Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 373595 373898 304 52 [0] [0] 67 fepE regulator of length of O‑antigen component of lipopolysaccharide chains

CAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCT  >  minE/373899‑373960
|                                                             
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCg                         >  1:1102331/1‑39 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTa                      >  1:924787/1‑42 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAg                   >  1:914602/1‑45 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGAt                 >  1:598469/1‑47 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGAc              >  1:1122338/1‑50 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGAt        >  1:523251/1‑56 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTc   >  1:731056/1‑61 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:194826/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:336559/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:33150/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:310354/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:306459/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:30017/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:295416/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:271634/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:271458/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:467318/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:1898870/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:1849720/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:1811758/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:179706/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:341100/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:412830/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:443834/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:1044202/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:558181/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:588824/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:606157/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:609450/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:669971/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:766686/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:798542/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:819842/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:946391/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:1748643/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:1027190/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:1049360/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:109593/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:1104963/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:1133567/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:1139710/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:114574/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:1170549/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:1204766/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:1228144/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:1246596/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:1327325/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:1352088/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:1393120/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:142859/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:1766801/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:172857/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:1683040/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:1639844/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:1629917/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:1604468/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:1580991/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:155339/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:154754/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:1510869/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:1509334/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:1476432/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:1448058/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:1403935/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGGTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:120404/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCAGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCt  >  1:1295795/1‑62 (MQ=255)
cAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGCTCAGGCCGTTAAAg                   >  1:946602/1‑45 (MQ=255)
|                                                             
CAGGAATTAAAAAGCCCGTTTACAGTAATGGTCAGGCCGTTAAAGATGACCCCGATTTTTCT  >  minE/373899‑373960

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: