Missing coverage evidence...
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GCAGGTACGTGGATTTTCAGATCGTGCATCGCGTGGTGCATACGGTGTAAACCACACCACAG  >  minE/2840742‑2840803 |                                                              gCAGGTACGTGGATTTTCAGATCGTGCATCGCGTGGTGCATACGGTGTAAACCACACCACAg  <  1:1796156/62‑1 (MQ=255) gCAGGTACGTGGATTTTCAGATCGTGCATCGCGTGGTGCATACGGTGTAAACCACACCACAg  <  1:976558/62‑1 (MQ=255) gCAGGTACGTGGATTTTCAGATCGTGCATCGCGTGGTGCATACGGTGTAAACCACACCACAg  <  1:857364/62‑1 (MQ=255) gCAGGTACGTGGATTTTCAGATCGTGCATCGCGTGGTGCATACGGTGTAAACCACACCACAg  <  1:795333/62‑1 (MQ=255) gCAGGTACGTGGATTTTCAGATCGTGCATCGCGTGGTGCATACGGTGTAAACCACACCACAg  <  1:720358/62‑1 (MQ=255) gCAGGTACGTGGATTTTCAGATCGTGCATCGCGTGGTGCATACGGTGTAAACCACACCACAg  <  1:700171/62‑1 (MQ=255) gCAGGTACGTGGATTTTCAGATCGTGCATCGCGTGGTGCATACGGTGTAAACCACACCACAg  <  1:645995/62‑1 (MQ=255) gCAGGTACGTGGATTTTCAGATCGTGCATCGCGTGGTGCATACGGTGTAAACCACACCACAg  <  1:590426/62‑1 (MQ=255) gCAGGTACGTGGATTTTCAGATCGTGCATCGCGTGGTGCATACGGTGTAAACCACACCACAg  <  1:431340/62‑1 (MQ=255) gCAGGTACGTGGATTTTCAGATCGTGCATCGCGTGGTGCATACGGTGTAAACCACACCACAg  <  1:316489/62‑1 (MQ=255) gCAGGTACGTGGATTTTCAGATCGTGCATCGCGTGGTGCATACGGTGTAAACCACACCACAg  <  1:311288/62‑1 (MQ=255) gCAGGTACGTGGATTTTCAGATCGTGCATCGCGTGGTGCATACGGTGTAAACCACACCACAg  <  1:267535/62‑1 (MQ=255) gCAGGTACGTGGATTTTCAGATCGTGCATCGCGTGGTGCATACGGTGTAAACCACACCACAg  <  1:198011/62‑1 (MQ=255) gCAGGTACGTGGATTTTCAGATCGTGCATCGCGTGGTGCATACGGTGTAAACCACACCACAg  <  1:186139/62‑1 (MQ=255) gCAGGTACGTGGATTTTCAGATCGTGCATCGCGTGGTGCATACGGTGTAAACCACACCACAg  <  1:1037930/62‑1 (MQ=255) gCAGGTACGTGGATTTTCAGATCGTGCATCGCGTGGTGCATACGGTGTAAACCACACCACAg  <  1:1651961/62‑1 (MQ=255) gCAGGTACGTGGATTTTCAGATCGTGCATCGCGTGGTGCATACGGTGTAAACCACACCACAg  <  1:1589509/62‑1 (MQ=255) gCAGGTACGTGGATTTTCAGATCGTGCATCGCGTGGTGCATACGGTGTAAACCACACCACAg  <  1:1565462/62‑1 (MQ=255) gCAGGTACGTGGATTTTCAGATCGTGCATCGCGTGGTGCATACGGTGTAAACCACACCACAg  <  1:1547062/62‑1 (MQ=255) gCAGGTACGTGGATTTTCAGATCGTGCATCGCGTGGTGCATACGGTGTAAACCACACCACAg  <  1:1430817/62‑1 (MQ=255) gCAGGTACGTGGATTTTCAGATCGTGCATCGCGTGGTGCATACGGTGTAAACCACACCACAg  <  1:1375499/62‑1 (MQ=255) gCAGGTACGTGGATTTTCAGATCGTGCATCGCGTGGTGCATACGGTGTAAACCACACCACAg  <  1:1343173/62‑1 (MQ=255) gCAGGTACGTGGATTTTCAGATCGTGCATCGCGTGGTGCATACGGTGTAAACCACACCACAg  <  1:1331025/62‑1 (MQ=255) gCAGGTACGTGGATTTTCAGATCGTGCATCGCGTGGTGCATACGGTGTAAACCACACCACAg  <  1:1285030/62‑1 (MQ=255) gCAGGTACGTGGATTTTCAGATCGTGCATCGCGTGGTGCATACGGTGTAAACCACACCACAg  <  1:1216723/62‑1 (MQ=255) gCAGGTACGTGGATTTTCAGATCGTGCATCGCGTGGTGCATACGGTGTAAACCACACCACAg  <  1:1101932/62‑1 (MQ=255) gCAGGTACGTGGATTTTCAGATCGTGCATCGCGTGGTGCATACGGTGTAAACCACACCACAg  <  1:1080167/62‑1 (MQ=255) gCAGGTACGTGGATTTTCAGATCGTGCATCGCGGGGTGCATACGGTGTAAACCACACCACAg  <  1:1485744/62‑1 (MQ=255) gCAGGTACGTGGAATTTCAGATCGGGCATCGCGTGGTGCATACGGTGTAAACCACACCACAg  <  1:30435/62‑1 (MQ=255) |                                                              GCAGGTACGTGGATTTTCAGATCGTGCATCGCGTGGTGCATACGGTGTAAACCACACCACAG  >  minE/2840742‑2840803

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑