Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	452344	452544	201	122 [0]	[0] 67	phr	deoxyribodipyrimidine photolyase, FAD‑binding

GCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGCCATCCAT  >  minE/452545‑452594 |                                                  gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCTGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:1152373/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGTTCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:882011/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGcc              >  1:1545242/1‑38 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCt            >  1:164145/1‑40 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCt            >  1:1482077/1‑40 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:512240/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:639583/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:635452/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:556708/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:530064/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:524746/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:513313/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:735838/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:502965/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:496035/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:496007/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:445707/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:427786/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:410659/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:359435/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:703242/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:708601/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:28996/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:744340/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:745401/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:748162/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:750318/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:777192/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:845110/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:878980/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:921135/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:92221/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:931658/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:934368/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:99366/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:99503/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:1610566/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:1063039/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:108882/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:1168964/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:1170522/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:1174596/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:1174701/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:1198344/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:1225036/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:1247716/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:1302960/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:1305311/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:1406996/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:1574908/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:30823/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:1614403/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:1627669/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:1657037/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:1660684/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:1695656/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:1719696/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:1747807/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:1750308/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:176597/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:1849749/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:1852009/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:1878999/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:1000371/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatccat  >  1:292403/1‑50 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatcca   >  1:1357420/1‑49 (MQ=255) gCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGccatcca   >  1:1227432/1‑49 (MQ=255) |                                                  GCTGCGCCAAAAGTTCGTAGTAGCGGATCGATAGAGCCCTCGCCATCCAT  >  minE/452545‑452594

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑