Missing coverage evidence...
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CTTCCTGGTACCGCAGGGTAAAGCTGTTCCAGCTACCAAGAAAAACATTGAATTCTTCGAAG  >  minE/2874233‑2874294 |                                                              cTTCCTGGTACCTCAGGGTAAAGCTGTTCCAGCTACCAAGAAAAACATTGAATTCTTCGAAg  >  1:967291/1‑62 (MQ=255) cTTCCTGGTACCGCAGGGTAAAGCTGTTCCAGCTACCAAGAAAAACATTGAATTCTTCGaa   >  1:1282409/1‑61 (MQ=255) cTTCCTGGTACCGCAGGGTAAAGCTGTTCCAGCTACCAAGAAAAACATTGAATTCTTCGaa   >  1:1286958/1‑61 (MQ=255) cTTCCTGGTACCGCAGGGTAAAGCTGTTCCAGCTACCAAGAAAAACATTGAATTCTTCGAAg  >  1:767852/1‑62 (MQ=255) cTTCCTGGTACCGCAGGGTAAAGCTGTTCCAGCTACCAAGAAAAACATTGAATTCTTCGAAg  >  1:228654/1‑62 (MQ=255) cTTCCTGGTACCGCAGGGTAAAGCTGTTCCAGCTACCAAGAAAAACATTGAATTCTTCGAAg  >  1:495252/1‑62 (MQ=255) cTTCCTGGTACCGCAGGGTAAAGCTGTTCCAGCTACCAAGAAAAACATTGAATTCTTCGAAg  >  1:584664/1‑62 (MQ=255) cTTCCTGGTACCGCAGGGTAAAGCTGTTCCAGCTACCAAGAAAAACATTGAATTCTTCGAAg  >  1:599601/1‑62 (MQ=255) cTTCCTGGTACCGCAGGGTAAAGCTGTTCCAGCTACCAAGAAAAACATTGAATTCTTCGAAg  >  1:643499/1‑62 (MQ=255) cTTCCTGGTACCGCAGGGTAAAGCTGTTCCAGCTACCAAGAAAAACATTGAATTCTTCGAAg  >  1:670219/1‑62 (MQ=255) cTTCCTGGTACCGCAGGGTAAAGCTGTTCCAGCTACCAAGAAAAACATTGAATTCTTCGAAg  >  1:722732/1‑62 (MQ=255) cTTCCTGGTACCGCAGGGTAAAGCTGTTCCAGCTACCAAGAAAAACATTGAATTCTTCGAAg  >  1:741342/1‑62 (MQ=255) cTTCCTGGTACCGCAGGGTAAAGCTGTTCCAGCTACCAAGAAAAACATTGAATTCTTCGAAg  >  1:174168/1‑62 (MQ=255) cTTCCTGGTACCGCAGGGTAAAGCTGTTCCAGCTACCAAGAAAAACATTGAATTCTTCGAAg  >  1:792560/1‑62 (MQ=255) cTTCCTGGTACCGCAGGGTAAAGCTGTTCCAGCTACCAAGAAAAACATTGAATTCTTCGAAg  >  1:900589/1‑62 (MQ=255) cTTCCTGGTACCGCAGGGTAAAGCTGTTCCAGCTACCAAGAAAAACATTGAATTCTTCGAAg  >  1:90273/1‑62 (MQ=255) cTTCCTGGTACCGCAGGGTAAAGCTGTTCCAGCTACCAAGAAAAACATTGAATTCTTCGAAg  >  1:974028/1‑62 (MQ=255) cTTCCTGGTACCGCAGGGTAAAGCTGTTCCAGCTACCAAGAAAAACATTGAATTCTTCGAAg  >  1:1858340/1‑62 (MQ=255) cTTCCTGGTACCGCAGGGTAAAGCTGTTCCAGCTACCAAGAAAAACATTGAATTCTTCGAAg  >  1:1119537/1‑62 (MQ=255) cTTCCTGGTACCGCAGGGTAAAGCTGTTCCAGCTACCAAGAAAAACATTGAATTCTTCGAAg  >  1:1671748/1‑62 (MQ=255) cTTCCTGGTACCGCAGGGTAAAGCTGTTCCAGCTACCAAGAAAAACATTGAATTCTTCGAAg  >  1:1660349/1‑62 (MQ=255) cTTCCTGGTACCGCAGGGTAAAGCTGTTCCAGCTACCAAGAAAAACATTGAATTCTTCGAAg  >  1:1626573/1‑62 (MQ=255) cTTCCTGGTACCGCAGGGTAAAGCTGTTCCAGCTACCAAGAAAAACATTGAATTCTTCGAAg  >  1:1546221/1‑62 (MQ=255) cTTCCTGGTACCGCAGGGTAAAGCTGTTCCAGCTACCAAGAAAAACATTGAATTCTTCGAAg  >  1:1512088/1‑62 (MQ=255) cTTCCTGGTACCGCAGGGTAAAGCTGTTCCAGCTACCAAGAAAAACATTGAATTCTTCGAAg  >  1:1511794/1‑62 (MQ=255) cTTCCTGGTACCGCAGGGTAAAGCTGTTCCAGCTACCAAGAAAAACATTGAATTCTTCGAAg  >  1:1338185/1‑62 (MQ=255) cTTCCTGGTACCGCAGGGTAAAGCTGTTCCAGCTACCAAGAAAAACATTGAATTCTTCGAAg  >  1:129073/1‑62 (MQ=255) cTTCCTGGTACCGCAGGGTAAAGCTGTTCCAGCTACCAAGAAAAACATTGAATTCTTCGAAg  >  1:1261936/1‑62 (MQ=255) cTTCCTGGTACCGCAGGGTAAAGCTGTTCCAGCTACCAAGAAAAACATTGAATTCTTCGAAg  >  1:1176980/1‑62 (MQ=255) cTTCCTGGTACCGCAGGGTAAAGCTGTTCCAGCTACCAAGAAAAACATTGAATTCTTCGAAg  >  1:1172054/1‑62 (MQ=255) cTTCCTGGTACCGCAGGGTAAAGCTGTTCCAGCTACCAAGAAAAACATTGAATTCTTCGAAg  >  1:1148854/1‑62 (MQ=255) |                                                              CTTCCTGGTACCGCAGGGTAAAGCTGTTCCAGCTACCAAGAAAAACATTGAATTCTTCGAAG  >  minE/2874233‑2874294

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑