Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	2979738	2979955	218	61 [0]	[1] 99	yjjX	thiamin metabolism associated protein

CTTCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCG  >  minE/2979954‑2980016   |                                                             cTTCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTG‑AGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:31616/62‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:419072/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:570148/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:558339/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:556108/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:547385/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:505130/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:50511/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:500866/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:48514/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:484955/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:470680/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:453605/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:444733/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:578722/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:403498/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:401353/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:376265/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:373216/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:351232/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:315851/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:309521/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:266687/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:251500/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:1890434/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:73881/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:997733/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:984898/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:955768/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:892329/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:878693/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:871438/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:812173/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:80412/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:80235/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:781259/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:760578/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:1845384/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:738689/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:710366/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:705827/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:672700/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:667734/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:660144/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:65659/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:656176/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:642115/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:598718/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:597012/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:1197150/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:139520/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:138766/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:1333857/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:1331981/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:1326505/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:1321870/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:1317427/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:1297155/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:1284801/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:1239482/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:1235540/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:184049/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:118964/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:1182870/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:1171881/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:1160307/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:1150946/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:1131056/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:1110422/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:1087699/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:1044412/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:1041984/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:1034583/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:1454945/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:1006457/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:181441/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:1805066/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:180094/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:1775760/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:1775611/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:1756061/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:1740474/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:1701705/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:1695397/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:1683745/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:1642886/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:1636468/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:1503805/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:1493187/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:1492049/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:1486382/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:1482595/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:1480263/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:1479133/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:1471942/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:1407703/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGATCTCGCGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:1016779/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAAGAGCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:1068636/61‑1 (MQ=255)   tCGCCGAACATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCg  <  1:986158/61‑1 (MQ=255)   |                                                             CTTCGCCGAAGATCTCGTGAAATGCCTGCAGAATGGCCTGAATTTTAGCGGGATTGGTGGTCG  >  minE/2979954‑2980016

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑