Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2839827	2840116	290	104 [0]	[0] 50	ampC	beta‑lactamase/D‑alanine carboxypeptidase

GTTGTGTTCCTGGAGCCCATGCAGGCTGCCAGTTTTGATAGAAGCGCAGCAAGTCGCTTGAG  >  minE/2840117‑2840178 |                                                              gTTGTGTTCCTGGAGCCCTTGCAGGCTGCCAGTTTTGATAGAAGCGCAGCAAGTCGCTTGAg  >  1:1547196/1‑62 (MQ=255) gTTGTGTTCCTGGAGCCCATGCAGGGTGCCAGTTTTGATAGAAGCGCAGCAAGTCGCTTg    >  1:1233147/1‑60 (MQ=255) gTTGTGTTCCTGGAGCCCATGCAGGCTGCCAGTTTTGATAGAAGCGCAGCAAGTCGCTTGa   >  1:106554/1‑61 (MQ=255) gTTGTGTTCCTGGAGCCCATGCAGGCTGCCAGTTTTGATAGAAGCGCAGCAAGTCGCTTGAg  >  1:1888733/1‑62 (MQ=255) gTTGTGTTCCTGGAGCCCATGCAGGCTGCCAGTTTTGATAGAAGCGCAGCAAGTCGCTTGAg  >  1:963980/1‑62 (MQ=255) gTTGTGTTCCTGGAGCCCATGCAGGCTGCCAGTTTTGATAGAAGCGCAGCAAGTCGCTTGAg  >  1:189149/1‑62 (MQ=255) gTTGTGTTCCTGGAGCCCATGCAGGCTGCCAGTTTTGATAGAAGCGCAGCAAGTCGCTTGAg  >  1:226820/1‑62 (MQ=255) gTTGTGTTCCTGGAGCCCATGCAGGCTGCCAGTTTTGATAGAAGCGCAGCAAGTCGCTTGAg  >  1:2413/1‑62 (MQ=255) gTTGTGTTCCTGGAGCCCATGCAGGCTGCCAGTTTTGATAGAAGCGCAGCAAGTCGCTTGAg  >  1:263298/1‑62 (MQ=255) gTTGTGTTCCTGGAGCCCATGCAGGCTGCCAGTTTTGATAGAAGCGCAGCAAGTCGCTTGAg  >  1:335845/1‑62 (MQ=255) gTTGTGTTCCTGGAGCCCATGCAGGCTGCCAGTTTTGATAGAAGCGCAGCAAGTCGCTTGAg  >  1:422999/1‑62 (MQ=255) gTTGTGTTCCTGGAGCCCATGCAGGCTGCCAGTTTTGATAGAAGCGCAGCAAGTCGCTTGAg  >  1:497603/1‑62 (MQ=255) gTTGTGTTCCTGGAGCCCATGCAGGCTGCCAGTTTTGATAGAAGCGCAGCAAGTCGCTTGAg  >  1:555639/1‑62 (MQ=255) gTTGTGTTCCTGGAGCCCATGCAGGCTGCCAGTTTTGATAGAAGCGCAGCAAGTCGCTTGAg  >  1:584594/1‑62 (MQ=255) gTTGTGTTCCTGGAGCCCATGCAGGCTGCCAGTTTTGATAGAAGCGCAGCAAGTCGCTTGAg  >  1:611209/1‑62 (MQ=255) gTTGTGTTCCTGGAGCCCATGCAGGCTGCCAGTTTTGATAGAAGCGCAGCAAGTCGCTTGAg  >  1:631721/1‑62 (MQ=255) gTTGTGTTCCTGGAGCCCATGCAGGCTGCCAGTTTTGATAGAAGCGCAGCAAGTCGCTTGAg  >  1:661468/1‑62 (MQ=255) gTTGTGTTCCTGGAGCCCATGCAGGCTGCCAGTTTTGATAGAAGCGCAGCAAGTCGCTTGAg  >  1:670650/1‑62 (MQ=255) gTTGTGTTCCTGGAGCCCATGCAGGCTGCCAGTTTTGATAGAAGCGCAGCAAGTCGCTTGAg  >  1:68283/1‑62 (MQ=255) gTTGTGTTCCTGGAGCCCATGCAGGCTGCCAGTTTTGATAGAAGCGCAGCAAGTCGCTTGAg  >  1:708763/1‑62 (MQ=255) gTTGTGTTCCTGGAGCCCATGCAGGCTGCCAGTTTTGATAGAAGCGCAGCAAGTCGCTTGAg  >  1:731626/1‑62 (MQ=255) gTTGTGTTCCTGGAGCCCATGCAGGCTGCCAGTTTTGATAGAAGCGCAGCAAGTCGCTTGAg  >  1:8370/1‑62 (MQ=255) gTTGTGTTCCTGGAGCCCATGCAGGCTGCCAGTTTTGATAGAAGCGCAGCAAGTCGCTTGAg  >  1:911288/1‑62 (MQ=255) gTTGTGTTCCTGGAGCCCATGCAGGCTGCCAGTTTTGATAGAAGCGCAGCAAGTCGCTTGAg  >  1:91755/1‑62 (MQ=255) gTTGTGTTCCTGGAGCCCATGCAGGCTGCCAGTTTTGATAGAAGCGCAGCAAGTCGCTTGAg  >  1:9455/1‑62 (MQ=255) gTTGTGTTCCTGGAGCCCATGCAGGCTGCCAGTTTTGATAGAAGCGCAGCAAGTCGCTTGAg  >  1:104667/1‑62 (MQ=255) gTTGTGTTCCTGGAGCCCATGCAGGCTGCCAGTTTTGATAGAAGCGCAGCAAGTCGCTTGAg  >  1:1455160/1‑62 (MQ=255) gTTGTGTTCCTGGAGCCCATGCAGGCTGCCAGTTTTGATAGAAGCGCAGCAAGTCGCTTGAg  >  1:1081725/1‑62 (MQ=255) gTTGTGTTCCTGGAGCCCATGCAGGCTGCCAGTTTTGATAGAAGCGCAGCAAGTCGCTTGAg  >  1:1183040/1‑62 (MQ=255) gTTGTGTTCCTGGAGCCCATGCAGGCTGCCAGTTTTGATAGAAGCGCAGCAAGTCGCTTGAg  >  1:1191688/1‑62 (MQ=255) gTTGTGTTCCTGGAGCCCATGCAGGCTGCCAGTTTTGATAGAAGCGCAGCAAGTCGCTTGAg  >  1:1284180/1‑62 (MQ=255) gTTGTGTTCCTGGAGCCCATGCAGGCTGCCAGTTTTGATAGAAGCGCAGCAAGTCGCTTGAg  >  1:1346157/1‑62 (MQ=255) gTTGTGTTCCTGGAGCCCATGCAGGCTGCCAGTTTTGATAGAAGCGCAGCAAGTCGCTTGAg  >  1:1369223/1‑62 (MQ=255) gTTGTGTTCCTGGAGCCCATGCAGGCTGCCAGTTTTGATAGAAGCGCAGCAAGTCGCTTGAg  >  1:1375648/1‑62 (MQ=255) gTTGTGTTCCTGGAGCCCATGCAGGCTGCCAGTTTTGATAGAAGCGCAGCAAGTCGCTTGAg  >  1:1379618/1‑62 (MQ=255) gTTGTGTTCCTGGAGCCCATGCAGGCTGCCAGTTTTGATAGAAGCGCAGCAAGTCGCTTGAg  >  1:1396428/1‑62 (MQ=255) gTTGTGTTCCTGGAGCCCATGCAGGCTGCCAGTTTTGATAGAAGCGCAGCAAGTCGCTTGAg  >  1:1409947/1‑62 (MQ=255) gTTGTGTTCCTGGAGCCCATGCAGGCTGCCAGTTTTGATAGAAGCGCAGCAAGTCGCTTGAg  >  1:1872423/1‑62 (MQ=255) gTTGTGTTCCTGGAGCCCATGCAGGCTGCCAGTTTTGATAGAAGCGCAGCAAGTCGCTTGAg  >  1:1457226/1‑62 (MQ=255) gTTGTGTTCCTGGAGCCCATGCAGGCTGCCAGTTTTGATAGAAGCGCAGCAAGTCGCTTGAg  >  1:1525276/1‑62 (MQ=255) gTTGTGTTCCTGGAGCCCATGCAGGCTGCCAGTTTTGATAGAAGCGCAGCAAGTCGCTTGAg  >  1:161151/1‑62 (MQ=255) gTTGTGTTCCTGGAGCCCATGCAGGCTGCCAGTTTTGATAGAAGCGCAGCAAGTCGCTTGAg  >  1:1615835/1‑62 (MQ=255) gTTGTGTTCCTGGAGCCCATGCAGGCTGCCAGTTTTGATAGAAGCGCAGCAAGTCGCTTGAg  >  1:172533/1‑62 (MQ=255) gTTGTGTTCCTGGAGCCCATGCAGGCTGCCAGTTTTGATAGAAGCGCAGCAAGTCGCTTGAg  >  1:1757288/1‑62 (MQ=255) gTTGTGTTCCTGGAGCCCATGCAGGCTGCCAGTTTTGATAGAAGCGCAGCAAGTCGCTTGAg  >  1:1758871/1‑62 (MQ=255) gTTGTGTTCCTGGAGCCCATGCAGGCTGCCAGTTTTGATAGAAGCGCAGCAAGTCGCTTGAg  >  1:1767059/1‑62 (MQ=255) gTTGTGTTCCTGGAGCCCATGCAGGCTGCCAGTTTTGATAGAAGCGCAGCAAGTCGCTTGAg  >  1:1801402/1‑62 (MQ=255) gTTGTGTTCCTGGAGCCCATGCAGGCTGCCAGTTTTGATAGAAGCGCAGCAAGTCGCTTGAg  >  1:1802474/1‑62 (MQ=255) gTTGTGTTCCTGGAGCCCATGCAGGCTGCCAGTTTTGATAGAAGCGCAGCAAGTCGCTTGAg  >  1:1845862/1‑62 (MQ=255) gTTGTGTTCCTGGAGCCCAGGCAGGCTCCCAGTTTTGATAGAAGCGCAGCAAGTCGCTTGAg  >  1:77061/1‑62 (MQ=255) |                                                              GTTGTGTTCCTGGAGCCCATGCAGGCTGCCAGTTTTGATAGAAGCGCAGCAAGTCGCTTGAG  >  minE/2840117‑2840178

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑