Missing coverage evidence...
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TTCCACGCGCTCGCCATAATGGGCGAAAAAGGCCTCGGTTATGGCCTCGCAAACCTGCTCAT  >  minE/2969757‑2969818 |                                                              ttCCACGCGCTCGCCATAATGGGCGAAAAAGGCTTCGGTTATGGCCTCGCAAACCTGCTCAt  <  1:1307939/62‑1 (MQ=255) ttCCACGCGCTCGCCATAATGGGCGAAAAAGGCCTCGGTTATGGGCTCGCAAACCTGCTCAt  <  1:1394488/62‑1 (MQ=255) ttCCACGCGCTCGCCATAATGGGCGAAAAAGGCCTCGGTTATGGCCTCGCAAACCTGCTCAt  <  1:716527/62‑1 (MQ=255) ttCCACGCGCTCGCCATAATGGGCGAAAAAGGCCTCGGTTATGGCCTCGCAAACCTGCTCAt  <  1:223262/62‑1 (MQ=255) ttCCACGCGCTCGCCATAATGGGCGAAAAAGGCCTCGGTTATGGCCTCGCAAACCTGCTCAt  <  1:273987/62‑1 (MQ=255) ttCCACGCGCTCGCCATAATGGGCGAAAAAGGCCTCGGTTATGGCCTCGCAAACCTGCTCAt  <  1:292192/62‑1 (MQ=255) ttCCACGCGCTCGCCATAATGGGCGAAAAAGGCCTCGGTTATGGCCTCGCAAACCTGCTCAt  <  1:330042/62‑1 (MQ=255) ttCCACGCGCTCGCCATAATGGGCGAAAAAGGCCTCGGTTATGGCCTCGCAAACCTGCTCAt  <  1:444812/62‑1 (MQ=255) ttCCACGCGCTCGCCATAATGGGCGAAAAAGGCCTCGGTTATGGCCTCGCAAACCTGCTCAt  <  1:497984/62‑1 (MQ=255) ttCCACGCGCTCGCCATAATGGGCGAAAAAGGCCTCGGTTATGGCCTCGCAAACCTGCTCAt  <  1:63/62‑1 (MQ=255) ttCCACGCGCTCGCCATAATGGGCGAAAAAGGCCTCGGTTATGGCCTCGCAAACCTGCTCAt  <  1:710670/62‑1 (MQ=255) ttCCACGCGCTCGCCATAATGGGCGAAAAAGGCCTCGGTTATGGCCTCGCAAACCTGCTCAt  <  1:1876432/62‑1 (MQ=255) ttCCACGCGCTCGCCATAATGGGCGAAAAAGGCCTCGGTTATGGCCTCGCAAACCTGCTCAt  <  1:720100/62‑1 (MQ=255) ttCCACGCGCTCGCCATAATGGGCGAAAAAGGCCTCGGTTATGGCCTCGCAAACCTGCTCAt  <  1:756016/62‑1 (MQ=255) ttCCACGCGCTCGCCATAATGGGCGAAAAAGGCCTCGGTTATGGCCTCGCAAACCTGCTCAt  <  1:780144/62‑1 (MQ=255) ttCCACGCGCTCGCCATAATGGGCGAAAAAGGCCTCGGTTATGGCCTCGCAAACCTGCTCAt  <  1:969343/62‑1 (MQ=255) ttCCACGCGCTCGCCATAATGGGCGAAAAAGGCCTCGGTTATGGCCTCGCAAACCTGCTCAt  <  1:969913/62‑1 (MQ=255) ttCCACGCGCTCGCCATAATGGGCGAAAAAGGCCTCGGTTATGGCCTCGCAAACCTGCTCAt  <  1:209361/62‑1 (MQ=255) ttCCACGCGCTCGCCATAATGGGCGAAAAAGGCCTCGGTTATGGCCTCGCAAACCTGCTCAt  <  1:1193298/62‑1 (MQ=255) ttCCACGCGCTCGCCATAATGGGCGAAAAAGGCCTCGGTTATGGCCTCGCAAACCTGCTCAt  <  1:1776516/62‑1 (MQ=255) ttCCACGCGCTCGCCATAATGGGCGAAAAAGGCCTCGGTTATGGCCTCGCAAACCTGCTCAt  <  1:1747540/62‑1 (MQ=255) ttCCACGCGCTCGCCATAATGGGCGAAAAAGGCCTCGGTTATGGCCTCGCAAACCTGCTCAt  <  1:1654278/62‑1 (MQ=255) ttCCACGCGCTCGCCATAATGGGCGAAAAAGGCCTCGGTTATGGCCTCGCAAACCTGCTCAt  <  1:1596914/62‑1 (MQ=255) ttCCACGCGCTCGCCATAATGGGCGAAAAAGGCCTCGGTTATGGCCTCGCAAACCTGCTCAt  <  1:159047/62‑1 (MQ=255) ttCCACGCGCTCGCCATAATGGGCGAAAAAGGCCTCGGTTATGGCCTCGCAAACCTGCTCAt  <  1:1538370/62‑1 (MQ=255) ttCCACGCGCTCGCCATAATGGGCGAAAAAGGCCTCGGTTATGGCCTCGCAAACCTGCTCAt  <  1:1468882/62‑1 (MQ=255) ttCCACGCGCTCGCCATAATGGGCGAAAAAGGCCTCGGTTATGGCCTCGCAAACCTGCTCAt  <  1:1444547/62‑1 (MQ=255) ttCCACGCGCTCGCCATAATGGGCGAAAAAGGCCTCGGTTATGGCCTCGCAAACCTGCTCAt  <  1:1401703/62‑1 (MQ=255) ttCCACGCGCTCGCCATAATGGGCGAAAAAGGCCTCGGTTATGGCCTCGCAAACCTGCTCAt  <  1:1358310/62‑1 (MQ=255) ttCCACGCGCTCGCCATAATGGGCGAAAAAGGCCTCGGTTATGGCCTCGCAAACCTGCTCAt  <  1:1284593/62‑1 (MQ=255) ttCCACGCGCTCGCCATAATGGGCGAAAAAGGCCTCGGTTATGGCCTCGCAAACCTGCTCAt  <  1:1267927/62‑1 (MQ=255) ttCCACGCGCTCGCCATAATGGGCGAAAAAGGCCTCGGTTATGGCCTCGCAAACCTGCTCAt  <  1:1200882/62‑1 (MQ=255) |                                                              TTCCACGCGCTCGCCATAATGGGCGAAAAAGGCCTCGGTTATGGCCTCGCAAACCTGCTCAT  >  minE/2969757‑2969818

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑