAAACGGTTAATTATGACACAAATTGACCtgaatgaa  <  1:689526/62‑1 (MQ=255) ggTGGCATGGTGCTACCGGCGATCACAAACGGTTAATTATGACACAAATTGACCtgaatgaa  <  1:721990/62‑1 (MQ=255) ggTGGCATGGTGCTACCGGCGATCACAAACGGTTAATTATGACACAAATTGACCtgaatgaa  <  1:779447/62‑1 (MQ=255) ggTGGCATGGTGCTACCGGCGATCACAAACGGTTAATTATGACACAAATTGACCtgaatgaa  <  1:87231/62‑1 (MQ=255) ggTGGCATGGTGCTACCGGCGATCACAAACGGTTAATTATGACACAAATTGACCtgaatgaa  <  1:905212/62‑1 (MQ=255) ggTGGCATGGTGCTACCGGCGATCACAAACGGTTAATTATGACACAAATTGACCtgaatgaa  <  1:983507/62‑1 (MQ=255) ggTGGCATGGTGCTACCGGCGATCACAAACGGTTAATTATGACACAAATTGACCtgaatgaa  <  1:1371509/62‑1 (MQ=255) ggTGGCATGGTGCTACCGGCGATCACAAACGGTTAATTATGACACAAATTGACCtgaatgaa  <  1:1064310/62‑1 (MQ=255) ggTGGCATGGTGCTACCGGCGATCACAAACGGTTAATTATGACACAAATTGACCtgaatgaa  <  1:1129557/62‑1 (MQ=255) ggTGGCATGGTGCTACCGGCGATCACAAACGGTTAATTATGACACAAATTGACCtgaatgaa  <  1:1142638/62‑1 (MQ=255) ggTGGCATGGTGCTACCGGCGATCACAAACGGTTAATTATGACACAAATTGACCtgaatgaa  <  1:1199255/62‑1 (MQ=255) ggTGGCATGGTGCTACCGGCGATCACAAACGGTTAATTATGACACAAATTGACCtgaatgaa  <  1:1199413/62‑1 (MQ=255) ggTGGCATGGTGCTACCGGCGATCACAAACGGTTAATTATGACACAAATTGACCtgaatgaa  <  1:1220750/62‑1 (MQ=255) ggTGGCATGGTGCTACCGGCGATCACAAACGGTTAATTATGACACAAATTGACCtgaatgaa  <  1:1225298/62‑1 (MQ=255) ggTGGCATGGTGCTACCGGCGATCACAAACGGTTAATTATGACACAAATTGACCtgaatgaa  <  1:1237372/62‑1 (MQ=255) ggTGGCATGGTGCTACCGGCGATCACAAACGGTTAATTATGACACAAATTGACCtgaatgaa  <  1:1329748/62‑1 (MQ=255) ggTGGCATGGTGCTACCGGCGATCACAAACGGTTAATTATGACACAAATTGACCtgaatgaa  <  1:1008203/62‑1 (MQ=255) ggTGGCATGGTGCTACCGGCGATCACAAACGGTTAATTATGACACAAATTGACCtgaatgaa  <  1:1412968/62‑1 (MQ=255) ggTGGCATGGTGCTACCGGCGATCACAAACGGTTAATTATGACACAAATTGACCtgaatgaa  <  1:1415145/62‑1 (MQ=255) ggTGGCATGGTGCTACCGGCGATCACAAACGGTTAATTATGACACAAATTGACCtgaatgaa  <  1:1457938/62‑1 (MQ=255) ggTGGCATGGTGCTACCGGCGATCACAAACGGTTAATTATGACACAAATTGACCtgaatgaa  <  1:1468306/62‑1 (MQ=255) ggTGGCATGGTGCTACCGGCGATCACAAACGGTTAATTATGACACAAATTGACCtgaatgaa  <  1:1554852/62‑1 (MQ=255) ggTGGCATGGTGCTACCGGCGATCACAAACGGTTAATTATGACACAAATTGACCtgaatgaa  <  1:1562752/62‑1 (MQ=255) ggTGGCATGGTGCTACCGGCGATCACAAACGGTTAATTATGACACAAATTGACCtgaatgaa  <  1:1583818/62‑1 (MQ=255) ggTGGCATGGTGCTACCGGCGATCACAAACGGTTAATTATGACACAAATTGACCtgaatgaa  <  1:1706031/62‑1 (MQ=255) ggTGGCATGGTGCTACCGGCGATCACAAACGGATAATTATGACACAAATTGACCtgaatgaa  <  1:1809256/62‑1 (MQ=255) |                                                              GGTGGCATGGTGCTACCGGCGATCACAAACGGTTAATTATGACACAAATTGACCTGAATGAA  >  minE/2812778‑2812839

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑