Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	500676	500783	108	60 [0]	[0] 45	modE	DNA‑binding transcriptional dual regulator

CGTCACTTAACACATCAAAGGCTTTTTGCTGGATTTGCGCCAGTAAGTCATAGAGCTGAATC  >  minE/500784‑500845 |                                                              cGTCACTTAACACATCAAAGGCTTTTTGCTGGAttt                            >  1:1441712/1‑36 (MQ=255) cGTCACTTAACACATCAAAGGCTTTTTGCTGGATTTGCGCCAGTAAGTCATagag         >  1:524809/1‑55 (MQ=255) cGTCACTTAACACATCAAAGGCTTTTTGCTGGATTTGCGCCAGTAAGTCATAGAGCTGAATc  >  1:563179/1‑62 (MQ=255) cGTCACTTAACACATCAAAGGCTTTTTGCTGGATTTGCGCCAGTAAGTCATAGAGCTGAATc  >  1:270508/1‑62 (MQ=255) cGTCACTTAACACATCAAAGGCTTTTTGCTGGATTTGCGCCAGTAAGTCATAGAGCTGAATc  >  1:293843/1‑62 (MQ=255) cGTCACTTAACACATCAAAGGCTTTTTGCTGGATTTGCGCCAGTAAGTCATAGAGCTGAATc  >  1:346408/1‑62 (MQ=255) cGTCACTTAACACATCAAAGGCTTTTTGCTGGATTTGCGCCAGTAAGTCATAGAGCTGAATc  >  1:365933/1‑62 (MQ=255) cGTCACTTAACACATCAAAGGCTTTTTGCTGGATTTGCGCCAGTAAGTCATAGAGCTGAATc  >  1:375064/1‑62 (MQ=255) cGTCACTTAACACATCAAAGGCTTTTTGCTGGATTTGCGCCAGTAAGTCATAGAGCTGAATc  >  1:402201/1‑62 (MQ=255) cGTCACTTAACACATCAAAGGCTTTTTGCTGGATTTGCGCCAGTAAGTCATAGAGCTGAATc  >  1:420341/1‑62 (MQ=255) cGTCACTTAACACATCAAAGGCTTTTTGCTGGATTTGCGCCAGTAAGTCATAGAGCTGAATc  >  1:447584/1‑62 (MQ=255) cGTCACTTAACACATCAAAGGCTTTTTGCTGGATTTGCGCCAGTAAGTCATAGAGCTGAATc  >  1:516231/1‑62 (MQ=255) cGTCACTTAACACATCAAAGGCTTTTTGCTGGATTTGCGCCAGTAAGTCATAGAGCTGAATc  >  1:517897/1‑62 (MQ=255) cGTCACTTAACACATCAAAGGCTTTTTGCTGGATTTGCGCCAGTAAGTCATAGAGCTGAATc  >  1:1892884/1‑62 (MQ=255) cGTCACTTAACACATCAAAGGCTTTTTGCTGGATTTGCGCCAGTAAGTCATAGAGCTGAATc  >  1:584638/1‑62 (MQ=255) cGTCACTTAACACATCAAAGGCTTTTTGCTGGATTTGCGCCAGTAAGTCATAGAGCTGAATc  >  1:658292/1‑62 (MQ=255) cGTCACTTAACACATCAAAGGCTTTTTGCTGGATTTGCGCCAGTAAGTCATAGAGCTGAATc  >  1:716571/1‑62 (MQ=255) cGTCACTTAACACATCAAAGGCTTTTTGCTGGATTTGCGCCAGTAAGTCATAGAGCTGAATc  >  1:72122/1‑62 (MQ=255) cGTCACTTAACACATCAAAGGCTTTTTGCTGGATTTGCGCCAGTAAGTCATAGAGCTGAATc  >  1:722830/1‑62 (MQ=255) cGTCACTTAACACATCAAAGGCTTTTTGCTGGATTTGCGCCAGTAAGTCATAGAGCTGAATc  >  1:836595/1‑62 (MQ=255) cGTCACTTAACACATCAAAGGCTTTTTGCTGGATTTGCGCCAGTAAGTCATAGAGCTGAATc  >  1:904511/1‑62 (MQ=255) cGTCACTTAACACATCAAAGGCTTTTTGCTGGATTTGCGCCAGTAAGTCATAGAGCTGAATc  >  1:9107/1‑62 (MQ=255) cGTCACTTAACACATCAAAGGCTTTTTGCTGGATTTGCGCCAGTAAGTCATAGAGCTGAATc  >  1:962981/1‑62 (MQ=255) cGTCACTTAACACATCAAAGGCTTTTTGCTGGATTTGCGCCAGTAAGTCATAGAGCTGAATc  >  1:1544959/1‑62 (MQ=255) cGTCACTTAACACATCAAAGGCTTTTTGCTGGATTTGCGCCAGTAAGTCATAGAGCTGAATc  >  1:1182098/1‑62 (MQ=255) cGTCACTTAACACATCAAAGGCTTTTTGCTGGATTTGCGCCAGTAAGTCATAGAGCTGAATc  >  1:1241309/1‑62 (MQ=255) cGTCACTTAACACATCAAAGGCTTTTTGCTGGATTTGCGCCAGTAAGTCATAGAGCTGAATc  >  1:1278093/1‑62 (MQ=255) cGTCACTTAACACATCAAAGGCTTTTTGCTGGATTTGCGCCAGTAAGTCATAGAGCTGAATc  >  1:1326265/1‑62 (MQ=255) cGTCACTTAACACATCAAAGGCTTTTTGCTGGATTTGCGCCAGTAAGTCATAGAGCTGAATc  >  1:1356903/1‑62 (MQ=255) cGTCACTTAACACATCAAAGGCTTTTTGCTGGATTTGCGCCAGTAAGTCATAGAGCTGAATc  >  1:1408557/1‑62 (MQ=255) cGTCACTTAACACATCAAAGGCTTTTTGCTGGATTTGCGCCAGTAAGTCATAGAGCTGAATc  >  1:1428867/1‑62 (MQ=255) cGTCACTTAACACATCAAAGGCTTTTTGCTGGATTTGCGCCAGTAAGTCATAGAGCTGAATc  >  1:1453980/1‑62 (MQ=255) cGTCACTTAACACATCAAAGGCTTTTTGCTGGATTTGCGCCAGTAAGTCATAGAGCTGAATc  >  1:1476048/1‑62 (MQ=255) cGTCACTTAACACATCAAAGGCTTTTTGCTGGATTTGCGCCAGTAAGTCATAGAGCTGAATc  >  1:1526621/1‑62 (MQ=255) cGTCACTTAACACATCAAAGGCTTTTTGCTGGATTTGCGCCAGTAAGTCATAGAGCTGAATc  >  1:226835/1‑62 (MQ=255) cGTCACTTAACACATCAAAGGCTTTTTGCTGGATTTGCGCCAGTAAGTCATAGAGCTGAATc  >  1:1594641/1‑62 (MQ=255) cGTCACTTAACACATCAAAGGCTTTTTGCTGGATTTGCGCCAGTAAGTCATAGAGCTGAATc  >  1:1602957/1‑62 (MQ=255) cGTCACTTAACACATCAAAGGCTTTTTGCTGGATTTGCGCCAGTAAGTCATAGAGCTGAATc  >  1:1604779/1‑62 (MQ=255) cGTCACTTAACACATCAAAGGCTTTTTGCTGGATTTGCGCCAGTAAGTCATAGAGCTGAATc  >  1:1605347/1‑62 (MQ=255) cGTCACTTAACACATCAAAGGCTTTTTGCTGGATTTGCGCCAGTAAGTCATAGAGCTGAATc  >  1:1638526/1‑62 (MQ=255) cGTCACTTAACACATCAAAGGCTTTTTGCTGGATTTGCGCCAGTAAGTCATAGAGCTGAATc  >  1:1646381/1‑62 (MQ=255) cGTCACTTAACACATCAAAGGCTTTTTGCTGGATTTGCGCCAGTAAGTCATAGAGCTGAATc  >  1:1677434/1‑62 (MQ=255) cGTCACTTAACACATCAAAGGCTTTTTGCTGGATTTGCGCCAGTAAGTCATAGAGCTGAATc  >  1:1817755/1‑62 (MQ=255) cGTCACTTAACACATCAAAGGCTTTTTGCTGGATTTGCGCCAGTAAGTCATAGAGCTGAATc  >  1:188476/1‑62 (MQ=255) cGTCACTTAACACATCAAAGGCTTTTTGCTGGATTTGCGCCAGTAAGTCATAGAGCTGAATc  >  1:1090726/1‑62 (MQ=255) |                                                              CGTCACTTAACACATCAAAGGCTTTTTGCTGGATTTGCGCCAGTAAGTCATAGAGCTGAATC  >  minE/500784‑500845

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑