Missing coverage evidence...
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TTGGCTGCTTCCGCCTTATCGGCTGCATCCGCTTCGCCACCGTAAACGCGTTTAGCTGGC  >  minE/2842197‑2842256 |                                                            ttGGCTGCTTCCGCCTTATCGGCTGCATCCGCTTTGCCACCGTAAACGCGTTTAGCTggc  >  1:826254/1‑60 (MQ=255) ttGGCTGCTTCCGCCTTATCGGCTGCATCCGCTTCg                          >  1:1301150/1‑36 (MQ=255) ttGGCTGCTTCCGCCTTATCGGCTGCATCCGCTTCGcc                        >  1:1826281/1‑38 (MQ=255) ttGGCTGCTTCCGCCTTATCGGCTGCATCCGCTTCGCCACCGTAAACGCGTTTAGCTggc  >  1:282379/1‑60 (MQ=255) ttGGCTGCTTCCGCCTTATCGGCTGCATCCGCTTCGCCACCGTAAACGCGTTTAGCTggc  >  1:49574/1‑60 (MQ=255) ttGGCTGCTTCCGCCTTATCGGCTGCATCCGCTTCGCCACCGTAAACGCGTTTAGCTggc  >  1:469736/1‑60 (MQ=255) ttGGCTGCTTCCGCCTTATCGGCTGCATCCGCTTCGCCACCGTAAACGCGTTTAGCTggc  >  1:457265/1‑60 (MQ=255) ttGGCTGCTTCCGCCTTATCGGCTGCATCCGCTTCGCCACCGTAAACGCGTTTAGCTggc  >  1:455754/1‑60 (MQ=255) ttGGCTGCTTCCGCCTTATCGGCTGCATCCGCTTCGCCACCGTAAACGCGTTTAGCTggc  >  1:365813/1‑60 (MQ=255) 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TTGGCTGCTTCCGCCTTATCGGCTGCATCCGCTTCGCCACCGTAAACGCGTTTAGCTGGC  >  minE/2842197‑2842256

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑