Missing coverage evidence...
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CATCCGGCAAGGAACAGACAAACAGTTTCAAACGCTAAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATC  >  minE/431097‑431158 |                                                              cATCCGGCAAGGAACAGACAAACAGTTTCACACGCTAAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATc  >  1:1784120/1‑62 (MQ=255) cATCCGGCAAGGAACAGACAAACAGTTTCAAACGCTa                           >  1:1658766/1‑37 (MQ=255) cATCCGGCAAGGAACAGACAAACAGTTTCAAACGCTAAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATc  >  1:501766/1‑62 (MQ=255) cATCCGGCAAGGAACAGACAAACAGTTTCAAACGCTAAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATc  >  1:1021895/1‑62 (MQ=255) cATCCGGCAAGGAACAGACAAACAGTTTCAAACGCTAAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATc  >  1:214986/1‑62 (MQ=255) cATCCGGCAAGGAACAGACAAACAGTTTCAAACGCTAAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATc  >  1:262247/1‑62 (MQ=255) cATCCGGCAAGGAACAGACAAACAGTTTCAAACGCTAAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATc  >  1:318817/1‑62 (MQ=255) cATCCGGCAAGGAACAGACAAACAGTTTCAAACGCTAAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATc  >  1:370593/1‑62 (MQ=255) cATCCGGCAAGGAACAGACAAACAGTTTCAAACGCTAAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATc  >  1:375470/1‑62 (MQ=255) cATCCGGCAAGGAACAGACAAACAGTTTCAAACGCTAAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATc  >  1:4169/1‑62 (MQ=255) cATCCGGCAAGGAACAGACAAACAGTTTCAAACGCTAAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATc  >  1:1888277/1‑62 (MQ=255) cATCCGGCAAGGAACAGACAAACAGTTTCAAACGCTAAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATc  >  1:615807/1‑62 (MQ=255) cATCCGGCAAGGAACAGACAAACAGTTTCAAACGCTAAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATc  >  1:622679/1‑62 (MQ=255) cATCCGGCAAGGAACAGACAAACAGTTTCAAACGCTAAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATc  >  1:626133/1‑62 (MQ=255) cATCCGGCAAGGAACAGACAAACAGTTTCAAACGCTAAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATc  >  1:673452/1‑62 (MQ=255) cATCCGGCAAGGAACAGACAAACAGTTTCAAACGCTAAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATc  >  1:741203/1‑62 (MQ=255) cATCCGGCAAGGAACAGACAAACAGTTTCAAACGCTAAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATc  >  1:824545/1‑62 (MQ=255) cATCCGGCAAGGAACAGACAAACAGTTTCAAACGCTAAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATc  >  1:84033/1‑62 (MQ=255) cATCCGGCAAGGAACAGACAAACAGTTTCAAACGCTAAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATc  >  1:872342/1‑62 (MQ=255) cATCCGGCAAGGAACAGACAAACAGTTTCAAACGCTAAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATc  >  1:910919/1‑62 (MQ=255) cATCCGGCAAGGAACAGACAAACAGTTTCAAACGCTAAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATc  >  1:1421293/1‑62 (MQ=255) cATCCGGCAAGGAACAGACAAACAGTTTCAAACGCTAAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATc  >  1:1037454/1‑62 (MQ=255) cATCCGGCAAGGAACAGACAAACAGTTTCAAACGCTAAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATc  >  1:1214450/1‑62 (MQ=255) cATCCGGCAAGGAACAGACAAACAGTTTCAAACGCTAAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATc  >  1:1220550/1‑62 (MQ=255) cATCCGGCAAGGAACAGACAAACAGTTTCAAACGCTAAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATc  >  1:124567/1‑62 (MQ=255) cATCCGGCAAGGAACAGACAAACAGTTTCAAACGCTAAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATc  >  1:1289748/1‑62 (MQ=255) cATCCGGCAAGGAACAGACAAACAGTTTCAAACGCTAAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATc  >  1:1309399/1‑62 (MQ=255) cATCCGGCAAGGAACAGACAAACAGTTTCAAACGCTAAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATc  >  1:1387955/1‑62 (MQ=255) cATCCGGCAAGGAACAGACAAACAGTTTCAAACGCTAAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATc  >  1:1800603/1‑62 (MQ=255) cATCCGGCAAGGAACAGACAAACAGTTTCAAACGCTAAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATc  >  1:1478736/1‑62 (MQ=255) cATCCGGCAAGGAACAGACAAACAGTTTCAAACGCTAAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATc  >  1:149880/1‑62 (MQ=255) cATCCGGCAAGGAACAGACAAACAGTTTCAAACGCTAAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATc  >  1:1538284/1‑62 (MQ=255) cATCCGGCAAGGAACAGACAAACAGTTTCAAACGCTAAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATc  >  1:1584375/1‑62 (MQ=255) cATCCGGCAAGGAACAGACAAACAGTTTCAAACGCTAAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATc  >  1:1653812/1‑62 (MQ=255) cATCCGGCAAGGAACAGACAAACAGTTTCAAACGCTAAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATc  >  1:1658423/1‑62 (MQ=255) cATCCGGCAAGGAACAGACAAACAGTTTCAAACGCTAAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATc  >  1:1720642/1‑62 (MQ=255) cATCCGGCAAGGAACAGACAAACAGTTTCAAACGCTAAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATc  >  1:1763762/1‑62 (MQ=255) cATCCGGCAAGGAACAGACAAACAGTTTCAAACGCTAAATTGCCTGATGCACTACGCTTATc  >  1:41432/1‑62 (MQ=255) cATCCGGCAAGGAACAGACAAACAGTTTCAAACGCTAAATTGCATGAt                >  1:711206/1‑48 (MQ=255) cATACGGCAAGGAACAGACAAACAGTTTCAAACGCTAAATTGCCTGATgcgc            >  1:818423/1‑52 (MQ=255) |                                                              CATCCGGCAAGGAACAGACAAACAGTTTCAAACGCTAAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATC  >  minE/431097‑431158

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑