Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 5271 5357 87 31 [0] [0] 258 yaaX hypothetical protein

Only 100 of 258 total aligned reads displayed.

GTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGAA  >  minE/5358‑5419
|                                                             
gTGGCTATTGCTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:962859/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATTGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:35082/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCGCGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:1288631/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAaac             >  1:627415/1‑51 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACTACATTATGaa  >  1:465476/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTTTGaa  >  1:329806/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATg    >  1:752774/1‑60 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:405419/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:540077/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:524059/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:517923/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:480555/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:1884731/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:190690/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:453847/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:446007/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:425603/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:247974/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:195366/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:392681/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:374481/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:1889973/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:363884/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:210688/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:226011/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:299952/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:280831/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:739522/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:935770/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:92950/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:912487/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:889712/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:864845/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:832555/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:81971/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:813407/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:804333/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:774617/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:762348/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:545899/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:72052/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:713352/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:69582/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:671897/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:643205/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:609360/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:595868/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:589779/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:585478/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:577450/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:1204461/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:1421932/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:1409875/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:1388365/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:1359304/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:135547/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:135143/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:1320545/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:1294055/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:1273402/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:1243225/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:1219032/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:1447569/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:1151793/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:1149732/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:1137294/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:1126887/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:1121040/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:1104158/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:1093487/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:1055497/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:1044908/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:1028324/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:1009738/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:1644496/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:1877109/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:1865748/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:1859628/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:1846236/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:1838168/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:1822466/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:1802433/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:1781195/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:1749254/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:172752/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:1705614/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:1686625/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:1611372/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:160520/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:1595185/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:1552248/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:1538926/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:150474/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:1503289/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:1482299/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:1466238/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:1451929/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGa   >  1:1337263/1‑61 (MQ=255)
gTGGCTATTACTGGGATGGAGATCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:564018/1‑62 (MQ=255)
gTGGCTATTAATGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGaa  >  1:1004012/1‑62 (MQ=255)
|                                                             
GTGGCTATTACTGGGATGGAGGTCACTGGCGCGACCACGGCTGGTGGAAACAACATTATGAA  >  minE/5358‑5419

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑