Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	446951	447204	254	40 [0]	[0] 25	kdpD	fused sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with KdpE

AAAAAGGATCGGGCACGGTTTCCCGTACCTGAATTCCGGTGACGCCGCTGACCACATCATT  >  minE/447205‑447265 |                                                             aaaaaGGATCGGGCACGGTTTCCCGTACCTGAATTCCGGTGACGCCGCTGACCACATCAtt  <  1:1738440/61‑1 (MQ=255) aaaaaGGATCGGGCACGGTTTCCCGTACCTGAATTCCGGTGACGCCGCTGACCACATCAtt  <  1:874917/61‑1 (MQ=255) aaaaaGGATCGGGCACGGTTTCCCGTACCTGAATTCCGGTGACGCCGCTGACCACATCAtt  <  1:867476/61‑1 (MQ=255) aaaaaGGATCGGGCACGGTTTCCCGTACCTGAATTCCGGTGACGCCGCTGACCACATCAtt  <  1:803309/61‑1 (MQ=255) aaaaaGGATCGGGCACGGTTTCCCGTACCTGAATTCCGGTGACGCCGCTGACCACATCAtt  <  1:634623/61‑1 (MQ=255) aaaaaGGATCGGGCACGGTTTCCCGTACCTGAATTCCGGTGACGCCGCTGACCACATCAtt  <  1:471893/61‑1 (MQ=255) aaaaaGGATCGGGCACGGTTTCCCGTACCTGAATTCCGGTGACGCCGCTGACCACATCAtt  <  1:323596/61‑1 (MQ=255) aaaaaGGATCGGGCACGGTTTCCCGTACCTGAATTCCGGTGACGCCGCTGACCACATCAtt  <  1:299055/61‑1 (MQ=255) aaaaaGGATCGGGCACGGTTTCCCGTACCTGAATTCCGGTGACGCCGCTGACCACATCAtt  <  1:272462/61‑1 (MQ=255) aaaaaGGATCGGGCACGGTTTCCCGTACCTGAATTCCGGTGACGCCGCTGACCACATCAtt  <  1:262666/61‑1 (MQ=255) aaaaaGGATCGGGCACGGTTTCCCGTACCTGAATTCCGGTGACGCCGCTGACCACATCAtt  <  1:1883333/61‑1 (MQ=255) aaaaaGGATCGGGCACGGTTTCCCGTACCTGAATTCCGGTGACGCCGCTGACCACATCAtt  <  1:1780166/61‑1 (MQ=255) aaaaaGGATCGGGCACGGTTTCCCGTACCTGAATTCCGGTGACGCCGCTGACCACATCAtt  <  1:1739974/61‑1 (MQ=255) aaaaaGGATCGGGCACGGTTTCCCGTACCTGAATTCCGGTGACGCCGCTGACCACATCAtt  <  1:1064194/61‑1 (MQ=255) aaaaaGGATCGGGCACGGTTTCCCGTACCTGAATTCCGGTGACGCCGCTGACCACATCAtt  <  1:1719162/61‑1 (MQ=255) aaaaaGGATCGGGCACGGTTTCCCGTACCTGAATTCCGGTGACGCCGCTGACCACATCAtt  <  1:1709583/61‑1 (MQ=255) aaaaaGGATCGGGCACGGTTTCCCGTACCTGAATTCCGGTGACGCCGCTGACCACATCAtt  <  1:1685093/61‑1 (MQ=255) aaaaaGGATCGGGCACGGTTTCCCGTACCTGAATTCCGGTGACGCCGCTGACCACATCAtt  <  1:1683556/61‑1 (MQ=255) aaaaaGGATCGGGCACGGTTTCCCGTACCTGAATTCCGGTGACGCCGCTGACCACATCAtt  <  1:1651410/61‑1 (MQ=255) aaaaaGGATCGGGCACGGTTTCCCGTACCTGAATTCCGGTGACGCCGCTGACCACATCAtt  <  1:1574161/61‑1 (MQ=255) aaaaaGGATCGGGCACGGTTTCCCGTACCTGAATTCCGGTGACGCCGCTGACCACATCAtt  <  1:1535658/61‑1 (MQ=255) aaaaaGGATCGGGCACGGTTTCCCGTACCTGAATTCCGGTGACGCCGCTGACCACATCAtt  <  1:1467398/61‑1 (MQ=255) aaaaaGGATCGGGCACGGTTTCCCGTACCTGAATTCCGGTGACGCCGCTGACCACATCAtt  <  1:1420370/61‑1 (MQ=255) aaaaaGGATCGGGCACGGTTTCCCGTACCTGAATTCCGGTGACGCCGCTGACCACATCAtt  <  1:127496/61‑1 (MQ=255) aaaaaGGATCGGGCACGGTTTCCCGTACCTGAATTCCGGTGACGCCGCTGACCACATCAtt  <  1:1269839/61‑1 (MQ=255) |                                                             AAAAAGGATCGGGCACGGTTTCCCGTACCTGAATTCCGGTGACGCCGCTGACCACATCATT  >  minE/447205‑447265

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑