Missing coverage evidence...
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CCATAAACGGCTGTAACAGAGTGCGCAGCTCACCTGGGGCCAGTTGCGCCAGCTCCAGCACA  >  minE/295445‑295506 |                                                              ccATAAACGGCTGTAACAGAGTGCGCAGCTCACCTGGGGCCAGTTGCGCCAGCTCCAGcaca  >  1:278533/1‑62 (MQ=255) ccATAAACGGCTGTAACAGAGTGCGCAGCTCACCTGGGGCCAGTTGCGCCAGCTCCAGcaca  >  1:992928/1‑62 (MQ=255) ccATAAACGGCTGTAACAGAGTGCGCAGCTCACCTGGGGCCAGTTGCGCCAGCTCCAGcaca  >  1:935078/1‑62 (MQ=255) ccATAAACGGCTGTAACAGAGTGCGCAGCTCACCTGGGGCCAGTTGCGCCAGCTCCAGcaca  >  1:873778/1‑62 (MQ=255) ccATAAACGGCTGTAACAGAGTGCGCAGCTCACCTGGGGCCAGTTGCGCCAGCTCCAGcaca  >  1:862376/1‑62 (MQ=255) ccATAAACGGCTGTAACAGAGTGCGCAGCTCACCTGGGGCCAGTTGCGCCAGCTCCAGcaca  >  1:771989/1‑62 (MQ=255) ccATAAACGGCTGTAACAGAGTGCGCAGCTCACCTGGGGCCAGTTGCGCCAGCTCCAGcaca  >  1:741359/1‑62 (MQ=255) ccATAAACGGCTGTAACAGAGTGCGCAGCTCACCTGGGGCCAGTTGCGCCAGCTCCAGcaca  >  1:636689/1‑62 (MQ=255) ccATAAACGGCTGTAACAGAGTGCGCAGCTCACCTGGGGCCAGTTGCGCCAGCTCCAGcaca  >  1:531556/1‑62 (MQ=255) ccATAAACGGCTGTAACAGAGTGCGCAGCTCACCTGGGGCCAGTTGCGCCAGCTCCAGcaca  >  1:519842/1‑62 (MQ=255) ccATAAACGGCTGTAACAGAGTGCGCAGCTCACCTGGGGCCAGTTGCGCCAGCTCCAGcaca  >  1:478669/1‑62 (MQ=255) ccATAAACGGCTGTAACAGAGTGCGCAGCTCACCTGGGGCCAGTTGCGCCAGCTCCAGcaca  >  1:461602/1‑62 (MQ=255) ccATAAACGGCTGTAACAGAGTGCGCAGCTCACCTGGGGCCAGTTGCGCCAGCTCCAGcaca  >  1:352120/1‑62 (MQ=255) ccATAAACGGCTGTAACAGAGTGCGCAGCTCACCTGGGGCCAGTTGCGCCAGCTCCAGcaca  >  1:323847/1‑62 (MQ=255) ccATAAACGGCTGTAACAGAGTGCGCAGCTCACCTGGGGCCAGTTGCGCCAGCTCCAGcaca  >  1:1001322/1‑62 (MQ=255) ccATAAACGGCTGTAACAGAGTGCGCAGCTCACCTGGGGCCAGTTGCGCCAGCTCCAGcaca  >  1:1873774/1‑62 (MQ=255) ccATAAACGGCTGTAACAGAGTGCGCAGCTCACCTGGGGCCAGTTGCGCCAGCTCCAGcaca  >  1:1861810/1‑62 (MQ=255) ccATAAACGGCTGTAACAGAGTGCGCAGCTCACCTGGGGCCAGTTGCGCCAGCTCCAGcaca  >  1:185536/1‑62 (MQ=255) ccATAAACGGCTGTAACAGAGTGCGCAGCTCACCTGGGGCCAGTTGCGCCAGCTCCAGcaca  >  1:1782391/1‑62 (MQ=255) ccATAAACGGCTGTAACAGAGTGCGCAGCTCACCTGGGGCCAGTTGCGCCAGCTCCAGcaca  >  1:1606628/1‑62 (MQ=255) ccATAAACGGCTGTAACAGAGTGCGCAGCTCACCTGGGGCCAGTTGCGCCAGCTCCAGcaca  >  1:1442518/1‑62 (MQ=255) ccATAAACGGCTGTAACAGAGTGCGCAGCTCACCTGGGGCCAGTTGCGCCAGCTCCAGcaca  >  1:1344254/1‑62 (MQ=255) ccATAAACGGCTGTAACAGAGTGCGCAGCTCACCTGGGGCCAGTTGCGCCAGCTCCAGcaca  >  1:1009846/1‑62 (MQ=255) ccATAAACGGCTGTAACAGAGTGCGCAGCTCACCTGGGGCCAGTTGCGCCAGCTCCAGcac   >  1:2314/1‑61 (MQ=255) ccATAAACGGCTGTAACAGAGTGCGCAGCTCACCTGGGGCCAGTTGCGCCAGCTCCAGcac   >  1:1713731/1‑61 (MQ=255) ccATAAACGGCTGTAACAGAGTGCGCAGCTCACCTGGGGCCAGTTGCGCCAGCTCCAGcac   >  1:1311027/1‑61 (MQ=255) ccATAAACGGCTGTAACAGAGTGCGCAGCTCACCTGGGGCCAGTTGAGCCAGCTCCAGcaca  >  1:1806960/1‑62 (MQ=255) |                                                              CCATAAACGGCTGTAACAGAGTGCGCAGCTCACCTGGGGCCAGTTGCGCCAGCTCCAGCACA  >  minE/295445‑295506

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑